MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis WY96-3418 chromosome

Total Repeats: 28286

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009257	TTA	2	6	26	31	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009257	CAA	2	6	221	226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134301170
3	NC_009257	ATT	2	6	253	258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301170
4	NC_009257	TAA	2	6	267	272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301170
5	NC_009257	CAA	2	6	338	343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134301170
6	NC_009257	AGA	2	6	366	371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134301170
7	NC_009257	AGT	2	6	378	383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301170
8	NC_009257	AAG	2	6	403	408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134301170
9	NC_009257	TCA	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134301170
10	NC_009257	AGA	2	6	480	485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134301170
11	NC_009257	TGT	2	6	540	545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134301170
12	NC_009257	AGC	2	6	570	575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134301170
13	NC_009257	TGG	2	6	630	635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134301170
14	NC_009257	ATT	2	6	709	714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301170
15	NC_009257	TTA	2	6	734	739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301170
16	NC_009257	GAA	2	6	952	957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134301170
17	NC_009257	CAG	2	6	1079	1084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134301170
18	NC_009257	TAC	2	6	1149	1154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134301170
19	NC_009257	CTA	2	6	1178	1183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134301170
20	NC_009257	ATA	2	6	1247	1252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301170
21	NC_009257	GTT	2	6	1261	1266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134301170
22	NC_009257	AAG	2	6	1311	1316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134301170
23	NC_009257	TGG	2	6	1404	1409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134301170
24	NC_009257	GAT	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301170
25	NC_009257	TAT	2	6	1643	1648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301171
26	NC_009257	ATA	3	9	1670	1678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301171
27	NC_009257	TAA	2	6	1857	1862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301171
28	NC_009257	CAA	2	6	1951	1956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134301171
29	NC_009257	TCA	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134301171
30	NC_009257	TAT	2	6	1968	1973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301171
31	NC_009257	ATG	2	6	2000	2005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301171
32	NC_009257	CTA	2	6	2053	2058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134301171
33	NC_009257	AGA	2	6	2193	2198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134301171
34	NC_009257	ATA	2	6	2315	2320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301171
35	NC_009257	ATT	2	6	2361	2366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301171
36	NC_009257	TAA	2	6	2445	2450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301171
37	NC_009257	GAA	2	6	2560	2565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134301171
38	NC_009257	ATA	2	6	2624	2629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301171
39	NC_009257	ATT	2	6	2638	2643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301171
40	NC_009257	TAA	2	6	2663	2668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009257	AGT	3	9	2779	2787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009257	TAA	2	6	2791	2796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009257	CAC	2	6	2925	2930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_009257	TGA	2	6	2969	2974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009257	ATA	2	6	2981	2986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009257	ACC	2	6	3049	3054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_009257	GAA	2	6	3086	3091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009257	TAT	2	6	3167	3172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301172
49	NC_009257	ATA	2	6	3251	3256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301172
50	NC_009257	TAG	2	6	3329	3334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301172
51	NC_009257	ATG	2	6	3347	3352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301172
52	NC_009257	CAA	2	6	3455	3460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134301172
53	NC_009257	CTT	3	9	3463	3471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134301172
54	NC_009257	CTT	2	6	3705	3710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134301172
55	NC_009257	CTT	2	6	3730	3735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134301172
56	NC_009257	GAT	2	6	3760	3765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301172
57	NC_009257	AAC	2	6	3878	3883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134301172
58	NC_009257	CTT	2	6	3934	3939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134301172
59	NC_009257	ATG	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301172
60	NC_009257	TTA	2	6	3991	3996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009257	CAA	2	6	4065	4070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009257	ATG	2	6	4127	4132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009257	GTT	2	6	4162	4167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009257	AGT	2	6	4186	4191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009257	TAC	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009257	AAC	2	6	4263	4268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009257	ATC	2	6	4333	4338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009257	GCA	2	6	4493	4498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009257	TAT	2	6	4520	4525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009257	TAA	2	6	4534	4539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009257	TAG	2	6	4572	4577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009257	TAA	2	6	4619	4624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009257	ATA	2	6	4762	4767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009257	ATT	2	6	4818	4823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301173
75	NC_009257	AGT	2	6	4846	4851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301173
76	NC_009257	TTG	2	6	4862	4867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134301173
77	NC_009257	TGG	3	9	4878	4886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134301173
78	NC_009257	CTG	2	6	4889	4894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134301173
79	NC_009257	ATG	2	6	4979	4984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301173
80	NC_009257	GTT	2	6	5026	5031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134301173
81	NC_009257	GTA	2	6	5036	5041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301173
82	NC_009257	CAA	2	6	5054	5059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134301173
83	NC_009257	TTG	2	6	5272	5277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134301174
84	NC_009257	TGG	3	9	5291	5299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134301174
85	NC_009257	ATT	2	6	5323	5328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301174
86	NC_009257	ATA	2	6	5389	5394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301174
87	NC_009257	CTA	2	6	5458	5463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134301174
88	NC_009257	CTA	2	6	5515	5520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134301174
89	NC_009257	TCA	2	6	5562	5567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134301174
90	NC_009257	CTT	2	6	5605	5610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134301174
91	NC_009257	AAT	2	6	5650	5655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301175
92	NC_009257	CAG	2	6	5703	5708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134301175
93	NC_009257	TTG	2	6	5709	5714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134301175
94	NC_009257	TAA	2	6	5829	5834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301175
95	NC_009257	CTG	2	6	5973	5978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134301175
96	NC_009257	TAA	2	6	6113	6118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301176
97	NC_009257	TCT	2	6	6200	6205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134301176
98	NC_009257	GTG	2	6	6271	6276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134301176
99	NC_009257	TGG	2	6	6371	6376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134301176
100	NC_009257	GCT	2	6	6519	6524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134301176
101	NC_009257	TAC	2	6	6560	6565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134301176
102	NC_009257	CTG	2	6	6589	6594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134301176
103	NC_009257	AGC	2	6	6611	6616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134301176
104	NC_009257	TAG	2	6	6709	6714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301176
105	NC_009257	TAT	2	6	6746	6751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301176
106	NC_009257	TCC	2	6	6758	6763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134301176
107	NC_009257	AAG	2	6	6906	6911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134301176
108	NC_009257	GTT	2	6	6960	6965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134301176
109	NC_009257	TGG	2	6	7103	7108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134301176
110	NC_009257	TGA	2	6	7318	7323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301176
111	NC_009257	TCA	3	9	7358	7366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134301176
112	NC_009257	ACA	2	6	7418	7423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134301176
113	NC_009257	AGA	2	6	7490	7495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134301176
114	NC_009257	GAA	2	6	7621	7626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134301177
115	NC_009257	AGC	2	6	7633	7638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134301177
116	NC_009257	TGA	2	6	7671	7676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301177
117	NC_009257	AAC	2	6	7701	7706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134301177
118	NC_009257	AGA	2	6	7839	7844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134301177
119	NC_009257	ATG	2	6	7901	7906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301177
120	NC_009257	CTT	2	6	7909	7914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134301177
121	NC_009257	GAT	2	6	7915	7920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301177
122	NC_009257	GAA	2	6	7924	7929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134301177
123	NC_009257	ATA	2	6	8048	8053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301177
124	NC_009257	ACA	2	6	8179	8184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134301177
125	NC_009257	ATT	2	6	8214	8219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301177
126	NC_009257	ATA	2	6	8270	8275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301177
127	NC_009257	AGA	2	6	8433	8438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134301177
128	NC_009257	CTG	2	6	8840	8845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134301177
129	NC_009257	GAT	2	6	8908	8913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301177
130	NC_009257	ATA	2	6	8940	8945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301177
131	NC_009257	ATA	2	6	8994	8999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009257	TGG	2	6	9062	9067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134301178
133	NC_009257	TGA	2	6	9137	9142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301178
134	NC_009257	CTA	2	6	9264	9269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134301178
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136	NC_009257	CTA	2	6	9312	9317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134301178
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247	NC_009257	TAT	2	6	16200	16205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_009257	TAG	2	6	16370	16375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
250	NC_009257	ATA	2	6	16775	16780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_009257	ATA	2	6	16805	16810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_009257	ACT	2	6	16915	16920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_009257	GCT	2	6	17008	17013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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255	NC_009257	TGG	2	6	17115	17120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
256	NC_009257	TAA	2	6	17157	17162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_009257	AGC	2	6	17214	17219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_009257	GCT	2	6	17233	17238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_009257	TGA	2	6	17268	17273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
260	NC_009257	CAC	2	6	17303	17308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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262	NC_009257	AAT	2	6	17338	17343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_009257	ACA	2	6	17366	17371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_009257	ATA	2	6	17592	17597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301182
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291	NC_009257	TAA	2	6	20294	20299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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