MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Frankia sp. CcI3 chromosome

Total Repeats: 6033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007777	ACACC	2	10	405	414	40 %	0 %	0 %	60 %	86738725
2	NC_007777	GACCG	2	10	2604	2613	20 %	0 %	40 %	40 %	86738726
3	NC_007777	CGCCC	2	10	5333	5342	0 %	0 %	20 %	80 %	86738728
4	NC_007777	CCGGC	2	10	8032	8041	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5	NC_007777	TACCG	2	10	8878	8887	20 %	20 %	20 %	40 %	86738730
6	NC_007777	CGGTC	2	10	11231	11240	0 %	20 %	40 %	40 %	86738731
7	NC_007777	CGGCC	2	10	11656	11665	0 %	0 %	40 %	60 %	86738731
8	NC_007777	CGCCC	2	10	11885	11894	0 %	0 %	20 %	80 %	86738732
9	NC_007777	CCGGT	2	10	12094	12103	0 %	20 %	40 %	40 %	86738732
10	NC_007777	CGTTC	2	10	14011	14020	0 %	40 %	20 %	40 %	86738733
11	NC_007777	CTGCG	2	10	15752	15761	0 %	20 %	40 %	40 %	86738735
12	NC_007777	CAGCG	2	10	17592	17601	20 %	0 %	40 %	40 %	86738737
13	NC_007777	AGTTC	2	10	18498	18507	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007777	GTGGC	2	10	18885	18894	0 %	20 %	60 %	20 %	86738738
15	NC_007777	GGCCG	2	10	18947	18956	0 %	0 %	60 %	40 %	86738738
16	NC_007777	CGACC	2	10	19317	19326	20 %	0 %	20 %	60 %	86738738
17	NC_007777	CGGCC	2	10	20860	20869	0 %	0 %	40 %	60 %	86738739
18	NC_007777	CGGCC	2	10	21352	21361	0 %	0 %	40 %	60 %	86738739
19	NC_007777	CCCCG	2	10	22108	22117	0 %	0 %	20 %	80 %	86738739
20	NC_007777	CCCCG	2	10	22123	22132	0 %	0 %	20 %	80 %	86738739
21	NC_007777	CGTGG	2	10	22172	22181	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_007777	TGGGA	2	10	22448	22457	20 %	20 %	60 %	0 %	86738740
23	NC_007777	CCGGC	2	10	24537	24546	0 %	0 %	40 %	60 %	86738740
24	NC_007777	GACGA	2	10	26054	26063	40 %	0 %	40 %	20 %	86738741
25	NC_007777	GCCGG	2	10	26653	26662	0 %	0 %	60 %	40 %	86738741
26	NC_007777	TGGTC	2	10	27792	27801	0 %	40 %	40 %	20 %	86738742
27	NC_007777	CACCG	2	10	28876	28885	20 %	0 %	20 %	60 %	86738743
28	NC_007777	CCCGC	2	10	29219	29228	0 %	0 %	20 %	80 %	86738744
29	NC_007777	ACCGA	2	10	29307	29316	40 %	0 %	20 %	40 %	86738744
30	NC_007777	CACCG	2	10	30484	30493	20 %	0 %	20 %	60 %	86738745
31	NC_007777	GCCCA	2	10	32376	32385	20 %	0 %	20 %	60 %	86738748
32	NC_007777	GGCCC	2	10	33533	33542	0 %	0 %	40 %	60 %	86738750
33	NC_007777	CTTCC	2	10	33585	33594	0 %	40 %	0 %	60 %	86738750
34	NC_007777	CCTGG	2	10	35445	35454	0 %	20 %	40 %	40 %	86738752
35	NC_007777	GCCCT	2	10	36580	36589	0 %	20 %	20 %	60 %	86738753
36	NC_007777	CGATG	2	10	39210	39219	20 %	20 %	40 %	20 %	86738755
37	NC_007777	CGCGG	2	10	39684	39693	0 %	0 %	60 %	40 %	86738756
38	NC_007777	GCCGC	2	10	39771	39780	0 %	0 %	40 %	60 %	86738756
39	NC_007777	CGGCG	2	10	39953	39962	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_007777	GGCCG	2	10	40054	40063	0 %	0 %	60 %	40 %	86738757
41	NC_007777	GCCGA	2	10	44599	44608	20 %	0 %	40 %	40 %	86738759
42	NC_007777	TGTTA	2	10	45242	45251	20 %	60 %	20 %	0 %	86738760
43	NC_007777	TCCGG	2	10	46343	46352	0 %	20 %	40 %	40 %	86738762
44	NC_007777	CGGCG	2	10	46745	46754	0 %	0 %	60 %	40 %	86738762
45	NC_007777	GCCCG	3	15	48323	48337	0 %	0 %	40 %	60 %	86738762
46	NC_007777	CCCGC	2	10	48493	48502	0 %	0 %	20 %	80 %	86738762
47	NC_007777	GGGAG	2	10	48646	48655	20 %	0 %	80 %	0 %	86738762
48	NC_007777	TCGGC	2	10	49134	49143	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_007777	CCCGG	2	10	49144	49153	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_007777	GCCCC	2	10	49535	49544	0 %	0 %	20 %	80 %	86738763
51	NC_007777	CCCGG	2	10	49791	49800	0 %	0 %	40 %	60 %	86738763
52	NC_007777	GCCAC	2	10	51262	51271	20 %	0 %	20 %	60 %	86738765
53	NC_007777	GCGAA	2	10	51728	51737	40 %	0 %	40 %	20 %	86738766
54	NC_007777	TCGGT	2	10	52122	52131	0 %	40 %	40 %	20 %	86738766
55	NC_007777	GGGCT	2	10	52386	52395	0 %	20 %	60 %	20 %	86738766
56	NC_007777	GGCCG	2	10	53734	53743	0 %	0 %	60 %	40 %	86738767
57	NC_007777	GGCCG	2	10	53902	53911	0 %	0 %	60 %	40 %	86738767
58	NC_007777	GGCCG	2	10	54070	54079	0 %	0 %	60 %	40 %	86738767
59	NC_007777	GGCTG	2	10	54133	54142	0 %	20 %	60 %	20 %	86738767
60	NC_007777	GGCCG	2	10	54238	54247	0 %	0 %	60 %	40 %	86738767
61	NC_007777	CGTGC	2	10	54434	54443	0 %	20 %	40 %	40 %	86738767
62	NC_007777	CTCCG	2	10	55399	55408	0 %	20 %	20 %	60 %	86738767
63	NC_007777	TCGTC	2	10	56800	56809	0 %	40 %	20 %	40 %	86738768
64	NC_007777	GACCG	2	10	57299	57308	20 %	0 %	40 %	40 %	86738768
65	NC_007777	CGGGG	2	10	58059	58068	0 %	0 %	80 %	20 %	86738769
66	NC_007777	CCGTA	2	10	58664	58673	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_007777	GCGCC	2	10	60157	60166	0 %	0 %	40 %	60 %	86738771
68	NC_007777	TCGGC	2	10	61324	61333	0 %	20 %	40 %	40 %	86738771
69	NC_007777	GGCAC	2	10	62461	62470	20 %	0 %	40 %	40 %	86738771
70	NC_007777	TTCCC	2	10	62840	62849	0 %	40 %	0 %	60 %	86738772
71	NC_007777	CCGGC	2	10	64229	64238	0 %	0 %	40 %	60 %	86738774
72	NC_007777	CGGTC	2	10	65270	65279	0 %	20 %	40 %	40 %	86738775
73	NC_007777	GGCCG	2	10	66027	66036	0 %	0 %	60 %	40 %	86738775
74	NC_007777	GCGCC	2	10	66811	66820	0 %	0 %	40 %	60 %	86738775
75	NC_007777	GGCCG	2	10	68457	68466	0 %	0 %	60 %	40 %	86738776
76	NC_007777	GCCCG	2	10	69763	69772	0 %	0 %	40 %	60 %	86738776
77	NC_007777	CCGGT	2	10	70400	70409	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_007777	CGTCG	2	10	71490	71499	0 %	20 %	40 %	40 %	86738779
79	NC_007777	ACCGG	2	10	71815	71824	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
80	NC_007777	GACCG	2	10	71832	71841	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
81	NC_007777	GACCG	2	10	71850	71859	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
82	NC_007777	GACCG	2	10	71868	71877	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
83	NC_007777	GACCG	2	10	71886	71895	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
84	NC_007777	GACCG	2	10	71904	71913	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
85	NC_007777	GACCG	2	10	71922	71931	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
86	NC_007777	GACCG	2	10	71940	71949	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
87	NC_007777	GACCG	2	10	71958	71967	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
88	NC_007777	GACCG	2	10	71976	71985	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
89	NC_007777	GACCG	2	10	71994	72003	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
90	NC_007777	CCCGT	2	10	72127	72136	0 %	20 %	20 %	60 %	86738779
91	NC_007777	CCCGT	2	10	72142	72151	0 %	20 %	20 %	60 %	86738779
92	NC_007777	GGATC	2	10	73676	73685	20 %	20 %	40 %	20 %	86738781
93	NC_007777	CCGGC	2	10	74877	74886	0 %	0 %	40 %	60 %	86738782
94	NC_007777	TCCGG	2	10	77311	77320	0 %	20 %	40 %	40 %	86738784
95	NC_007777	CCCGG	2	10	80925	80934	0 %	0 %	40 %	60 %	86738787
96	NC_007777	CCGGC	2	10	82616	82625	0 %	0 %	40 %	60 %	86738788
97	NC_007777	TCACA	2	10	83602	83611	40 %	20 %	0 %	40 %	86738790
98	NC_007777	GGGTG	2	10	85217	85226	0 %	20 %	80 %	0 %	86738791
99	NC_007777	ACCGG	2	10	86755	86764	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_007777	GACCG	2	10	86917	86926	20 %	0 %	40 %	40 %	86738792
101	NC_007777	ACCGT	2	10	87424	87433	20 %	20 %	20 %	40 %	86738792
102	NC_007777	CGGCC	2	10	88227	88236	0 %	0 %	40 %	60 %	86738792
103	NC_007777	GCCGC	2	10	88635	88644	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
104	NC_007777	CCCGG	3	15	88670	88684	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
105	NC_007777	TCGGG	2	10	90223	90232	0 %	20 %	60 %	20 %	86738794
106	NC_007777	GCCCA	2	10	90376	90385	20 %	0 %	20 %	60 %	86738794
107	NC_007777	TCCGG	2	10	90686	90695	0 %	20 %	40 %	40 %	86738794
108	NC_007777	GGGCC	2	10	90931	90940	0 %	0 %	60 %	40 %	86738795
109	NC_007777	CCGCC	2	10	91460	91469	0 %	0 %	20 %	80 %	86738795
110	NC_007777	GATCC	2	10	93637	93646	20 %	20 %	20 %	40 %	86738797
111	NC_007777	AGCGG	2	10	95560	95569	20 %	0 %	60 %	20 %	86738800
112	NC_007777	CCTGA	2	10	96789	96798	20 %	20 %	20 %	40 %	86738801
113	NC_007777	GTCCG	2	10	99580	99589	0 %	20 %	40 %	40 %	86738804
114	NC_007777	GTCCG	2	10	100540	100549	0 %	20 %	40 %	40 %	86738805
115	NC_007777	CAGCG	2	10	101297	101306	20 %	0 %	40 %	40 %	86738806
116	NC_007777	CGGGG	3	15	104393	104407	0 %	0 %	80 %	20 %	86738808
117	NC_007777	GGTCG	2	10	104910	104919	0 %	20 %	60 %	20 %	86738808
118	NC_007777	CCACG	2	10	105096	105105	20 %	0 %	20 %	60 %	86738808
119	NC_007777	CCGGC	2	10	106855	106864	0 %	0 %	40 %	60 %	86738810
120	NC_007777	CCAGG	2	10	107012	107021	20 %	0 %	40 %	40 %	86738810
121	NC_007777	TCGTC	2	10	107351	107360	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_007777	CACGT	2	10	107543	107552	20 %	20 %	20 %	40 %	86738811
123	NC_007777	GAGCA	2	10	108239	108248	40 %	0 %	40 %	20 %	86738812
124	NC_007777	GCGGT	2	10	108356	108365	0 %	20 %	60 %	20 %	86738812
125	NC_007777	CGCGG	2	10	108686	108695	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
126	NC_007777	GGCCG	2	10	109395	109404	0 %	0 %	60 %	40 %	86738813
127	NC_007777	GCCGG	2	10	109470	109479	0 %	0 %	60 %	40 %	86738813
128	NC_007777	GTGCG	2	10	109543	109552	0 %	20 %	60 %	20 %	86738813
129	NC_007777	GTTCC	2	10	110060	110069	0 %	40 %	20 %	40 %	86738813
130	NC_007777	GCCAG	2	10	110670	110679	20 %	0 %	40 %	40 %	86738815
131	NC_007777	CGGTC	2	10	111546	111555	0 %	20 %	40 %	40 %	86738815
132	NC_007777	CCGGG	2	10	113911	113920	0 %	0 %	60 %	40 %	86738815
133	NC_007777	ACCGC	2	10	115730	115739	20 %	0 %	20 %	60 %	86738817
134	NC_007777	GCCCG	2	10	116161	116170	0 %	0 %	40 %	60 %	86738817
135	NC_007777	CGTCC	2	10	117686	117695	0 %	20 %	20 %	60 %	86738818
136	NC_007777	GGGCA	2	10	118179	118188	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
137	NC_007777	GCCTC	2	10	118884	118893	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
138	NC_007777	GCCTC	2	10	118901	118910	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
139	NC_007777	GCCTC	2	10	118918	118927	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_007777	GCCTC	2	10	118935	118944	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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271	NC_007777	GCGAG	2	10	247558	247567	20 %	0 %	60 %	20 %	86738927
272	NC_007777	ATCCG	2	10	249059	249068	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
273	NC_007777	CCGGA	2	10	249070	249079	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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