MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Fervidobacterium nodosum Rt17-B1 chromosome

Total Repeats: 777

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009718	TTCAAA	2	12	8	19	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009718	TATTGA	2	12	4158	4169	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	154248709
3	NC_009718	ATTCCA	2	12	4291	4302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154248709
4	NC_009718	AGGTAT	2	12	5405	5416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154248710
5	NC_009718	ATGTTG	2	12	5560	5571	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	154248710
6	NC_009718	AAGATT	2	12	9946	9957	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	154248715
7	NC_009718	CCTCTA	2	12	18665	18676	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	154248723
8	NC_009718	GAAAAA	2	12	20160	20171	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	154248726
9	NC_009718	AGGATT	2	12	20621	20632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154248727
10	NC_009718	CTTGCG	2	12	25030	25041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154248729
11	NC_009718	TATGTT	2	12	25663	25674	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	154248729
12	NC_009718	TTATGT	2	12	26604	26615	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	154248729
13	NC_009718	AATTCA	2	12	28916	28927	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	154248730
14	NC_009718	TCATTC	2	12	32693	32704	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009718	TTTGAG	2	12	34135	34146	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	154248734
16	NC_009718	TTCCCT	2	12	39497	39508	0 %	50 %	0 %	50 %	154248739
17	NC_009718	TTTTAG	2	12	41690	41701	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009718	CTGCTT	2	12	42733	42744	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	154248741
19	NC_009718	TTTTCC	2	12	45212	45223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154248743
20	NC_009718	TGGAGA	2	12	46929	46940	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	154248746
21	NC_009718	CACTCT	2	12	49764	49775	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	154248750
22	NC_009718	ATAAGA	2	12	58911	58922	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	154248756
23	NC_009718	GACCAG	2	12	60842	60853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154248758
24	NC_009718	ACCAGA	2	12	64570	64581	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009718	AAATTT	2	12	66891	66902	50 %	50 %	0 %	0 %	154248762
26	NC_009718	TTTTAG	2	12	67904	67915	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	154248763
27	NC_009718	TGAGAA	2	12	75926	75937	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	154248768
28	NC_009718	ATGATA	2	12	83138	83149	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	154248775
29	NC_009718	AAGTTT	2	12	83589	83600	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	154248775
30	NC_009718	TTTGAG	2	12	85110	85121	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	154248777
31	NC_009718	ATAAGA	2	12	88755	88766	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	154248781
32	NC_009718	ATCAAA	2	12	92517	92528	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	154248784
33	NC_009718	ATGAAA	2	12	93519	93530	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	154248785
34	NC_009718	ATGTGG	2	12	95928	95939	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	154248787
35	NC_009718	GCAAAG	2	12	97063	97074	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	154248789
36	NC_009718	TAAGAT	2	12	104160	104171	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	154248799
37	NC_009718	TTCTAA	2	12	105628	105639	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	154248801
38	NC_009718	TGATTA	2	12	106357	106368	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	154248802
39	NC_009718	ATGGAA	2	12	110815	110826	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	154248805
40	NC_009718	TGAAGA	2	12	111866	111877	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	154248807
41	NC_009718	TGATGG	2	12	112421	112432	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	154248807
42	NC_009718	ATTGAA	2	12	113010	113021	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	154248808
43	NC_009718	TCAAAA	2	12	113552	113563	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	154248808
44	NC_009718	AGATTG	2	12	113676	113687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154248809
45	NC_009718	AAGCTA	2	12	117737	117748	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	154248814
46	NC_009718	CATTTC	2	12	135149	135160	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	154248833
47	NC_009718	ATGTAT	2	12	135239	135250	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	154248834
48	NC_009718	CACCTA	2	12	141698	141709	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	154248838
49	NC_009718	AGATGT	2	12	145102	145113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154248841
50	NC_009718	TAACTG	2	12	145599	145610	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	154248841
51	NC_009718	TGCCTG	2	12	147339	147350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154248843
52	NC_009718	AACGTA	2	12	147746	147757	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	154248844
53	NC_009718	AATATC	2	12	152219	152230	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	154248848
54	NC_009718	AAAAAT	2	12	158145	158156	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	154248855
55	NC_009718	TTTCTT	2	12	159416	159427	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	154248856
56	NC_009718	TGAAAG	2	12	159567	159578	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	154248856
57	NC_009718	TATAAC	2	12	159613	159624	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	154248856
58	NC_009718	ATGTAT	2	12	159758	159769	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	154248856
59	NC_009718	ATCAAA	2	12	160178	160189	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	154248856
60	NC_009718	TTGGAA	2	12	160503	160514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154248856
61	NC_009718	TTTAAT	2	12	161491	161502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154248856
62	NC_009718	GAATAC	2	12	165210	165221	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	154248860
63	NC_009718	CTTTGC	2	12	168715	168726	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	154248863
64	NC_009718	CAATTT	2	12	169603	169614	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	154248864
65	NC_009718	AGTATA	2	12	172168	172179	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	154248866
66	NC_009718	TTTTCA	2	12	179669	179680	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154248874
67	NC_009718	AGGTAA	2	12	180406	180417	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	154248876
68	NC_009718	GCGGAT	2	12	192846	192857	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	154248887
69	NC_009718	TCTCTG	2	12	195942	195953	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	154248891
70	NC_009718	CCTAAG	2	12	197870	197881	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	154248893
71	NC_009718	CAAGTA	2	12	198683	198694	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	154248894
72	NC_009718	ACCTCC	2	12	199664	199675	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_009718	TTGCGA	2	12	201180	201191	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	154248895
74	NC_009718	TTGTAT	2	12	201279	201290	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	154248895
75	NC_009718	ATGTAT	2	12	201441	201452	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	154248895
76	NC_009718	ATTAAA	2	12	208657	208668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154248903
77	NC_009718	TTTATC	2	12	210860	210871	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154248905
78	NC_009718	ATCTTC	2	12	212149	212160	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	154248906
79	NC_009718	ACGTTG	2	12	212731	212742	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	154248907
80	NC_009718	CCACCG	2	12	212956	212967	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	154248907
81	NC_009718	TCGTAT	2	12	218921	218932	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	154248914
82	NC_009718	TTTCAA	2	12	220915	220926	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	154248916
83	NC_009718	TATGAA	2	12	223924	223935	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	154248919
84	NC_009718	CCTGGA	2	12	224000	224011	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	154248919
85	NC_009718	TACTTG	2	12	228146	228157	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	154248921
86	NC_009718	ATTATG	2	12	231007	231018	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	154248923
87	NC_009718	CTATCT	2	12	231019	231030	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	154248923
88	NC_009718	TATTTC	2	12	231541	231552	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154248924
89	NC_009718	CCACCG	2	12	231758	231769	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	154248924
90	NC_009718	GGTCTT	2	12	234147	234158	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	154248925
91	NC_009718	TTTTTA	2	12	235090	235101	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	154248925
92	NC_009718	TAATTG	2	12	235901	235912	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009718	ACATCC	2	12	239506	239517	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	154248929
94	NC_009718	ATCAAA	2	12	239956	239967	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	154248930
95	NC_009718	GTTAGA	2	12	246918	246929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154248937
96	NC_009718	ATAGGT	2	12	247848	247859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154248937
97	NC_009718	TCTGTT	2	12	250641	250652	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	154248941
98	NC_009718	TGAGGA	2	12	251087	251098	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	154248942
99	NC_009718	AAAGTC	2	12	252005	252016	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	154248943
100	NC_009718	ATACAC	2	12	259316	259327	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	154248949
101	NC_009718	AAAAGC	2	12	261395	261406	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	154248951
102	NC_009718	TATTTC	2	12	263242	263253	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154248952
103	NC_009718	CACTAA	2	12	263517	263528	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009718	CAATAA	2	12	267982	267993	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	154248955
105	NC_009718	TGTAAC	2	12	271058	271069	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	154248957
106	NC_009718	TTCAAC	2	12	271438	271449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154248958
107	NC_009718	CATATT	2	12	275515	275526	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	154248961
108	NC_009718	TGCCTA	2	12	275568	275579	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	154248961
109	NC_009718	AATGAT	2	12	276736	276747	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	154248962
110	NC_009718	GAGTAA	2	12	282944	282955	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	154248965
111	NC_009718	AAAGAT	2	12	282956	282967	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	154248965
112	NC_009718	AGAGAT	2	12	283223	283234	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	154248965
113	NC_009718	CTTCTC	2	12	283609	283620	0 %	50 %	0 %	50 %	154248965
114	NC_009718	AGACCG	2	12	286540	286551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154248966
115	NC_009718	CTATTC	2	12	289679	289690	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	154248969
116	NC_009718	TCAAAA	2	12	292799	292810	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	154248972
117	NC_009718	CAACGG	2	12	297829	297840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154248977
118	NC_009718	ATGGTT	2	12	299262	299273	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	154248979
119	NC_009718	TGAGTT	2	12	300816	300827	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	154248980
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466	NC_009718	CGTAAG	2	12	1171594	1171605	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	154249750
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469	NC_009718	AAGGGA	2	12	1178883	1178894	50 %	0 %	50 %	0 %	154249758
470	NC_009718	TGCCGC	2	12	1180268	1180279	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	154249759
471	NC_009718	GAAAGT	2	12	1183822	1183833	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	154249763
472	NC_009718	AAGAAA	2	12	1185556	1185567	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	154249763
473	NC_009718	AACGTC	2	12	1185913	1185924	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	154249763
474	NC_009718	AATTCG	2	12	1193887	1193898	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	154249774
475	NC_009718	GTTGGT	2	12	1195095	1195106	0 %	50 %	50 %	0 %	154249777
476	NC_009718	TTTTCA	2	12	1198882	1198893	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154249779
477	NC_009718	ATTTTT	2	12	1202792	1202803	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	154249782
478	NC_009718	TTCAAA	2	12	1207346	1207357	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
479	NC_009718	TAGTTC	2	12	1209295	1209306	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	154249789
480	NC_009718	TACCTG	2	12	1212396	1212407	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	154249795
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493	NC_009718	CGTATT	2	12	1237033	1237044	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	154249829
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498	NC_009718	TCAAGT	2	12	1252751	1252762	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	154249846
499	NC_009718	ATTTTC	2	12	1257845	1257856	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154249849
500	NC_009718	AGCAAA	2	12	1260157	1260168	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	154249850

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