MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Frankia sp. EAN1pec chromosome

Total Repeats: 256906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009921	CGG	2	6	17	22	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009921	CCCG	2	8	32	39	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_009921	C	6	6	64	69	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_009921	GACC	2	8	73	80	25 %	0 %	25 %	50 %	158311868
5	NC_009921	CGG	2	6	147	152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311868
6	NC_009921	GCAG	2	8	160	167	25 %	0 %	50 %	25 %	158311868
7	NC_009921	GGCG	2	8	169	176	0 %	0 %	75 %	25 %	158311868
8	NC_009921	GGACG	2	10	181	190	20 %	0 %	60 %	20 %	158311868
9	NC_009921	CAG	2	6	200	205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311868
10	NC_009921	CG	3	6	206	211	0 %	0 %	50 %	50 %	158311868
11	NC_009921	GGCTGA	2	12	213	224	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158311868
12	NC_009921	GCT	2	6	256	261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311868
13	NC_009921	CGC	2	6	262	267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311868
14	NC_009921	CGG	3	9	433	441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311868
15	NC_009921	CGCT	2	8	446	453	0 %	25 %	25 %	50 %	158311868
16	NC_009921	GAG	2	6	485	490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158311868
17	NC_009921	CGAGG	2	10	494	503	20 %	0 %	60 %	20 %	158311868
18	NC_009921	CCG	2	6	505	510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311868
19	NC_009921	GACG	2	8	527	534	25 %	0 %	50 %	25 %	158311868
20	NC_009921	GGGTC	2	10	541	550	0 %	20 %	60 %	20 %	158311868
21	NC_009921	C	6	6	560	565	0 %	0 %	0 %	100 %	158311868
22	NC_009921	TCGCC	2	10	599	608	0 %	20 %	20 %	60 %	158311868
23	NC_009921	CGC	3	9	685	693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311868
24	NC_009921	CTG	2	6	773	778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311868
25	NC_009921	GGA	2	6	841	846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158311868
26	NC_009921	CGA	2	6	877	882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311868
27	NC_009921	TGG	2	6	930	935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158311868
28	NC_009921	AGG	2	6	972	977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158311868
29	NC_009921	TTC	2	6	980	985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158311868
30	NC_009921	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158311868
31	NC_009921	AGC	2	6	1050	1055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311868
32	NC_009921	CGC	2	6	1116	1121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311868
33	NC_009921	GAA	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158311868
34	NC_009921	GCC	2	6	1160	1165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311868
35	NC_009921	C	6	6	1183	1188	0 %	0 %	0 %	100 %	158311868
36	NC_009921	TGC	2	6	1317	1322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311868
37	NC_009921	CCG	2	6	1359	1364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311868
38	NC_009921	CAT	2	6	1369	1374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158311868
39	NC_009921	GGA	2	6	1408	1413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158311868
40	NC_009921	TCCC	2	8	1496	1503	0 %	25 %	0 %	75 %	158311868
41	NC_009921	CGG	2	6	1522	1527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311868
42	NC_009921	ACCAC	2	10	1533	1542	40 %	0 %	0 %	60 %	158311868
43	NC_009921	CG	3	6	1978	1983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009921	CG	3	6	2013	2018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009921	GGCCC	2	10	2112	2121	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
46	NC_009921	ACC	2	6	2159	2164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_009921	CGG	2	6	2170	2175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009921	CGT	2	6	2232	2237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009921	GCGGA	2	10	2291	2300	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009921	GCC	2	6	2307	2312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_009921	CG	3	6	2393	2398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009921	GGA	2	6	2411	2416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009921	GGCC	2	8	2431	2438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009921	CG	3	6	2455	2460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009921	GTCCG	2	10	2572	2581	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_009921	GAGTCC	2	12	2609	2620	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009921	TCGG	2	8	2687	2694	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009921	CGG	2	6	2717	2722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009921	GGGTG	2	10	2728	2737	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009921	GAA	2	6	2822	2827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009921	GCG	2	6	2848	2853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009921	TCG	2	6	2860	2865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009921	GT	3	6	2947	2952	0 %	50 %	50 %	0 %	158311869
64	NC_009921	TG	3	6	2959	2964	0 %	50 %	50 %	0 %	158311869
65	NC_009921	ATC	2	6	3016	3021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158311869
66	NC_009921	CTA	4	12	3105	3116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158311869
67	NC_009921	TCT	2	6	3126	3131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158311869
68	NC_009921	AG	3	6	3134	3139	50 %	0 %	50 %	0 %	158311869
69	NC_009921	AGCG	2	8	3211	3218	25 %	0 %	50 %	25 %	158311869
70	NC_009921	GCC	2	6	3250	3255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311869
71	NC_009921	CCG	2	6	3286	3291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311869
72	NC_009921	GTC	2	6	3299	3304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311869
73	NC_009921	CG	3	6	3439	3444	0 %	0 %	50 %	50 %	158311869
74	NC_009921	ACG	2	6	3527	3532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311869
75	NC_009921	GCGAA	2	10	3536	3545	40 %	0 %	40 %	20 %	158311869
76	NC_009921	GGT	2	6	3569	3574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158311869
77	NC_009921	GCG	3	9	3586	3594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311869
78	NC_009921	GGT	2	6	3596	3601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158311869
79	NC_009921	GTC	2	6	3731	3736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311869
80	NC_009921	ACC	2	6	3766	3771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158311869
81	NC_009921	CGC	2	6	3772	3777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311869
82	NC_009921	CGA	2	6	3841	3846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311869
83	NC_009921	GC	3	6	3855	3860	0 %	0 %	50 %	50 %	158311869
84	NC_009921	TCGGC	2	10	3870	3879	0 %	20 %	40 %	40 %	158311869
85	NC_009921	GAC	2	6	3936	3941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311869
86	NC_009921	GGA	2	6	3943	3948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158311869
87	NC_009921	GGCC	2	8	4051	4058	0 %	0 %	50 %	50 %	158311870
88	NC_009921	TGC	2	6	4059	4064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311870
89	NC_009921	CGC	2	6	4093	4098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311870
90	NC_009921	CGC	2	6	4114	4119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311870
91	NC_009921	TCG	3	9	4245	4253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311870
92	NC_009921	TGC	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311870
93	NC_009921	CGA	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311870
94	NC_009921	GCC	2	6	4312	4317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311870
95	NC_009921	GAC	2	6	4397	4402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311870
96	NC_009921	GCGT	2	8	4422	4429	0 %	25 %	50 %	25 %	158311870
97	NC_009921	CGC	2	6	4459	4464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311870
98	NC_009921	ACCG	2	8	4466	4473	25 %	0 %	25 %	50 %	158311870
99	NC_009921	ACC	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158311870
100	NC_009921	TGC	2	6	4713	4718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311870
101	NC_009921	TCG	2	6	4788	4793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311870
102	NC_009921	ACC	2	6	4833	4838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158311870
103	NC_009921	CGG	2	6	4858	4863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311870
104	NC_009921	GC	3	6	4956	4961	0 %	0 %	50 %	50 %	158311870
105	NC_009921	CGC	2	6	5005	5010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311870
106	NC_009921	GCG	2	6	5049	5054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311870
107	NC_009921	CTG	2	6	5087	5092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311870
108	NC_009921	CACC	2	8	5126	5133	25 %	0 %	0 %	75 %	158311871
109	NC_009921	ACG	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311871
110	NC_009921	TCG	2	6	5251	5256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311871
111	NC_009921	TGT	2	6	5321	5326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158311871
112	NC_009921	GGCCCG	2	12	5423	5434	0 %	0 %	50 %	50 %	158311871
113	NC_009921	GGA	2	6	5474	5479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158311871
114	NC_009921	GCG	3	9	5510	5518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311871
115	NC_009921	CGA	2	6	5525	5530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311871
116	NC_009921	CTG	2	6	5532	5537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311871
117	NC_009921	CG	3	6	5540	5545	0 %	0 %	50 %	50 %	158311871
118	NC_009921	GGC	2	6	5558	5563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311871
119	NC_009921	AGC	2	6	5593	5598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311871
120	NC_009921	CGG	2	6	5617	5622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311871
121	NC_009921	GCC	2	6	5625	5630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311871
122	NC_009921	GCT	2	6	5705	5710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311871
123	NC_009921	GAG	2	6	5733	5738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158311871
124	NC_009921	CGC	2	6	5765	5770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311871
125	NC_009921	GCCG	2	8	5889	5896	0 %	0 %	50 %	50 %	158311871
126	NC_009921	CGG	2	6	5957	5962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311871
127	NC_009921	CGG	2	6	6074	6079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311871
128	NC_009921	GCG	2	6	6093	6098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311871
129	NC_009921	CGG	2	6	6127	6132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311871
130	NC_009921	GGTC	2	8	6167	6174	0 %	25 %	50 %	25 %	158311871
131	NC_009921	CTG	2	6	6189	6194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311871
132	NC_009921	CGGC	2	8	6210	6217	0 %	0 %	50 %	50 %	158311871
133	NC_009921	GCCA	2	8	6228	6235	25 %	0 %	25 %	50 %	158311871
134	NC_009921	CG	3	6	6291	6296	0 %	0 %	50 %	50 %	158311871
135	NC_009921	GAC	2	6	6297	6302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311871
136	NC_009921	TGC	3	9	6313	6321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311871
137	NC_009921	CGA	2	6	6323	6328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311871
138	NC_009921	GC	4	8	6356	6363	0 %	0 %	50 %	50 %	158311871
139	NC_009921	CGC	2	6	6368	6373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311871
140	NC_009921	CGG	2	6	6409	6414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311871
141	NC_009921	CGG	2	6	6430	6435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311871
142	NC_009921	GGT	2	6	6458	6463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158311871
143	NC_009921	GTGCC	2	10	6476	6485	0 %	20 %	40 %	40 %	158311871
144	NC_009921	CG	3	6	6517	6522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009921	CG	3	6	6540	6545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009921	CGG	2	6	6563	6568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_009921	TCG	2	6	6577	6582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_009921	CG	3	6	6717	6722	0 %	0 %	50 %	50 %	158311872
149	NC_009921	CG	3	6	6735	6740	0 %	0 %	50 %	50 %	158311872
150	NC_009921	GAC	2	6	6750	6755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311872
151	NC_009921	GGCGG	2	10	6766	6775	0 %	0 %	80 %	20 %	158311872
152	NC_009921	GCG	2	6	6785	6790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311872
153	NC_009921	CGT	2	6	6811	6816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311872
154	NC_009921	CCGC	2	8	6838	6845	0 %	0 %	25 %	75 %	158311872
155	NC_009921	GC	3	6	6844	6849	0 %	0 %	50 %	50 %	158311872
156	NC_009921	CGC	2	6	6867	6872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311872
157	NC_009921	GCCGG	2	10	6873	6882	0 %	0 %	60 %	40 %	158311872
158	NC_009921	TTCGG	2	10	6904	6913	0 %	40 %	40 %	20 %	158311872
159	NC_009921	CG	3	6	6918	6923	0 %	0 %	50 %	50 %	158311872
160	NC_009921	TCG	2	6	6926	6931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311872
161	NC_009921	CGAC	2	8	6956	6963	25 %	0 %	25 %	50 %	158311872
162	NC_009921	TGG	2	6	6992	6997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158311872
163	NC_009921	CGT	2	6	7143	7148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311872
164	NC_009921	CGG	2	6	7194	7199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311872
165	NC_009921	GGC	2	6	7213	7218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311872
166	NC_009921	GC	3	6	7399	7404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
167	NC_009921	GCGG	2	8	7411	7418	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
168	NC_009921	CGG	2	6	7497	7502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_009921	ACG	2	6	7562	7567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311873
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172	NC_009921	CGG	2	6	7743	7748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311873
173	NC_009921	AAG	2	6	7801	7806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158311873
174	NC_009921	CAC	2	6	7830	7835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158311873
175	NC_009921	CGG	2	6	7845	7850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311873
176	NC_009921	GGT	2	6	7882	7887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158311873
177	NC_009921	CGGCGT	2	12	7893	7904	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158311873
178	NC_009921	CGT	2	6	7908	7913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311873
179	NC_009921	GAA	2	6	8025	8030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158311873
180	NC_009921	ACC	2	6	8077	8082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158311873
181	NC_009921	ACGGAG	2	12	8179	8190	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158311873
182	NC_009921	GGC	2	6	8193	8198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311873
183	NC_009921	CCGA	2	8	8203	8210	25 %	0 %	25 %	50 %	158311873
184	NC_009921	TCG	2	6	8246	8251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311873
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192	NC_009921	GC	3	6	8730	8735	0 %	0 %	50 %	50 %	158311873
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200	NC_009921	CTG	2	6	9127	9132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311873
201	NC_009921	TCG	2	6	9152	9157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311873
202	NC_009921	GGCC	2	8	9276	9283	0 %	0 %	50 %	50 %	158311873
203	NC_009921	ACC	2	6	9355	9360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158311873
204	NC_009921	CGA	2	6	9399	9404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311873
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208	NC_009921	AGCC	2	8	9513	9520	25 %	0 %	25 %	50 %	158311873
209	NC_009921	CGG	2	6	9594	9599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
210	NC_009921	GCCCG	2	10	9661	9670	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
211	NC_009921	C	6	6	9732	9737	0 %	0 %	0 %	100 %	158311874
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241	NC_009921	CTG	2	6	10881	10886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311874
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245	NC_009921	GCC	2	6	11023	11028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311874
246	NC_009921	CAT	2	6	11051	11056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158311874
247	NC_009921	CGA	2	6	11057	11062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311874
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249	NC_009921	GC	3	6	11075	11080	0 %	0 %	50 %	50 %	158311874
250	NC_009921	CCTCG	2	10	11105	11114	0 %	20 %	20 %	60 %	158311874
251	NC_009921	ATC	2	6	11133	11138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158311874
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253	NC_009921	CGA	2	6	11174	11179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311874
254	NC_009921	GCG	2	6	11180	11185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311874
255	NC_009921	CGT	3	9	11246	11254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311874
256	NC_009921	CGG	2	6	11267	11272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311874
257	NC_009921	GACC	2	8	11291	11298	25 %	0 %	25 %	50 %	158311874
258	NC_009921	GCG	2	6	11317	11322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311874
259	NC_009921	GCG	2	6	11340	11345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311874
260	NC_009921	GAC	2	6	11355	11360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311874
261	NC_009921	TCG	2	6	11362	11367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311874
262	NC_009921	CTT	2	6	11372	11377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158311874
263	NC_009921	ACG	3	9	11382	11390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311874
264	NC_009921	CAC	2	6	11391	11396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158311874
265	NC_009921	GCT	2	6	11399	11404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311874
266	NC_009921	TTC	2	6	11406	11411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158311874
267	NC_009921	CAA	2	6	11414	11419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158311874
268	NC_009921	GCA	2	6	11480	11485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311874
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292	NC_009921	GTGAC	2	10	12230	12239	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
293	NC_009921	GGC	2	6	12247	12252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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392	NC_009921	GCC	2	6	15557	15562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311876
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