MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Frankia sp. EAN1pec chromosome

Total Repeats: 33295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009921	CCCG	2	8	32	39	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_009921	GACC	2	8	73	80	25 %	0 %	25 %	50 %	158311868
3	NC_009921	GCAG	2	8	160	167	25 %	0 %	50 %	25 %	158311868
4	NC_009921	GGCG	2	8	169	176	0 %	0 %	75 %	25 %	158311868
5	NC_009921	CGCT	2	8	446	453	0 %	25 %	25 %	50 %	158311868
6	NC_009921	GACG	2	8	527	534	25 %	0 %	50 %	25 %	158311868
7	NC_009921	TCCC	2	8	1496	1503	0 %	25 %	0 %	75 %	158311868
8	NC_009921	GGCC	2	8	2431	2438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009921	TCGG	2	8	2687	2694	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009921	AGCG	2	8	3211	3218	25 %	0 %	50 %	25 %	158311869
11	NC_009921	GGCC	2	8	4051	4058	0 %	0 %	50 %	50 %	158311870
12	NC_009921	GCGT	2	8	4422	4429	0 %	25 %	50 %	25 %	158311870
13	NC_009921	ACCG	2	8	4466	4473	25 %	0 %	25 %	50 %	158311870
14	NC_009921	CACC	2	8	5126	5133	25 %	0 %	0 %	75 %	158311871
15	NC_009921	GCCG	2	8	5889	5896	0 %	0 %	50 %	50 %	158311871
16	NC_009921	GGTC	2	8	6167	6174	0 %	25 %	50 %	25 %	158311871
17	NC_009921	CGGC	2	8	6210	6217	0 %	0 %	50 %	50 %	158311871
18	NC_009921	GCCA	2	8	6228	6235	25 %	0 %	25 %	50 %	158311871
19	NC_009921	CCGC	2	8	6838	6845	0 %	0 %	25 %	75 %	158311872
20	NC_009921	CGAC	2	8	6956	6963	25 %	0 %	25 %	50 %	158311872
21	NC_009921	GCGG	2	8	7411	7418	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009921	CCGA	2	8	8203	8210	25 %	0 %	25 %	50 %	158311873
23	NC_009921	CGGC	2	8	8873	8880	0 %	0 %	50 %	50 %	158311873
24	NC_009921	GGCC	2	8	9276	9283	0 %	0 %	50 %	50 %	158311873
25	NC_009921	AGCC	2	8	9513	9520	25 %	0 %	25 %	50 %	158311873
26	NC_009921	CCGG	2	8	9896	9903	0 %	0 %	50 %	50 %	158311874
27	NC_009921	CCCG	2	8	10070	10077	0 %	0 %	25 %	75 %	158311874
28	NC_009921	GCGG	2	8	10236	10243	0 %	0 %	75 %	25 %	158311874
29	NC_009921	GACC	2	8	11291	11298	25 %	0 %	25 %	50 %	158311874
30	NC_009921	GCCC	2	8	12356	12363	0 %	0 %	25 %	75 %	158311875
31	NC_009921	GTGG	2	8	12651	12658	0 %	25 %	75 %	0 %	158311875
32	NC_009921	GCGT	2	8	12698	12705	0 %	25 %	50 %	25 %	158311875
33	NC_009921	GTCC	2	8	12826	12833	0 %	25 %	25 %	50 %	158311875
34	NC_009921	CGGG	2	8	12980	12987	0 %	0 %	75 %	25 %	158311875
35	NC_009921	GCCA	2	8	13192	13199	25 %	0 %	25 %	50 %	158311875
36	NC_009921	GCCG	2	8	13200	13207	0 %	0 %	50 %	50 %	158311875
37	NC_009921	GCCC	2	8	13211	13218	0 %	0 %	25 %	75 %	158311875
38	NC_009921	CCGA	2	8	13260	13267	25 %	0 %	25 %	50 %	158311875
39	NC_009921	ACCC	2	8	13468	13475	25 %	0 %	0 %	75 %	158311875
40	NC_009921	ACCG	2	8	13590	13597	25 %	0 %	25 %	50 %	158311875
41	NC_009921	CGGC	2	8	13793	13800	0 %	0 %	50 %	50 %	158311875
42	NC_009921	GGCT	2	8	14115	14122	0 %	25 %	50 %	25 %	158311875
43	NC_009921	CGGG	2	8	14129	14136	0 %	0 %	75 %	25 %	158311875
44	NC_009921	GGCC	2	8	14825	14832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009921	TGCG	2	8	14929	14936	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009921	CGGG	2	8	15169	15176	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009921	AGGA	2	8	15300	15307	50 %	0 %	50 %	0 %	158311876
48	NC_009921	CCGG	2	8	15513	15520	0 %	0 %	50 %	50 %	158311876
49	NC_009921	CACG	2	8	15822	15829	25 %	0 %	25 %	50 %	158311876
50	NC_009921	GCCG	2	8	15962	15969	0 %	0 %	50 %	50 %	158311877
51	NC_009921	GGCC	2	8	16228	16235	0 %	0 %	50 %	50 %	158311877
52	NC_009921	GCCC	2	8	16374	16381	0 %	0 %	25 %	75 %	158311877
53	NC_009921	CCGG	2	8	16886	16893	0 %	0 %	50 %	50 %	158311877
54	NC_009921	CGTC	2	8	17156	17163	0 %	25 %	25 %	50 %	158311878
55	NC_009921	CTGC	2	8	17171	17178	0 %	25 %	25 %	50 %	158311878
56	NC_009921	GGCG	2	8	17543	17550	0 %	0 %	75 %	25 %	158311878
57	NC_009921	GCCG	2	8	18585	18592	0 %	0 %	50 %	50 %	158311879
58	NC_009921	GGCC	2	8	18933	18940	0 %	0 %	50 %	50 %	158311879
59	NC_009921	AGCG	2	8	19044	19051	25 %	0 %	50 %	25 %	158311879
60	NC_009921	CGTA	2	8	19212	19219	25 %	25 %	25 %	25 %	158311879
61	NC_009921	TCGC	2	8	19291	19298	0 %	25 %	25 %	50 %	158311879
62	NC_009921	GTCC	2	8	19465	19472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009921	CTGG	2	8	20271	20278	0 %	25 %	50 %	25 %	158311881
64	NC_009921	GTCG	2	8	20564	20571	0 %	25 %	50 %	25 %	158311881
65	NC_009921	CGGC	2	8	21500	21507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009921	CCGA	2	8	21610	21617	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009921	GGGC	2	8	21749	21756	0 %	0 %	75 %	25 %	158311883
68	NC_009921	CTGG	2	8	22072	22079	0 %	25 %	50 %	25 %	158311883
69	NC_009921	CCCA	2	8	22483	22490	25 %	0 %	0 %	75 %	158311883
70	NC_009921	CCGG	2	8	22664	22671	0 %	0 %	50 %	50 %	158311883
71	NC_009921	CGGG	2	8	23193	23200	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009921	GGCC	2	8	23309	23316	0 %	0 %	50 %	50 %	158311884
73	NC_009921	CAGG	2	8	23555	23562	25 %	0 %	50 %	25 %	158311884
74	NC_009921	CCGG	2	8	24279	24286	0 %	0 %	50 %	50 %	158311884
75	NC_009921	GGCG	2	8	24300	24307	0 %	0 %	75 %	25 %	158311884
76	NC_009921	CGCT	2	8	24345	24352	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009921	GCCG	2	8	25456	25463	0 %	0 %	50 %	50 %	158311886
78	NC_009921	CCGG	5	20	25750	25769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009921	TGGC	2	8	25854	25861	0 %	25 %	50 %	25 %	158311887
80	NC_009921	GCCG	2	8	26060	26067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009921	GTCC	2	8	26119	26126	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009921	CCCG	2	8	26259	26266	0 %	0 %	25 %	75 %	158311888
83	NC_009921	GACG	2	8	26456	26463	25 %	0 %	50 %	25 %	158311888
84	NC_009921	CGGC	2	8	27102	27109	0 %	0 %	50 %	50 %	158311889
85	NC_009921	GAGT	2	8	27346	27353	25 %	25 %	50 %	0 %	158311889
86	NC_009921	CGAG	2	8	27894	27901	25 %	0 %	50 %	25 %	158311889
87	NC_009921	GCCC	2	8	27979	27986	0 %	0 %	25 %	75 %	158311889
88	NC_009921	GTCG	2	8	28098	28105	0 %	25 %	50 %	25 %	158311889
89	NC_009921	CCGG	2	8	28526	28533	0 %	0 %	50 %	50 %	158311890
90	NC_009921	GGCC	2	8	28564	28571	0 %	0 %	50 %	50 %	158311890
91	NC_009921	CCGG	2	8	28577	28584	0 %	0 %	50 %	50 %	158311890
92	NC_009921	GCCG	2	8	28647	28654	0 %	0 %	50 %	50 %	158311890
93	NC_009921	CACC	2	8	29348	29355	25 %	0 %	0 %	75 %	158311890
94	NC_009921	CGGC	2	8	29428	29435	0 %	0 %	50 %	50 %	158311890
95	NC_009921	CCGC	2	8	30034	30041	0 %	0 %	25 %	75 %	158311891
96	NC_009921	CACC	2	8	30083	30090	25 %	0 %	0 %	75 %	158311891
97	NC_009921	GGCG	2	8	30197	30204	0 %	0 %	75 %	25 %	158311891
98	NC_009921	GCCG	2	8	30212	30219	0 %	0 %	50 %	50 %	158311891
99	NC_009921	GCTG	2	8	30601	30608	0 %	25 %	50 %	25 %	158311891
100	NC_009921	CCGG	2	8	30610	30617	0 %	0 %	50 %	50 %	158311891
101	NC_009921	GCCC	2	8	30695	30702	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_009921	CGGC	2	8	30771	30778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009921	CGGG	2	8	30844	30851	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_009921	GCGG	2	8	30855	30862	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009921	CGGG	2	8	30872	30879	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009921	GAGC	2	8	31200	31207	25 %	0 %	50 %	25 %	158311892
107	NC_009921	GACC	2	8	31511	31518	25 %	0 %	25 %	50 %	158311892
108	NC_009921	GCCT	2	8	32017	32024	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009921	CTCG	2	8	32120	32127	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009921	GCTT	2	8	32171	32178	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009921	TTGC	2	8	32621	32628	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009921	GAGT	2	8	32693	32700	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009921	GGCC	2	8	32996	33003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009921	GTGG	2	8	33534	33541	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009921	GCCG	2	8	33760	33767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009921	GTGC	2	8	34018	34025	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009921	CCGG	2	8	34595	34602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009921	CGGG	2	8	34614	34621	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009921	GCCT	2	8	34801	34808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009921	ACAT	2	8	34875	34882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009921	GCCG	2	8	34969	34976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009921	GGCT	2	8	35328	35335	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009921	CTAT	2	8	35508	35515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009921	TCTG	2	8	35543	35550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009921	GCCC	2	8	35936	35943	0 %	0 %	25 %	75 %	158311893
126	NC_009921	CTGG	2	8	36080	36087	0 %	25 %	50 %	25 %	158311894
127	NC_009921	GCCG	2	8	36088	36095	0 %	0 %	50 %	50 %	158311894
128	NC_009921	CAGT	2	8	36180	36187	25 %	25 %	25 %	25 %	158311894
129	NC_009921	CGGT	2	8	36640	36647	0 %	25 %	50 %	25 %	158311894
130	NC_009921	CGGG	2	8	36808	36815	0 %	0 %	75 %	25 %	158311894
131	NC_009921	ACGG	2	8	37110	37117	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009921	CCGG	2	8	37252	37259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009921	CGGG	3	12	37899	37910	0 %	0 %	75 %	25 %	158311896
134	NC_009921	GCGG	2	8	38077	38084	0 %	0 %	75 %	25 %	158311896
135	NC_009921	CGGC	2	8	38300	38307	0 %	0 %	50 %	50 %	158311896
136	NC_009921	GCCC	2	8	38675	38682	0 %	0 %	25 %	75 %	158311896
137	NC_009921	TTCA	2	8	38950	38957	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009921	CCGG	2	8	39121	39128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009921	GGCG	2	8	39685	39692	0 %	0 %	75 %	25 %	158311897
140	NC_009921	GGCG	2	8	39841	39848	0 %	0 %	75 %	25 %	158311897
141	NC_009921	GGAC	2	8	40293	40300	25 %	0 %	50 %	25 %	158311897
142	NC_009921	GCCG	2	8	40426	40433	0 %	0 %	50 %	50 %	158311897
143	NC_009921	GAGC	2	8	40618	40625	25 %	0 %	50 %	25 %	158311898
144	NC_009921	GCCT	2	8	40640	40647	0 %	25 %	25 %	50 %	158311898
145	NC_009921	CGGG	2	8	40747	40754	0 %	0 %	75 %	25 %	158311898
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