MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Fusobacterium nucleatum subsp. polymorphum ATCC 10953 plasmid pFN3

Total Repeats: 200

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009506	TGA	2	6	14	19	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009506	TTA	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009506	TAT	2	6	40	45	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009506	CTT	2	6	294	299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009506	CTA	2	6	303	308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009506	GAA	2	6	319	324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009506	ATA	2	6	352	357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009506	TAT	2	6	371	376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009506	TTA	2	6	387	392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009506	CAG	2	6	415	420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009506	ATT	2	6	495	500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009506	ATT	2	6	524	529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009506	TAA	2	6	534	539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009506	TTA	3	9	678	686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009506	AAT	2	6	731	736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009506	TTA	2	6	747	752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009506	ACC	2	6	763	768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_009506	ACT	3	9	887	895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009506	GTA	5	15	905	919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009506	TAT	2	6	932	937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009506	ATA	2	6	948	953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009506	ATA	2	6	1006	1011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009506	ATA	2	6	1028	1033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009506	ATA	2	6	1060	1065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009506	TAG	2	6	1094	1099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009506	ATA	2	6	1115	1120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009506	ATA	2	6	1146	1151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009506	TAA	2	6	1157	1162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009506	TAT	2	6	1178	1183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009506	TAT	2	6	1233	1238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009506	ATA	2	6	1246	1251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009506	TAT	2	6	1276	1281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009506	ATA	2	6	1290	1295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009506	GAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
35	NC_009506	GAT	3	9	1327	1335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557804
36	NC_009506	TTA	2	6	1358	1363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557804
37	NC_009506	TAC	2	6	1397	1402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148557804
38	NC_009506	ATA	2	6	1445	1450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557804
39	NC_009506	TAA	2	6	1454	1459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557804
40	NC_009506	AGA	2	6	1461	1466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
41	NC_009506	ACA	2	6	1613	1618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148557804
42	NC_009506	TTC	2	6	1751	1756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557804
43	NC_009506	AGA	2	6	1830	1835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
44	NC_009506	AGT	2	6	1872	1877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557804
45	NC_009506	TAA	2	6	1980	1985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557804
46	NC_009506	AGA	3	9	2013	2021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
47	NC_009506	ATA	2	6	2044	2049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557804
48	NC_009506	GAA	2	6	2095	2100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
49	NC_009506	GAA	2	6	2197	2202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
50	NC_009506	GAT	3	9	2242	2250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557804
51	NC_009506	AGA	2	6	2289	2294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
52	NC_009506	AGA	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
53	NC_009506	TTC	2	6	2412	2417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557804
54	NC_009506	GAA	3	9	2434	2442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
55	NC_009506	AGT	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557804
56	NC_009506	AAG	2	6	2699	2704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
57	NC_009506	AGA	3	9	2736	2744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
58	NC_009506	GTT	2	6	2779	2784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148557804
59	NC_009506	GAA	2	6	2806	2811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
60	NC_009506	CTT	2	6	2839	2844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557804
61	NC_009506	AGA	2	6	2886	2891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
62	NC_009506	ATT	2	6	2904	2909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557804
63	NC_009506	AGA	2	6	2952	2957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
64	NC_009506	CGA	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148557804
65	NC_009506	ATA	3	9	3019	3027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009506	TAT	2	6	3090	3095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557805
67	NC_009506	TGT	2	6	3107	3112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148557805
68	NC_009506	TTC	2	6	3187	3192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557805
69	NC_009506	TAT	2	6	3277	3282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557805
70	NC_009506	ATT	2	6	3344	3349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557805
71	NC_009506	ATT	2	6	3358	3363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557805
72	NC_009506	CTT	2	6	3370	3375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557805
73	NC_009506	ATT	2	6	3408	3413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009506	TTA	2	6	3580	3585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009506	AAT	2	6	3703	3708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009506	GTA	2	6	3726	3731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009506	TAA	2	6	3785	3790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557806
78	NC_009506	TCT	2	6	3858	3863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009506	GAG	2	6	3883	3888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009506	TTA	2	6	3996	4001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009506	TTA	3	9	4286	4294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009506	AAT	2	6	4342	4347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009506	ACT	3	9	4496	4504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009506	GTA	5	15	4514	4528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009506	AAT	2	6	4550	4555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009506	ATA	2	6	4563	4568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009506	ATA	2	6	4574	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009506	ATT	2	6	4693	4698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009506	TAA	2	6	4811	4816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009506	ATG	2	6	4921	4926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557807
91	NC_009506	CTT	2	6	5052	5057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557807
92	NC_009506	AAT	2	6	5309	5314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557807
93	NC_009506	AAT	2	6	5349	5354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557807
94	NC_009506	GAA	2	6	5496	5501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
95	NC_009506	TAA	2	6	5543	5548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557807
96	NC_009506	GAA	2	6	5571	5576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
97	NC_009506	ATT	2	6	5583	5588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557807
98	NC_009506	AGA	2	6	5617	5622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
99	NC_009506	TAA	2	6	5669	5674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557807
100	NC_009506	ATG	2	6	5683	5688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557807
101	NC_009506	GAA	2	6	5697	5702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
102	NC_009506	AGA	2	6	5723	5728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
103	NC_009506	ATA	2	6	5776	5781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557807
104	NC_009506	AGA	3	9	5822	5830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
105	NC_009506	GAA	2	6	5841	5846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
106	NC_009506	GAA	2	6	5943	5948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
107	NC_009506	TAA	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557807
108	NC_009506	AGA	2	6	6065	6070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
109	NC_009506	ATT	2	6	6108	6113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557807
110	NC_009506	CAA	2	6	6149	6154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148557807
111	NC_009506	AGA	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
112	NC_009506	AGA	2	6	6248	6253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
113	NC_009506	TAT	2	6	6344	6349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557807
114	NC_009506	AGA	2	6	6383	6388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
115	NC_009506	GGA	2	6	6408	6413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148557807
116	NC_009506	AGA	2	6	6428	6433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
117	NC_009506	ATA	2	6	6456	6461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557807
118	NC_009506	AGA	2	6	6476	6481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
119	NC_009506	GAA	3	9	6489	6497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
120	NC_009506	GAA	3	9	6519	6527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
121	NC_009506	TAT	2	6	6567	6572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557807
122	NC_009506	GTT	2	6	6575	6580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148557807
123	NC_009506	AGA	3	9	6680	6688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
124	NC_009506	AGA	2	6	6722	6727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
125	NC_009506	GAA	4	12	6729	6740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
126	NC_009506	TAT	2	6	6771	6776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009506	TAT	2	6	6840	6845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557808
128	NC_009506	TGT	2	6	6857	6862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148557808
129	NC_009506	TTC	2	6	6937	6942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557808
130	NC_009506	TAT	2	6	7027	7032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557808
131	NC_009506	ATT	2	6	7094	7099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557808
132	NC_009506	ATT	2	6	7108	7113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557808
133	NC_009506	TAA	2	6	7409	7414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009506	AAT	2	6	7518	7523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009506	GAA	2	6	7570	7575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557809
136	NC_009506	AAG	2	6	7596	7601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557809
137	NC_009506	AGA	2	6	7695	7700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557809
138	NC_009506	ACA	2	6	7708	7713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148557809
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178	NC_009506	ATA	2	6	9818	9823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557810
179	NC_009506	AGA	2	6	9918	9923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557810
180	NC_009506	GAA	3	9	10030	10038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557810
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182	NC_009506	TAT	2	6	10281	10286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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200	NC_009506	AAC	2	6	11782	11787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148557814

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.