MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Frankia sp. EAN1pec chromosome

Total Repeats: 256906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009921	CTAT	2	8	35508	35515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_009921	TCTG	2	8	35543	35550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_009921	GT	3	6	35560	35565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_009921	GGC	2	6	35580	35585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_009921	ATT	2	6	35608	35613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158311893
1006	NC_009921	CTG	2	6	35651	35656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311893
1007	NC_009921	GAGAT	2	10	35703	35712	40 %	20 %	40 %	0 %	158311893
1008	NC_009921	GGC	2	6	35849	35854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311893
1009	NC_009921	CGT	2	6	35872	35877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311893
1010	NC_009921	GCCC	2	8	35936	35943	0 %	0 %	25 %	75 %	158311893
1011	NC_009921	GCC	2	6	35946	35951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311893
1012	NC_009921	GGC	3	9	35968	35976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311893
1013	NC_009921	CAA	2	6	36024	36029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_009921	CCAGG	2	10	36059	36068	20 %	0 %	40 %	40 %	158311894
1015	NC_009921	CTGG	2	8	36080	36087	0 %	25 %	50 %	25 %	158311894
1016	NC_009921	GCCG	2	8	36088	36095	0 %	0 %	50 %	50 %	158311894
1017	NC_009921	GCG	2	6	36139	36144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311894
1018	NC_009921	CAGT	2	8	36180	36187	25 %	25 %	25 %	25 %	158311894
1019	NC_009921	GGA	2	6	36209	36214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158311894
1020	NC_009921	GCG	2	6	36256	36261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311894
1021	NC_009921	GTCGAC	2	12	36321	36332	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158311894
1022	NC_009921	CA	3	6	36398	36403	50 %	0 %	0 %	50 %	158311894
1023	NC_009921	GAT	2	6	36411	36416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158311894
1024	NC_009921	CGA	2	6	36543	36548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311894
1025	NC_009921	CGC	2	6	36601	36606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311894
1026	NC_009921	GGT	2	6	36629	36634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158311894
1027	NC_009921	CGGT	2	8	36640	36647	0 %	25 %	50 %	25 %	158311894
1028	NC_009921	GTT	2	6	36698	36703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158311894
1029	NC_009921	AGA	2	6	36771	36776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158311894
1030	NC_009921	CGGG	2	8	36808	36815	0 %	0 %	75 %	25 %	158311894
1031	NC_009921	TCC	2	6	36841	36846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158311894
1032	NC_009921	TGG	2	6	36886	36891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158311894
1033	NC_009921	GGC	2	6	36896	36901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311894
1034	NC_009921	ATC	2	6	36963	36968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158311894
1035	NC_009921	TCT	2	6	36971	36976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_009921	ACGG	2	8	37110	37117	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_009921	ACG	2	6	37152	37157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_009921	ACT	2	6	37159	37164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_009921	CCGG	2	8	37252	37259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_009921	GA	3	6	37271	37276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_009921	CGG	2	6	37320	37325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311895
1042	NC_009921	TCC	2	6	37339	37344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158311895
1043	NC_009921	CGG	2	6	37374	37379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311895
1044	NC_009921	TTG	3	9	37396	37404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158311895
1045	NC_009921	CGG	2	6	37414	37419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311895
1046	NC_009921	CGG	2	6	37465	37470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311895
1047	NC_009921	GAG	2	6	37529	37534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158311895
1048	NC_009921	CG	3	6	37538	37543	0 %	0 %	50 %	50 %	158311895
1049	NC_009921	GTG	2	6	37557	37562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158311895
1050	NC_009921	CGGCG	2	10	37712	37721	0 %	0 %	60 %	40 %	158311895
1051	NC_009921	CACGG	2	10	37727	37736	20 %	0 %	40 %	40 %	158311895
1052	NC_009921	GCC	2	6	37748	37753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311895
1053	NC_009921	GGC	2	6	37795	37800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311895
1054	NC_009921	TCG	2	6	37826	37831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311895
1055	NC_009921	CGGGAC	2	12	37844	37855	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158311895
1056	NC_009921	CGG	2	6	37872	37877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311896
1057	NC_009921	CGGG	3	12	37899	37910	0 %	0 %	75 %	25 %	158311896
1058	NC_009921	GCT	2	6	37966	37971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311896
1059	NC_009921	CAC	2	6	37999	38004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158311896
1060	NC_009921	GCT	2	6	38017	38022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311896
1061	NC_009921	ACCGC	2	10	38037	38046	20 %	0 %	20 %	60 %	158311896
1062	NC_009921	GCT	2	6	38062	38067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311896
1063	NC_009921	GCGG	2	8	38077	38084	0 %	0 %	75 %	25 %	158311896
1064	NC_009921	CGG	2	6	38145	38150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311896
1065	NC_009921	GGC	2	6	38164	38169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311896
1066	NC_009921	CTC	2	6	38237	38242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158311896
1067	NC_009921	TCG	2	6	38271	38276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311896
1068	NC_009921	CGGC	2	8	38300	38307	0 %	0 %	50 %	50 %	158311896
1069	NC_009921	TGG	2	6	38327	38332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158311896
1070	NC_009921	ACC	2	6	38397	38402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158311896
1071	NC_009921	CGG	2	6	38408	38413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311896
1072	NC_009921	CTT	2	6	38419	38424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158311896
1073	NC_009921	TCC	2	6	38501	38506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158311896
1074	NC_009921	CCGACC	2	12	38537	38548	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158311896
1075	NC_009921	GCC	2	6	38565	38570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311896
1076	NC_009921	CTC	2	6	38573	38578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158311896
1077	NC_009921	CGG	2	6	38584	38589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311896
1078	NC_009921	GTC	2	6	38594	38599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311896
1079	NC_009921	C	6	6	38611	38616	0 %	0 %	0 %	100 %	158311896
1080	NC_009921	CGC	2	6	38668	38673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311896
1081	NC_009921	GCCC	2	8	38675	38682	0 %	0 %	25 %	75 %	158311896
1082	NC_009921	GCA	2	6	38700	38705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311896
1083	NC_009921	GCC	2	6	38745	38750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311896
1084	NC_009921	CCG	2	6	38751	38756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311896
1085	NC_009921	ACC	2	6	38758	38763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158311896
1086	NC_009921	GGACGA	2	12	38773	38784	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158311896
1087	NC_009921	CAC	2	6	38796	38801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158311896
1088	NC_009921	CCG	2	6	38821	38826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311896
1089	NC_009921	CCG	2	6	38846	38851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_009921	TAC	2	6	38852	38857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_009921	GCC	2	6	38859	38864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_009921	TTCA	2	8	38950	38957	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_009921	ACC	2	6	38990	38995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_009921	CGT	2	6	39008	39013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_009921	CAT	2	6	39038	39043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_009921	CCGG	2	8	39121	39128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_009921	GC	3	6	39138	39143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_009921	GCCTTC	2	12	39180	39191	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_009921	CTG	2	6	39211	39216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_009921	TCC	2	6	39222	39227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_009921	GGA	2	6	39276	39281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_009921	TCC	2	6	39322	39327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_009921	GCG	2	6	39370	39375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_009921	GCC	2	6	39462	39467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_009921	CGC	3	9	39477	39485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_009921	GCA	2	6	39516	39521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_009921	GTC	2	6	39540	39545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_009921	CGG	2	6	39651	39656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311897
1109	NC_009921	GGCG	2	8	39685	39692	0 %	0 %	75 %	25 %	158311897
1110	NC_009921	CCG	2	6	39739	39744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311897
1111	NC_009921	GC	3	6	39753	39758	0 %	0 %	50 %	50 %	158311897
1112	NC_009921	GCG	2	6	39762	39767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311897
1113	NC_009921	CGG	3	9	39769	39777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311897
1114	NC_009921	GAT	2	6	39785	39790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158311897
1115	NC_009921	GT	3	6	39813	39818	0 %	50 %	50 %	0 %	158311897
1116	NC_009921	GGCG	2	8	39841	39848	0 %	0 %	75 %	25 %	158311897
1117	NC_009921	GCG	2	6	39882	39887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311897
1118	NC_009921	TCTGC	2	10	39959	39968	0 %	40 %	20 %	40 %	158311897
1119	NC_009921	TCC	2	6	39998	40003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158311897
1120	NC_009921	CGG	2	6	40189	40194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311897
1121	NC_009921	GTG	2	6	40206	40211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158311897
1122	NC_009921	GCC	2	6	40217	40222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311897
1123	NC_009921	GAC	2	6	40226	40231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311897
1124	NC_009921	GGAC	2	8	40293	40300	25 %	0 %	50 %	25 %	158311897
1125	NC_009921	GCCGGC	2	12	40339	40350	0 %	0 %	50 %	50 %	158311897
1126	NC_009921	AGA	2	6	40383	40388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158311897
1127	NC_009921	TCC	2	6	40389	40394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158311897
1128	NC_009921	CGG	2	6	40396	40401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311897
1129	NC_009921	GGT	2	6	40406	40411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158311897
1130	NC_009921	GCCCG	2	10	40413	40422	0 %	0 %	40 %	60 %	158311897
1131	NC_009921	GCCG	2	8	40426	40433	0 %	0 %	50 %	50 %	158311897
1132	NC_009921	GGA	2	6	40460	40465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158311897
1133	NC_009921	CGA	2	6	40543	40548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311898
1134	NC_009921	CGT	2	6	40612	40617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311898
1135	NC_009921	GAGC	2	8	40618	40625	25 %	0 %	50 %	25 %	158311898
1136	NC_009921	GCCT	2	8	40640	40647	0 %	25 %	25 %	50 %	158311898
1137	NC_009921	GGT	2	6	40688	40693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158311898
1138	NC_009921	GCGAGG	2	12	40698	40709	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158311898
1139	NC_009921	GTC	2	6	40721	40726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311898
1140	NC_009921	CTG	2	6	40735	40740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311898
1141	NC_009921	CGGG	2	8	40747	40754	0 %	0 %	75 %	25 %	158311898
1142	NC_009921	CTG	2	6	40775	40780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311898
1143	NC_009921	GCCG	2	8	40804	40811	0 %	0 %	50 %	50 %	158311898
1144	NC_009921	GCCA	2	8	40830	40837	25 %	0 %	25 %	50 %	158311898
1145	NC_009921	G	7	7	40868	40874	0 %	0 %	100 %	0 %	158311898
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1149	NC_009921	CGG	2	6	40998	41003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311898
1150	NC_009921	CGAACG	2	12	41029	41040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311898
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1154	NC_009921	GAT	2	6	41192	41197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158311898
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1164	NC_009921	CGG	2	6	41708	41713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1165	NC_009921	TCG	2	6	41739	41744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1168	NC_009921	GCT	2	6	41846	41851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1171	NC_009921	TCC	2	6	41948	41953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1173	NC_009921	CTG	2	6	42055	42060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1174	NC_009921	GGATC	2	10	42082	42091	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1243	NC_009921	CCG	2	6	44802	44807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1244	NC_009921	GCA	2	6	44830	44835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1245	NC_009921	CTG	2	6	44866	44871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1246	NC_009921	CGCC	2	8	44877	44884	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1247	NC_009921	CGG	2	6	44932	44937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1248	NC_009921	AGC	2	6	45019	45024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1249	NC_009921	GC	3	6	45042	45047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1250	NC_009921	TCCG	2	8	45070	45077	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1251	NC_009921	GGC	2	6	45092	45097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1252	NC_009921	TCAG	2	8	45109	45116	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1253	NC_009921	CTG	2	6	45127	45132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1254	NC_009921	GCG	2	6	45133	45138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1255	NC_009921	CGG	2	6	45143	45148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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