MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Flavobacterium psychrophilum JIP02/86 complete genome

Total Repeats: 1780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009613	TAAATT	2	12	317	328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009613	GTAGAA	2	12	1259	1270	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150026517
3	NC_009613	GTAAAA	2	12	2663	2674	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150026517
4	NC_009613	TGAATT	2	12	5672	5683	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150026521
5	NC_009613	AAGCGG	2	12	6219	6230	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	150026521
6	NC_009613	AAAAGA	2	12	6612	6623	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150026521
7	NC_009613	TTGGAG	2	12	7337	7348	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	150026522
8	NC_009613	AAAAAG	2	12	8201	8212	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150026524
9	NC_009613	ACCTTG	2	12	8586	8597	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150026525
10	NC_009613	TCAGCT	2	12	8611	8622	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150026525
11	NC_009613	AAGAAA	2	12	13009	13020	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150024115
12	NC_009613	GGCGAA	2	12	14457	14468	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	150024115
13	NC_009613	AAAATT	2	12	15255	15266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150024116
14	NC_009613	AAAAGA	2	12	16680	16691	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150024117
15	NC_009613	AATTAC	2	12	17619	17630	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150024118
16	NC_009613	AATTTC	2	12	17908	17919	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150024118
17	NC_009613	CTACAG	2	12	21505	21516	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150024120
18	NC_009613	GTAACG	2	12	21774	21785	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150024120
19	NC_009613	GCTACT	2	12	21969	21980	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150024120
20	NC_009613	GTAACG	2	12	22005	22016	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150024120
21	NC_009613	TACTTC	2	12	22238	22249	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	150024120
22	NC_009613	CAATAC	2	12	23673	23684	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150024121
23	NC_009613	AAGAAA	2	12	24819	24830	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150024121
24	NC_009613	CTTTTA	2	12	27037	27048	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150024123
25	NC_009613	AGCAGA	2	12	33627	33638	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	150024129
26	NC_009613	GCCGAT	2	12	34066	34077	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150024129
27	NC_009613	GATGCC	2	12	34177	34188	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150024129
28	NC_009613	AGCCGA	2	12	34329	34340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150024129
29	NC_009613	GATGCC	2	12	34393	34404	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150024129
30	NC_009613	AGCCGA	2	12	34437	34448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150024129
31	NC_009613	GATGCC	2	12	34501	34512	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150024129
32	NC_009613	AGCCGA	2	12	34605	34616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150024129
33	NC_009613	AGCCGA	2	12	34653	34664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150024129
34	NC_009613	AGCCGA	2	12	34761	34772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150024129
35	NC_009613	GCCGAT	2	12	34822	34833	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150024129
36	NC_009613	AGCCGA	2	12	34869	34880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150024129
37	NC_009613	GCCGAT	2	12	34930	34941	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150024129
38	NC_009613	AGCCGA	2	12	34977	34988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150024129
39	NC_009613	GATGCC	2	12	35041	35052	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150024129
40	NC_009613	AGCCGA	2	12	35085	35096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150024129
41	NC_009613	GATGCC	2	12	35149	35160	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150024129
42	NC_009613	GATGCC	2	12	35257	35268	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150024129
43	NC_009613	GATGCC	2	12	35365	35376	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150024129
44	NC_009613	AGCCGA	2	12	35469	35480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150024129
45	NC_009613	CAAAAG	2	12	35654	35665	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	150024129
46	NC_009613	CTGGAG	2	12	36935	36946	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	150024130
47	NC_009613	TTATAC	2	12	39090	39101	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150024130
48	NC_009613	ACGGTA	2	12	40117	40128	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150024130
49	NC_009613	ACATAT	2	12	41398	41409	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150024130
50	NC_009613	ATACTT	2	12	41576	41587	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150024130
51	NC_009613	TCCAAT	2	12	42183	42194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150024130
52	NC_009613	TTATAC	2	12	42930	42941	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150024130
53	NC_009613	ACTGCT	2	12	43582	43593	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150024130
54	NC_009613	TAGTGC	2	12	44046	44057	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150024130
55	NC_009613	TATAGT	2	12	44794	44805	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150024130
56	NC_009613	AGGGCC	2	12	45297	45308	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	150024130
57	NC_009613	AGATTA	2	12	49243	49254	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150024133
58	NC_009613	CATTAA	2	12	51844	51855	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150024135
59	NC_009613	AAATGT	2	12	55685	55696	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150024137
60	NC_009613	TTTTAA	2	12	59775	59786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150024141
61	NC_009613	ATTTTG	2	12	61544	61555	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150024141
62	NC_009613	TGATAT	2	12	62283	62294	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150024141
63	NC_009613	AGAAAT	2	12	62430	62441	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150024141
64	NC_009613	AAGAAA	2	12	63232	63243	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150024142
65	NC_009613	TAGGAA	2	12	63637	63648	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150024144
66	NC_009613	TTATAA	2	12	64316	64327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009613	ACCATG	2	12	68817	68828	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150024149
68	NC_009613	ACAAAA	2	12	70580	70591	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	150024150
69	NC_009613	CTAATT	2	12	72580	72591	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150024153
70	NC_009613	ATATCG	2	12	75936	75947	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150024157
71	NC_009613	ATCAGT	2	12	76987	76998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150024158
72	NC_009613	TACAGA	2	12	78004	78015	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150024159
73	NC_009613	TAAAAA	2	12	78249	78260	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150024159
74	NC_009613	TTTAAA	2	12	78331	78342	50 %	50 %	0 %	0 %	150024159
75	NC_009613	TTAAAA	2	12	80177	80188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150024162
76	NC_009613	ATTTAG	2	12	89306	89317	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150024171
77	NC_009613	TATTTT	2	12	89929	89940	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	150024171
78	NC_009613	CTATTG	2	12	90073	90084	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150024172
79	NC_009613	GATTTA	2	12	91293	91304	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	511542233
80	NC_009613	TTTCAT	2	12	93391	93402	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150024175
81	NC_009613	TTCTAC	2	12	93603	93614	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	150024176
82	NC_009613	CATAAA	2	12	93984	93995	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150024176
83	NC_009613	TGAAGC	2	12	96099	96110	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150024177
84	NC_009613	GTTTGC	2	12	96158	96169	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	150024177
85	NC_009613	TAATTT	2	12	99319	99330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150024180
86	NC_009613	ATAGAG	2	12	99499	99510	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150024181
87	NC_009613	TTTTGC	2	12	103028	103039	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	150024185
88	NC_009613	TTCGTT	2	12	105461	105472	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	150024186
89	NC_009613	TCCTTT	2	12	105695	105706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150024186
90	NC_009613	CTTTTT	2	12	106000	106011	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	150024186
91	NC_009613	ATTGCT	2	12	109689	109700	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150024190
92	NC_009613	TTTATA	2	12	112381	112392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009613	TACTTT	2	12	115710	115721	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150024194
94	NC_009613	TTAATT	2	12	115821	115832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009613	AAAATT	2	12	116129	116140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150024195
96	NC_009613	GCTACC	2	12	116456	116467	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	150024195
97	NC_009613	TAAATT	2	12	118308	118319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009613	TTTCGA	2	12	119374	119385	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150024197
99	NC_009613	CTATTA	2	12	122906	122917	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150024200
100	NC_009613	AATTTA	2	12	123020	123031	50 %	50 %	0 %	0 %	150024200
101	NC_009613	ATCTTT	2	12	125695	125706	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150024200
102	NC_009613	CAGATA	2	12	126364	126375	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150024201
103	NC_009613	AATATT	2	12	127006	127017	50 %	50 %	0 %	0 %	150024203
104	NC_009613	ATCTTA	2	12	129919	129930	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_009613	TTTAAA	2	12	129980	129991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009613	TTTTAA	2	12	134272	134283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009613	TAAAAT	2	12	135001	135012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150024209
108	NC_009613	TACCTA	2	12	135235	135246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150024209
109	NC_009613	TTCGAT	2	12	137289	137300	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150024211
110	NC_009613	GGCTTT	2	12	141423	141434	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	150024213
111	NC_009613	CTGTTA	2	12	146081	146092	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150024219
112	NC_009613	ATTTTT	2	12	146215	146226	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	150024220
113	NC_009613	GATACC	2	12	149949	149960	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150024223
114	NC_009613	GTCGAA	2	12	150564	150575	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150024223
115	NC_009613	TTAAAA	2	12	151050	151061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150024223
116	NC_009613	AAAAAC	2	12	151683	151694	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_009613	TAATTT	2	12	153127	153138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150024224
118	NC_009613	GCTCGT	2	12	157084	157095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150024226
119	NC_009613	GAAAAA	2	12	158520	158531	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150024228
120	NC_009613	AAAACA	2	12	158839	158850	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_009613	TCTTTA	2	12	158937	158948	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150024229
122	NC_009613	CTTTAT	2	12	160905	160916	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150024233
123	NC_009613	TACAGG	2	12	161485	161496	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150024233
124	NC_009613	TGTTGG	2	12	162748	162759	0 %	50 %	50 %	0 %	150024234
125	NC_009613	TCGGTT	2	12	163753	163764	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	150024236
126	NC_009613	AATTCG	2	12	164818	164829	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150024237
127	NC_009613	ATTTTA	2	12	165043	165054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150024237
128	NC_009613	TCATTT	2	12	169843	169854	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150024241
129	NC_009613	TAACAA	2	12	170823	170834	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150024242
130	NC_009613	TTCCAA	2	12	172683	172694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150024244
131	NC_009613	ATTCCT	2	12	172847	172858	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	150024244
132	NC_009613	AGTAAT	2	12	174927	174938	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150024245
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139	NC_009613	TTTTTA	2	12	183870	183881	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009613	GTTTAC	2	12	185073	185084	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150024256
141	NC_009613	CTTTCT	2	12	190221	190232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150024258
142	NC_009613	TTTGAA	2	12	191993	192004	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009613	GCAGAA	2	12	195224	195235	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	150024262
144	NC_009613	TTAAAA	2	12	196072	196083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009613	GAAACC	2	12	196640	196651	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	150024263
146	NC_009613	TTTTTA	2	12	197547	197558	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009613	AAATAG	2	12	198002	198013	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150024264
148	NC_009613	AATATA	2	12	201166	201177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009613	TCCGTC	2	12	201829	201840	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	150024266
150	NC_009613	TCCGTC	2	12	201910	201921	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	150024266
151	NC_009613	TCCATC	2	12	201991	202002	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	150024266
152	NC_009613	ATAACG	2	12	203474	203485	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150024267
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189	NC_009613	TAAAAT	2	12	267997	268008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_009613	TACAAA	2	12	274480	274491	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150024332
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218	NC_009613	GGCTTT	2	12	309758	309769	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	150024358
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220	NC_009613	AAATTG	2	12	310668	310679	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150024359
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226	NC_009613	GTAAAT	2	12	323242	323253	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
227	NC_009613	AAATCG	2	12	324205	324216	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150024371
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229	NC_009613	AATAAA	2	12	326322	326333	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_009613	TTAAAT	2	12	326486	326497	50 %	50 %	0 %	0 %	150024372
231	NC_009613	GAAGTA	2	12	328930	328941	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150024375
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233	NC_009613	ATGTCT	2	12	334317	334328	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150024378
234	NC_009613	ACTGCA	2	12	334623	334634	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150024378
235	NC_009613	CTTAAT	2	12	336548	336559	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150024379
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237	NC_009613	TTTCAA	2	12	340613	340624	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150024382
238	NC_009613	CAAAAA	2	12	341165	341176	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	150024383
239	NC_009613	TCGTGG	2	12	345584	345595	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	150024387
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241	NC_009613	AATTTA	2	12	351735	351746	50 %	50 %	0 %	0 %	150024389
242	NC_009613	AATTAA	2	12	353929	353940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_009613	TCTTGT	2	12	354303	354314	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
244	NC_009613	TTTCAT	2	12	355103	355114	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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246	NC_009613	TGTTGC	2	12	355434	355445	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
247	NC_009613	TTGAAT	2	12	356228	356239	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_009613	CCAATT	2	12	362105	362116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150024396
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266	NC_009613	TAGTTG	2	12	394277	394288	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_009613	TTTTAA	2	12	751318	751329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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