MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Francisella novicida U112 chromosome

Total Repeats: 952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008601	CAAGAT	2	12	865	876	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118496616
2	NC_008601	TATTTC	2	12	2964	2975	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	118496618
3	NC_008601	CAGGTA	2	12	5148	5159	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118496619
4	NC_008601	ATTTAT	2	12	6983	6994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496621
5	NC_008601	GCTACA	2	12	7584	7595	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118496622
6	NC_008601	TTAGCA	2	12	12202	12213	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118496629
7	NC_008601	TTTATT	2	12	12609	12620	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118496629
8	NC_008601	CTTTTT	2	12	14772	14783	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	118496632
9	NC_008601	TCTAGT	2	12	17802	17813	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118496634
10	NC_008601	CTAAAA	2	12	21362	21373	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118496635
11	NC_008601	ACCAAT	2	12	23387	23398	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	118496637
12	NC_008601	ATAAGT	2	12	28010	28021	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008601	TATCAA	2	12	29914	29925	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118496644
14	NC_008601	TAAATT	2	12	31954	31965	50 %	50 %	0 %	0 %	118496646
15	NC_008601	TTAAGA	2	12	38669	38680	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008601	CTTATA	2	12	38840	38851	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_008601	AATTTT	2	12	38876	38887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008601	TTGAGC	2	12	40422	40433	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118496653
19	NC_008601	GGTTTA	2	12	41448	41459	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118496655
20	NC_008601	TTCAAA	2	12	45056	45067	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118496656
21	NC_008601	GATATG	2	12	47086	47097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496657
22	NC_008601	TGCAAA	2	12	47633	47644	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118496658
23	NC_008601	AAATAG	2	12	52544	52555	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118496661
24	NC_008601	ACAGTA	2	12	52919	52930	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118496661
25	NC_008601	AATAAA	2	12	63730	63741	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	118496667
26	NC_008601	TAAAAA	2	12	64072	64083	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	118496668
27	NC_008601	AGGTCA	2	12	64482	64493	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118496669
28	NC_008601	TTAATT	2	12	65695	65706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008601	CTTGAG	2	12	72517	72528	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118496676
30	NC_008601	ATCAAT	2	12	76068	76079	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118496679
31	NC_008601	TGTCAG	2	12	80618	80629	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118496681
32	NC_008601	AATACC	2	12	80862	80873	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	118496681
33	NC_008601	CTGATA	2	12	81128	81139	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118496681
34	NC_008601	AGCTGG	2	12	85671	85682	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118496688
35	NC_008601	AGCCAA	2	12	89015	89026	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	118496693
36	NC_008601	TTTAAA	2	12	93051	93062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008601	ATAATT	2	12	93263	93274	50 %	50 %	0 %	0 %	118496698
38	NC_008601	ATTGAT	2	12	93526	93537	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118496698
39	NC_008601	AAGTTT	2	12	99290	99301	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118496702
40	NC_008601	ATAATT	2	12	101332	101343	50 %	50 %	0 %	0 %	118496705
41	NC_008601	ATATTT	2	12	102639	102650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008601	AATGGC	2	12	104430	104441	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118496707
43	NC_008601	TTAAGG	2	12	105096	105107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496708
44	NC_008601	TAAAAA	2	12	106408	106419	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	118496710
45	NC_008601	TTATGT	2	12	108170	108181	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118496712
46	NC_008601	AAGGAT	2	12	108712	108723	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118496712
47	NC_008601	TAAATA	2	12	111645	111656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496716
48	NC_008601	GTTATT	2	12	113226	113237	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118496717
49	NC_008601	CTTGAG	2	12	114483	114494	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118496718
50	NC_008601	AGCACC	2	12	114529	114540	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	118496718
51	NC_008601	TCAATT	2	12	121957	121968	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	118496725
52	NC_008601	TAAGAG	2	12	129593	129604	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118496733
53	NC_008601	TGGTTT	2	12	130025	130036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496733
54	NC_008601	TAAAGG	2	12	131368	131379	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118496735
55	NC_008601	GTTGAT	2	12	132459	132470	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118496737
56	NC_008601	TTATAA	2	12	144976	144987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008601	TTGAGA	2	12	146459	146470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496748
58	NC_008601	TTTTAG	2	12	146687	146698	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118496748
59	NC_008601	TTAGGC	2	12	147316	147327	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118496748
60	NC_008601	TATTTT	2	12	150555	150566	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118496752
61	NC_008601	TAAGTA	2	12	151526	151537	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118496753
62	NC_008601	ATAAAT	2	12	151940	151951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008601	GATCTA	2	12	155498	155509	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118496757
64	NC_008601	AAATAT	2	12	158374	158385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496758
65	NC_008601	ACAGGT	2	12	160551	160562	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118496761
66	NC_008601	ACTTTT	2	12	160894	160905	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	118496762
67	NC_008601	TACAAC	2	12	162361	162372	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	118496763
68	NC_008601	TCCTTG	2	12	166207	166218	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	118496767
69	NC_008601	AGCTAT	2	12	167134	167145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118496768
70	NC_008601	TAAAAG	2	12	170915	170926	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118496770
71	NC_008601	AAATAA	2	12	171504	171515	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	118496771
72	NC_008601	AACTTC	2	12	173448	173459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496773
73	NC_008601	ATTTCC	2	12	174444	174455	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008601	TTATGA	2	12	175649	175660	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118496775
75	NC_008601	ATCAAA	2	12	178174	178185	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118496778
76	NC_008601	GTACAG	2	12	178347	178358	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118496778
77	NC_008601	CAAAGT	2	12	182678	182689	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118496781
78	NC_008601	TAAAGA	2	12	185156	185167	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008601	AAATGC	2	12	186029	186040	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118496784
80	NC_008601	TTTCAT	2	12	193791	193802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	118496790
81	NC_008601	CAGATA	2	12	195867	195878	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118496791
82	NC_008601	ATCGTA	2	12	196089	196100	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118496792
83	NC_008601	AAGGTA	2	12	196120	196131	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118496792
84	NC_008601	ATCGCT	2	12	198487	198498	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118496794
85	NC_008601	TATAAA	2	12	198686	198697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008601	TTGTGT	2	12	199835	199846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496796
87	NC_008601	GTTGCT	2	12	203503	203514	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	118496800
88	NC_008601	TAGTAT	2	12	203583	203594	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118496800
89	NC_008601	TCATTA	2	12	204339	204350	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	118496801
90	NC_008601	GACAAG	2	12	207303	207314	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118496803
91	NC_008601	CAAATT	2	12	212520	212531	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118496807
92	NC_008601	TTTTAT	2	12	213209	213220	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118496808
93	NC_008601	TTAAGT	2	12	213950	213961	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118496808
94	NC_008601	ATTATA	2	12	220870	220881	50 %	50 %	0 %	0 %	118496813
95	NC_008601	CACCAA	2	12	222644	222655	50 %	0 %	0 %	50 %	118496815
96	NC_008601	ACTAGT	2	12	230167	230178	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118496824
97	NC_008601	TACTGC	2	12	236180	236191	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118496828
98	NC_008601	TAGCTT	2	12	240952	240963	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118496832
99	NC_008601	ATTTTT	2	12	241205	241216	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008601	CATCAC	2	12	244213	244224	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	118496835
101	NC_008601	TTTTGA	2	12	244226	244237	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118496835
102	NC_008601	TAAAAG	2	12	245751	245762	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008601	TTATGG	2	12	247173	247184	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118496837
104	NC_008601	TGAAGC	2	12	250424	250435	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118496840
105	NC_008601	AAAGAA	2	12	251529	251540	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	118496841
106	NC_008601	AAAAGA	2	12	253011	253022	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	118496843
107	NC_008601	TGGTGT	2	12	254040	254051	0 %	50 %	50 %	0 %	118496845
108	NC_008601	GTTTTT	2	12	254740	254751	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	118496845
109	NC_008601	TGAAGT	2	12	256531	256542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496849
110	NC_008601	GCAAGA	2	12	257007	257018	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118496850
111	NC_008601	CTGTTG	2	12	258089	258100	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	118496850
112	NC_008601	AGGTTG	2	12	258698	258709	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118496850
113	NC_008601	TGGGTG	2	12	264962	264973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118496864
114	NC_008601	TTGGTG	2	12	266091	266102	0 %	50 %	50 %	0 %	118496866
115	NC_008601	TAAAGA	2	12	274027	274038	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118496879
116	NC_008601	GGTATG	2	12	274625	274636	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118496879
117	NC_008601	AAGAGC	2	12	281579	281590	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118496885
118	NC_008601	AAAGGT	2	12	282319	282330	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118496886
119	NC_008601	AGTTAC	2	12	287049	287060	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118496890
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232	NC_008601	AAGTTA	2	12	505631	505642	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
233	NC_008601	GTTTTG	2	12	507099	507110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118497099
234	NC_008601	TATTTT	2	12	510169	510180	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_008601	CTAGAT	2	12	512595	512606	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118497102
236	NC_008601	TATTTA	2	12	514317	514328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118497103
237	NC_008601	GATATC	2	12	518459	518470	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118497107
238	NC_008601	ACTGAA	2	12	519170	519181	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118497107
239	NC_008601	AGATTG	2	12	520108	520119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118497108
240	NC_008601	AAAATA	2	12	522037	522048	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	118497108
241	NC_008601	TGGCGA	2	12	522135	522146	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118497108
242	NC_008601	TCTAAT	2	12	525015	525026	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	118497111
243	NC_008601	AGAGCA	2	12	525196	525207	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118497111
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258	NC_008601	TTTAAT	2	12	560057	560068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_008601	TTATGG	2	12	560601	560612	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118497136
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266	NC_008601	GATGCT	2	12	571228	571239	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118497144
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