MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica LVS chromosome

Total Repeats: 1597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007880	AAGAA	2	10	1455	1464	80 %	0 %	20 %	0 %	89255450
2	NC_007880	TTCTT	2	10	3858	3867	0 %	80 %	0 %	20 %	89255453
3	NC_007880	CCTTG	2	10	4056	4065	0 %	40 %	20 %	40 %	89255453
4	NC_007880	ATTAT	2	10	7106	7115	40 %	60 %	0 %	0 %	89255456
5	NC_007880	CAACA	2	10	7198	7207	60 %	0 %	0 %	40 %	89255457
6	NC_007880	TGTTT	2	10	8906	8915	0 %	80 %	20 %	0 %	89255459
7	NC_007880	CAAGA	2	10	11886	11895	60 %	0 %	20 %	20 %	89255463
8	NC_007880	TTGAT	2	10	14214	14223	20 %	60 %	20 %	0 %	89255465
9	NC_007880	CATCT	2	10	16684	16693	20 %	40 %	0 %	40 %	89255466
10	NC_007880	TTCTT	2	10	16756	16765	0 %	80 %	0 %	20 %	89255466
11	NC_007880	CCTTG	2	10	16954	16963	0 %	40 %	20 %	40 %	89255466
12	NC_007880	AGCTA	2	10	19518	19527	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007880	ACGCA	2	10	20048	20057	40 %	0 %	20 %	40 %	89255469
14	NC_007880	TTGAA	2	10	20137	20146	40 %	40 %	20 %	0 %	89255469
15	NC_007880	GCAAA	2	10	20652	20661	60 %	0 %	20 %	20 %	89255469
16	NC_007880	TTAAT	2	10	20759	20768	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007880	TGATT	2	10	20946	20955	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007880	CAAGG	2	10	21529	21538	40 %	0 %	40 %	20 %	89255470
19	NC_007880	AAAGA	2	10	21726	21735	80 %	0 %	20 %	0 %	89255470
20	NC_007880	ATTTT	2	10	23297	23306	20 %	80 %	0 %	0 %	89255471
21	NC_007880	ATATC	2	10	23369	23378	40 %	40 %	0 %	20 %	89255471
22	NC_007880	ATTTT	2	10	23464	23473	20 %	80 %	0 %	0 %	89255471
23	NC_007880	AGATA	2	10	23608	23617	60 %	20 %	20 %	0 %	89255471
24	NC_007880	CAAAG	2	10	25581	25590	60 %	0 %	20 %	20 %	89255473
25	NC_007880	ATATT	2	10	25957	25966	40 %	60 %	0 %	0 %	89255474
26	NC_007880	ATTTT	2	10	26362	26371	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007880	ATTTG	2	10	26422	26431	20 %	60 %	20 %	0 %	89255475
28	NC_007880	AAAGA	2	10	27140	27149	80 %	0 %	20 %	0 %	89255475
29	NC_007880	CATTT	2	10	28784	28793	20 %	60 %	0 %	20 %	89255476
30	NC_007880	ATAGT	2	10	31114	31123	40 %	40 %	20 %	0 %	89255477
31	NC_007880	AAAAT	2	10	33355	33364	80 %	20 %	0 %	0 %	89255478
32	NC_007880	GTTTA	2	10	34046	34055	20 %	60 %	20 %	0 %	89255479
33	NC_007880	TCAAA	2	10	34300	34309	60 %	20 %	0 %	20 %	89255480
34	NC_007880	GAAAA	2	10	36131	36140	80 %	0 %	20 %	0 %	89255481
35	NC_007880	CTTGT	2	10	36204	36213	0 %	60 %	20 %	20 %	89255481
36	NC_007880	AAACA	2	10	36309	36318	80 %	0 %	0 %	20 %	89255481
37	NC_007880	AAATA	2	10	36417	36426	80 %	20 %	0 %	0 %	89255481
38	NC_007880	CTGTA	2	10	36739	36748	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007880	TTATC	2	10	37026	37035	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_007880	TTGAT	2	10	38393	38402	20 %	60 %	20 %	0 %	89255483
41	NC_007880	TACAA	2	10	39233	39242	60 %	20 %	0 %	20 %	89255484
42	NC_007880	CTAAC	2	10	39707	39716	40 %	20 %	0 %	40 %	89255485
43	NC_007880	TTTTA	2	10	40281	40290	20 %	80 %	0 %	0 %	89255485
44	NC_007880	TAATA	2	10	40962	40971	60 %	40 %	0 %	0 %	89255486
45	NC_007880	AGAAA	2	10	42874	42883	80 %	0 %	20 %	0 %	89255489
46	NC_007880	AGTTT	2	10	46223	46232	20 %	60 %	20 %	0 %	89255491
47	NC_007880	CTTGT	2	10	50149	50158	0 %	60 %	20 %	20 %	89255495
48	NC_007880	AGTTT	2	10	52051	52060	20 %	60 %	20 %	0 %	89255497
49	NC_007880	GATAA	2	10	53168	53177	60 %	20 %	20 %	0 %	89255499
50	NC_007880	TAAAC	2	10	54012	54021	60 %	20 %	0 %	20 %	89255500
51	NC_007880	CATCT	2	10	54858	54867	20 %	40 %	0 %	40 %	89255501
52	NC_007880	TTCTT	2	10	54930	54939	0 %	80 %	0 %	20 %	89255501
53	NC_007880	CCTTG	2	10	55128	55137	0 %	40 %	20 %	40 %	89255501
54	NC_007880	TATTT	2	10	55939	55948	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007880	ATTAT	2	10	55969	55978	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007880	TAATA	2	10	56548	56557	60 %	40 %	0 %	0 %	89255503
57	NC_007880	AATTT	2	10	56973	56982	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007880	TTATT	2	10	57228	57237	20 %	80 %	0 %	0 %	89255504
59	NC_007880	TACTT	2	10	57513	57522	20 %	60 %	0 %	20 %	89255504
60	NC_007880	TTCAA	2	10	60067	60076	40 %	40 %	0 %	20 %	89255507
61	NC_007880	GATAA	2	10	61525	61534	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007880	AATTT	2	10	63094	63103	40 %	60 %	0 %	0 %	89255510
63	NC_007880	TTTGT	2	10	63373	63382	0 %	80 %	20 %	0 %	89255510
64	NC_007880	ATTTT	2	10	64439	64448	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007880	CTAAA	2	10	66085	66094	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_007880	GTTTA	2	10	66862	66871	20 %	60 %	20 %	0 %	89255512
67	NC_007880	TGAAA	2	10	67891	67900	60 %	20 %	20 %	0 %	89255514
68	NC_007880	AAAGT	2	10	71726	71735	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007880	TTTTA	2	10	74957	74966	20 %	80 %	0 %	0 %	89255521
70	NC_007880	TATTT	2	10	75188	75197	20 %	80 %	0 %	0 %	89255521
71	NC_007880	GCCCT	2	10	75855	75864	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_007880	AGAAA	2	10	76066	76075	80 %	0 %	20 %	0 %	89255522
73	NC_007880	CATCT	2	10	77174	77183	20 %	40 %	0 %	40 %	89255523
74	NC_007880	TTCTT	2	10	77246	77255	0 %	80 %	0 %	20 %	89255523
75	NC_007880	CCTTG	2	10	77444	77453	0 %	40 %	20 %	40 %	89255523
76	NC_007880	TTTGG	2	10	77725	77734	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007880	ACTTT	2	10	77766	77775	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_007880	TTTGT	2	10	81976	81985	0 %	80 %	20 %	0 %	89255526
79	NC_007880	ATTTT	2	10	84961	84970	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007880	AGTTA	2	10	85085	85094	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007880	AACTC	2	10	86061	86070	40 %	20 %	0 %	40 %	89255532
82	NC_007880	ATTAC	2	10	91098	91107	40 %	40 %	0 %	20 %	89255534
83	NC_007880	ATGTA	2	10	91640	91649	40 %	40 %	20 %	0 %	89255534
84	NC_007880	TAAAA	2	10	92828	92837	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007880	AAACT	2	10	93099	93108	60 %	20 %	0 %	20 %	89255535
86	NC_007880	TTTCT	2	10	94035	94044	0 %	80 %	0 %	20 %	89255536
87	NC_007880	CTTTT	2	10	94093	94102	0 %	80 %	0 %	20 %	89255537
88	NC_007880	TAGTA	2	10	96009	96018	40 %	40 %	20 %	0 %	89255538
89	NC_007880	CAAGG	2	10	100462	100471	40 %	0 %	40 %	20 %	89255544
90	NC_007880	AAAGA	2	10	100659	100668	80 %	0 %	20 %	0 %	89255544
91	NC_007880	TGAAA	2	10	103199	103208	60 %	20 %	20 %	0 %	89255548
92	NC_007880	GTCGA	2	10	104686	104695	20 %	20 %	40 %	20 %	89255549
93	NC_007880	TAAGT	2	10	105873	105882	40 %	40 %	20 %	0 %	89255551
94	NC_007880	TAAAT	2	10	106365	106374	60 %	40 %	0 %	0 %	89255551
95	NC_007880	TTATA	2	10	106810	106819	40 %	60 %	0 %	0 %	89255552
96	NC_007880	TTTTC	2	10	106824	106833	0 %	80 %	0 %	20 %	89255552
97	NC_007880	TAATA	2	10	108200	108209	60 %	40 %	0 %	0 %	89255553
98	NC_007880	TTTTA	2	10	108537	108546	20 %	80 %	0 %	0 %	89255553
99	NC_007880	GCTTG	2	10	109713	109722	0 %	40 %	40 %	20 %	89255553
100	NC_007880	ATTTT	2	10	110794	110803	20 %	80 %	0 %	0 %	89255553
101	NC_007880	TATAA	2	10	111600	111609	60 %	40 %	0 %	0 %	89255554
102	NC_007880	TATTT	2	10	112204	112213	20 %	80 %	0 %	0 %	89255555
103	NC_007880	ATTAA	2	10	114674	114683	60 %	40 %	0 %	0 %	89255557
104	NC_007880	TCTTT	2	10	115388	115397	0 %	80 %	0 %	20 %	89255557
105	NC_007880	TTCTA	2	10	117302	117311	20 %	60 %	0 %	20 %	89255559
106	NC_007880	TATAA	2	10	117613	117622	60 %	40 %	0 %	0 %	89255559
107	NC_007880	TATTC	2	10	120658	120667	20 %	60 %	0 %	20 %	89255562
108	NC_007880	TTGTT	2	10	123835	123844	0 %	80 %	20 %	0 %	89255563
109	NC_007880	GAATA	2	10	126283	126292	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007880	CAAGG	2	10	130796	130805	40 %	0 %	40 %	20 %	89255565
111	NC_007880	AAAGA	2	10	130993	131002	80 %	0 %	20 %	0 %	89255565
112	NC_007880	CGTAT	2	10	133670	133679	20 %	40 %	20 %	20 %	89255568
113	NC_007880	GATTT	2	10	133911	133920	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007880	CTAGC	2	10	134414	134423	20 %	20 %	20 %	40 %	89255569
115	NC_007880	TTTTC	2	10	135383	135392	0 %	80 %	0 %	20 %	89255569
116	NC_007880	TTTTA	2	10	136929	136938	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007880	TATAG	2	10	139915	139924	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007880	CATCT	2	10	140892	140901	20 %	40 %	0 %	40 %	89255572
119	NC_007880	TTCTT	2	10	140964	140973	0 %	80 %	0 %	20 %	89255572
120	NC_007880	CCTTG	2	10	141162	141171	0 %	40 %	20 %	40 %	89255572
121	NC_007880	AAAAT	2	10	141440	141449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007880	ATAAA	2	10	142018	142027	80 %	20 %	0 %	0 %	89255573
123	NC_007880	AATAA	2	10	142168	142177	80 %	20 %	0 %	0 %	89255573
124	NC_007880	GGGAT	2	10	145688	145697	20 %	20 %	60 %	0 %	89255575
125	NC_007880	TTGAT	2	10	145740	145749	20 %	60 %	20 %	0 %	89255575
126	NC_007880	AAATT	2	10	147745	147754	60 %	40 %	0 %	0 %	89255577
127	NC_007880	TTATT	2	10	149489	149498	20 %	80 %	0 %	0 %	89255580
128	NC_007880	TATTT	2	10	151239	151248	20 %	80 %	0 %	0 %	89255582
129	NC_007880	AGATG	2	10	152505	152514	40 %	20 %	40 %	0 %	89255583
130	NC_007880	ATTTT	2	10	158676	158685	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007880	CAAGG	2	10	159187	159196	40 %	0 %	40 %	20 %	89255590
132	NC_007880	AAAGA	2	10	159384	159393	80 %	0 %	20 %	0 %	89255590
133	NC_007880	ATTGT	2	10	164410	164419	20 %	60 %	20 %	0 %	89255594
134	NC_007880	AAAGC	2	10	166555	166564	60 %	0 %	20 %	20 %	89255596
135	NC_007880	TAAAC	2	10	166936	166945	60 %	20 %	0 %	20 %	89255596
136	NC_007880	CATCT	2	10	167872	167881	20 %	40 %	0 %	40 %	89255598
137	NC_007880	TTCTT	2	10	167944	167953	0 %	80 %	0 %	20 %	89255598
138	NC_007880	CCTTG	2	10	168142	168151	0 %	40 %	20 %	40 %	89255598
139	NC_007880	AGTTT	2	10	168882	168891	20 %	60 %	20 %	0 %	89255600
140	NC_007880	ATCAC	2	10	169191	169200	40 %	20 %	0 %	40 %	89255600
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