MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica OSU18 chromosome

Total Repeats: 1614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008369	AAGAA	2	10	1181	1190	80 %	0 %	20 %	0 %	115313982
2	NC_008369	CATCT	2	10	3512	3521	20 %	40 %	0 %	40 %	115313984
3	NC_008369	TTCTT	2	10	3584	3593	0 %	80 %	0 %	20 %	115313984
4	NC_008369	CCTTG	2	10	3782	3791	0 %	40 %	20 %	40 %	115313984
5	NC_008369	ATTAT	2	10	6832	6841	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008369	CAACA	2	10	6924	6933	60 %	0 %	0 %	40 %	115313986
7	NC_008369	TGTTT	2	10	8632	8641	0 %	80 %	20 %	0 %	115313988
8	NC_008369	CAAGA	2	10	11613	11622	60 %	0 %	20 %	20 %	115313992
9	NC_008369	TTGAT	2	10	13944	13953	20 %	60 %	20 %	0 %	115313994
10	NC_008369	CATCT	2	10	16387	16396	20 %	40 %	0 %	40 %	115313995
11	NC_008369	TTCTT	2	10	16459	16468	0 %	80 %	0 %	20 %	115313995
12	NC_008369	CCTTG	2	10	16657	16666	0 %	40 %	20 %	40 %	115313995
13	NC_008369	AGCTA	2	10	19221	19230	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008369	ACGCA	2	10	19751	19760	40 %	0 %	20 %	40 %	115313997
15	NC_008369	TTGAA	2	10	19840	19849	40 %	40 %	20 %	0 %	115313997
16	NC_008369	GCAAA	2	10	20355	20364	60 %	0 %	20 %	20 %	115313997
17	NC_008369	TTAAT	2	10	20462	20471	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008369	TGATT	2	10	20649	20658	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008369	CAAGG	2	10	21232	21241	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_008369	AAAGA	2	10	21429	21438	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008369	ATTTT	2	10	22999	23008	20 %	80 %	0 %	0 %	115313998
22	NC_008369	ATATC	2	10	23071	23080	40 %	40 %	0 %	20 %	115313998
23	NC_008369	ATTTT	2	10	23166	23175	20 %	80 %	0 %	0 %	115313998
24	NC_008369	AGATA	2	10	23310	23319	60 %	20 %	20 %	0 %	115313998
25	NC_008369	CAAAG	2	10	25283	25292	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_008369	ATATT	2	10	25659	25668	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008369	ATTTT	2	10	26064	26073	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008369	ATTTG	2	10	26124	26133	20 %	60 %	20 %	0 %	115314000
29	NC_008369	AAAGA	2	10	26842	26851	80 %	0 %	20 %	0 %	115314000
30	NC_008369	CATTT	2	10	28489	28498	20 %	60 %	0 %	20 %	115314001
31	NC_008369	ATAGT	2	10	30819	30828	40 %	40 %	20 %	0 %	115314002
32	NC_008369	AAAAT	2	10	33060	33069	80 %	20 %	0 %	0 %	115314003
33	NC_008369	GTTTA	2	10	33751	33760	20 %	60 %	20 %	0 %	115314004
34	NC_008369	TCAAA	2	10	34005	34014	60 %	20 %	0 %	20 %	115314005
35	NC_008369	GAAAA	2	10	35836	35845	80 %	0 %	20 %	0 %	115314006
36	NC_008369	CTTGT	2	10	35909	35918	0 %	60 %	20 %	20 %	115314006
37	NC_008369	AAACA	2	10	36014	36023	80 %	0 %	0 %	20 %	115314006
38	NC_008369	AAATA	2	10	36122	36131	80 %	20 %	0 %	0 %	115314006
39	NC_008369	CTGTA	2	10	36444	36453	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008369	TTATC	2	10	36731	36740	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008369	TTGAT	2	10	38098	38107	20 %	60 %	20 %	0 %	115314008
42	NC_008369	TACAA	2	10	38938	38947	60 %	20 %	0 %	20 %	115314009
43	NC_008369	CTAAC	2	10	39412	39421	40 %	20 %	0 %	40 %	115314010
44	NC_008369	TTTTA	2	10	39986	39995	20 %	80 %	0 %	0 %	115314010
45	NC_008369	TAATA	2	10	40667	40676	60 %	40 %	0 %	0 %	115314011
46	NC_008369	AGAAA	2	10	42580	42589	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008369	AGTTT	2	10	45929	45938	20 %	60 %	20 %	0 %	115314014
48	NC_008369	TCACT	2	10	49067	49076	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_008369	CTTGT	2	10	49860	49869	0 %	60 %	20 %	20 %	115314018
50	NC_008369	AGTTT	2	10	51762	51771	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008369	GATAA	2	10	52879	52888	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008369	TAAAC	2	10	53733	53742	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_008369	CATCT	2	10	54579	54588	20 %	40 %	0 %	40 %	115314020
54	NC_008369	TTCTT	2	10	54651	54660	0 %	80 %	0 %	20 %	115314020
55	NC_008369	CCTTG	2	10	54849	54858	0 %	40 %	20 %	40 %	115314020
56	NC_008369	TATTT	2	10	55660	55669	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008369	ATTAT	2	10	55690	55699	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008369	TAATA	2	10	56269	56278	60 %	40 %	0 %	0 %	115314022
59	NC_008369	AATTT	2	10	56694	56703	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008369	TTATT	2	10	56949	56958	20 %	80 %	0 %	0 %	115314024
61	NC_008369	TACTT	2	10	57234	57243	20 %	60 %	0 %	20 %	115314024
62	NC_008369	TTCAA	2	10	59788	59797	40 %	40 %	0 %	20 %	115314027
63	NC_008369	GATAA	2	10	61246	61255	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008369	TAGTA	2	10	61349	61358	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008369	AATTT	2	10	62815	62824	40 %	60 %	0 %	0 %	115314029
66	NC_008369	TTTGT	2	10	63094	63103	0 %	80 %	20 %	0 %	115314029
67	NC_008369	ATTTT	2	10	64115	64124	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008369	CTAAA	2	10	65765	65774	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_008369	GTTTA	2	10	66542	66551	20 %	60 %	20 %	0 %	115314031
70	NC_008369	TGAAA	2	10	67571	67580	60 %	20 %	20 %	0 %	115314033
71	NC_008369	AAAGT	2	10	71406	71415	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008369	TTTTA	2	10	74637	74646	20 %	80 %	0 %	0 %	115314040
73	NC_008369	TATTT	2	10	74868	74877	20 %	80 %	0 %	0 %	115314040
74	NC_008369	GCCCT	2	10	75535	75544	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_008369	AGAAA	2	10	75746	75755	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008369	CATCT	2	10	76854	76863	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_008369	TTCTT	2	10	76926	76935	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_008369	CCTTG	2	10	77124	77133	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_008369	TTTGG	2	10	77403	77412	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008369	ACTTT	2	10	77444	77453	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_008369	TTTGT	2	10	81654	81663	0 %	80 %	20 %	0 %	115314043
82	NC_008369	ATTTT	2	10	84637	84646	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008369	AGTTA	2	10	84761	84770	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008369	AACTC	2	10	85737	85746	40 %	20 %	0 %	40 %	115314048
85	NC_008369	ATTAC	2	10	90774	90783	40 %	40 %	0 %	20 %	115314050
86	NC_008369	ATGTA	2	10	91316	91325	40 %	40 %	20 %	0 %	115314050
87	NC_008369	TAAAA	2	10	92504	92513	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008369	AAACT	2	10	92775	92784	60 %	20 %	0 %	20 %	115314051
89	NC_008369	TTTCT	2	10	93711	93720	0 %	80 %	0 %	20 %	115314052
90	NC_008369	CTTTT	2	10	93769	93778	0 %	80 %	0 %	20 %	115314053
91	NC_008369	TAGTA	2	10	95685	95694	40 %	40 %	20 %	0 %	115314054
92	NC_008369	CAAGG	2	10	100139	100148	40 %	0 %	40 %	20 %	115314058
93	NC_008369	AAAGA	2	10	100336	100345	80 %	0 %	20 %	0 %	115314058
94	NC_008369	TGAAA	2	10	102876	102885	60 %	20 %	20 %	0 %	115314059
95	NC_008369	GTCGA	2	10	104363	104372	20 %	20 %	40 %	20 %	115314060
96	NC_008369	TAAGT	2	10	105550	105559	40 %	40 %	20 %	0 %	115314062
97	NC_008369	TAAAT	2	10	106042	106051	60 %	40 %	0 %	0 %	115314062
98	NC_008369	TTATA	2	10	106487	106496	40 %	60 %	0 %	0 %	115314063
99	NC_008369	TTTTC	2	10	106501	106510	0 %	80 %	0 %	20 %	115314063
100	NC_008369	TAATA	2	10	107877	107886	60 %	40 %	0 %	0 %	115314064
101	NC_008369	TTTTA	2	10	108214	108223	20 %	80 %	0 %	0 %	115314064
102	NC_008369	GCTTG	2	10	109390	109399	0 %	40 %	40 %	20 %	115314064
103	NC_008369	ATTTT	2	10	110471	110480	20 %	80 %	0 %	0 %	115314064
104	NC_008369	TATAA	2	10	111277	111286	60 %	40 %	0 %	0 %	115314065
105	NC_008369	TATTT	2	10	111881	111890	20 %	80 %	0 %	0 %	115314066
106	NC_008369	ATTAA	2	10	114351	114360	60 %	40 %	0 %	0 %	115314068
107	NC_008369	TCTTT	2	10	115065	115074	0 %	80 %	0 %	20 %	115314068
108	NC_008369	TTCTA	2	10	116979	116988	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_008369	TATAA	2	10	117290	117299	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008369	TATTC	2	10	120335	120344	20 %	60 %	0 %	20 %	115314072
111	NC_008369	TTGTT	2	10	123512	123521	0 %	80 %	20 %	0 %	115314073
112	NC_008369	GAATA	2	10	125960	125969	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008369	CAAGG	2	10	130474	130483	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_008369	AAAGA	2	10	130671	130680	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008369	CGTAT	2	10	133347	133356	20 %	40 %	20 %	20 %	115314075
116	NC_008369	GATTT	2	10	133588	133597	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008369	CTAGC	2	10	134091	134100	20 %	20 %	20 %	40 %	115314076
118	NC_008369	TTTTC	2	10	135060	135069	0 %	80 %	0 %	20 %	115314076
119	NC_008369	TTTTA	2	10	136606	136615	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008369	TATAG	2	10	139592	139601	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008369	CATCT	2	10	140569	140578	20 %	40 %	0 %	40 %	115314079
122	NC_008369	TTCTT	2	10	140641	140650	0 %	80 %	0 %	20 %	115314079
123	NC_008369	CCTTG	2	10	140839	140848	0 %	40 %	20 %	40 %	115314079
124	NC_008369	AAAAT	2	10	141117	141126	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008369	ATAAA	2	10	141695	141704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008369	AATAA	2	10	141845	141854	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008369	GGGAT	2	10	145365	145374	20 %	20 %	60 %	0 %	115314081
128	NC_008369	TTGAT	2	10	145417	145426	20 %	60 %	20 %	0 %	115314081
129	NC_008369	AAATT	2	10	147422	147431	60 %	40 %	0 %	0 %	115314083
130	NC_008369	TTATT	2	10	149167	149176	20 %	80 %	0 %	0 %	115314087
131	NC_008369	TATTT	2	10	150917	150926	20 %	80 %	0 %	0 %	115314089
132	NC_008369	AGATG	2	10	152183	152192	40 %	20 %	40 %	0 %	115314090
133	NC_008369	ATTTT	2	10	158344	158353	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008369	CAAGG	2	10	158855	158864	40 %	0 %	40 %	20 %	115314096
135	NC_008369	AAAGA	2	10	159052	159061	80 %	0 %	20 %	0 %	115314096
136	NC_008369	ATTGT	2	10	164078	164087	20 %	60 %	20 %	0 %	115314101
137	NC_008369	AAAGC	2	10	166224	166233	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_008369	TAAAC	2	10	166605	166614	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008369	CATCT	2	10	167541	167550	20 %	40 %	0 %	40 %	115314104
140	NC_008369	TTCTT	2	10	167613	167622	0 %	80 %	0 %	20 %	115314104
141	NC_008369	CCTTG	2	10	167811	167820	0 %	40 %	20 %	40 %	115314104
142	NC_008369	AGTTT	2	10	168551	168560	20 %	60 %	20 %	0 %	115314105
143	NC_008369	ATCAC	2	10	168860	168869	40 %	20 %	0 %	40 %	115314105
144	NC_008369	ATTTT	2	10	169247	169256	20 %	80 %	0 %	0 %	115314106
145	NC_008369	AACTA	2	10	169924	169933	60 %	20 %	0 %	20 %	115314106
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147	NC_008369	CTTGA	2	10	170649	170658	20 %	40 %	20 %	20 %	115314106
148	NC_008369	CTGTA	2	10	171139	171148	20 %	40 %	20 %	20 %	115314106
149	NC_008369	AAATA	2	10	172795	172804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008369	TATAG	2	10	173410	173419	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008369	CTAGC	2	10	176452	176461	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
152	NC_008369	AATAT	2	10	177016	177025	60 %	40 %	0 %	0 %	115314112
153	NC_008369	CTTGA	2	10	177348	177357	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
154	NC_008369	CTTTG	2	10	177450	177459	0 %	60 %	20 %	20 %	115314113
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156	NC_008369	AAAAT	3	15	177959	177973	80 %	20 %	0 %	0 %	115314114
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160	NC_008369	AAAGA	2	10	184399	184408	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_008369	AGCAA	2	10	185186	185195	60 %	0 %	20 %	20 %	115314123
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163	NC_008369	ATACG	2	10	186008	186017	40 %	20 %	20 %	20 %	115314123
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167	NC_008369	TTAAG	2	10	190318	190327	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
168	NC_008369	AGATT	2	10	190412	190421	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
169	NC_008369	TTTGG	2	10	195368	195377	0 %	60 %	40 %	0 %	115314131
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171	NC_008369	TTTAT	2	10	201582	201591	20 %	80 %	0 %	0 %	115314139
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181	NC_008369	ATATT	2	10	213890	213899	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_008369	CCATT	2	10	214316	214325	20 %	40 %	0 %	40 %	115314151
183	NC_008369	TAAAT	2	10	215207	215216	60 %	40 %	0 %	0 %	115314152
184	NC_008369	AAAAT	2	10	215745	215754	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_008369	GTAGA	2	10	216434	216443	40 %	20 %	40 %	0 %	115314154
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190	NC_008369	AAAAT	2	10	224900	224909	80 %	20 %	0 %	0 %	115314159
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193	NC_008369	GGGTA	2	10	227669	227678	20 %	20 %	60 %	0 %	115314162
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195	NC_008369	TCGTA	2	10	232640	232649	20 %	40 %	20 %	20 %	115314169
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201	NC_008369	ATTTT	2	10	238766	238775	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_008369	TTATT	2	10	243396	243405	20 %	80 %	0 %	0 %	115314191
203	NC_008369	ATCCT	2	10	246742	246751	20 %	40 %	0 %	40 %	115314195
204	NC_008369	ATTTC	2	10	247482	247491	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
205	NC_008369	CAAGG	2	10	247767	247776	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
206	NC_008369	AAAGA	2	10	247964	247973	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
207	NC_008369	AGAAA	2	10	248547	248556	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
208	NC_008369	TCAAT	2	10	249181	249190	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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211	NC_008369	CATCT	2	10	250919	250928	20 %	40 %	0 %	40 %	115314198
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217	NC_008369	TTCTT	2	10	254118	254127	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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219	NC_008369	CATCT	2	10	255979	255988	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
220	NC_008369	TTCTT	2	10	256051	256060	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
221	NC_008369	CCTTG	2	10	256249	256258	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
222	NC_008369	TAATT	2	10	258151	258160	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
223	NC_008369	TTTCT	2	10	258917	258926	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
224	NC_008369	AGTTT	2	10	259129	259138	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
225	NC_008369	TACAA	2	10	259766	259775	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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233	NC_008369	TTATT	2	10	266571	266580	20 %	80 %	0 %	0 %	115314206
234	NC_008369	TTTGA	2	10	267624	267633	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_008369	ATTAT	2	10	273253	273262	40 %	60 %	0 %	0 %	115314211
243	NC_008369	ATCTT	2	10	273914	273923	20 %	60 %	0 %	20 %	115314212
244	NC_008369	GATTT	2	10	274763	274772	20 %	60 %	20 %	0 %	115314213
245	NC_008369	GTTAT	2	10	275049	275058	20 %	60 %	20 %	0 %	115314214
246	NC_008369	AGCTT	2	10	276135	276144	20 %	40 %	20 %	20 %	115314215
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249	NC_008369	CTTTT	2	10	281434	281443	0 %	80 %	0 %	20 %	115314221
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251	NC_008369	ATATA	2	10	284500	284509	60 %	40 %	0 %	0 %	115314223
252	NC_008369	GAAAG	2	10	286286	286295	60 %	0 %	40 %	0 %	115314225
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254	NC_008369	ACATC	2	10	289775	289784	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
255	NC_008369	TTTCT	2	10	290581	290590	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
256	NC_008369	GTTAT	2	10	291671	291680	20 %	60 %	20 %	0 %	115314230
257	NC_008369	TTTGC	2	10	293598	293607	0 %	60 %	20 %	20 %	115314231
258	NC_008369	TTCTA	2	10	299352	299361	20 %	60 %	0 %	20 %	115314235
259	NC_008369	CAAGG	2	10	303380	303389	40 %	0 %	40 %	20 %	115314238
260	NC_008369	AAAGA	2	10	303577	303586	80 %	0 %	20 %	0 %	115314238
261	NC_008369	TATTT	3	15	304245	304259	20 %	80 %	0 %	0 %	115314239
262	NC_008369	TTCTT	2	10	307365	307374	0 %	80 %	0 %	20 %	115314243
263	NC_008369	TATCT	2	10	307413	307422	20 %	60 %	0 %	20 %	115314243
264	NC_008369	TTGGT	2	10	307427	307436	0 %	60 %	40 %	0 %	115314243
265	NC_008369	TGATC	2	10	309500	309509	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
266	NC_008369	TAATT	2	10	310214	310223	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_008369	TATTT	2	10	310714	310723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_008369	AGGTA	2	10	314820	314829	40 %	20 %	40 %	0 %	115314247
269	NC_008369	ATTTA	2	10	316304	316313	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_008369	GGTAA	2	10	319167	319176	40 %	20 %	40 %	0 %	115314254
271	NC_008369	TAAGC	2	10	320228	320237	40 %	20 %	20 %	20 %	115314256
272	NC_008369	AATTA	2	10	320387	320396	60 %	40 %	0 %	0 %	115314256
273	NC_008369	AATCT	2	10	320705	320714	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
274	NC_008369	ACTAC	2	10	321483	321492	40 %	20 %	0 %	40 %	115314257
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405	NC_008369	GCAAA	2	10	487319	487328	60 %	0 %	20 %	20 %	115314392
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