MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Frankia sp. CcI3 chromosome

Total Repeats: 18978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007777	CCCG	2	8	1186	1193	0 %	0 %	25 %	75 %	86738725
2	NC_007777	GACC	2	8	1555	1562	25 %	0 %	25 %	50 %	86738725
3	NC_007777	CATG	2	8	1615	1622	25 %	25 %	25 %	25 %	86738725
4	NC_007777	ACGG	2	8	1962	1969	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007777	CCAC	2	8	2176	2183	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_007777	CGCA	2	8	2538	2545	25 %	0 %	25 %	50 %	86738726
7	NC_007777	GCCG	2	8	2555	2562	0 %	0 %	50 %	50 %	86738726
8	NC_007777	GACC	2	8	2997	3004	25 %	0 %	25 %	50 %	86738726
9	NC_007777	GTGG	2	8	3782	3789	0 %	25 %	75 %	0 %	86738727
10	NC_007777	GCCA	2	8	3845	3852	25 %	0 %	25 %	50 %	86738727
11	NC_007777	CGGC	2	8	4322	4329	0 %	0 %	50 %	50 %	86738727
12	NC_007777	GCCA	2	8	4446	4453	25 %	0 %	25 %	50 %	86738727
13	NC_007777	GGTC	2	8	4573	4580	0 %	25 %	50 %	25 %	86738727
14	NC_007777	CCGC	2	8	5113	5120	0 %	0 %	25 %	75 %	86738728
15	NC_007777	CCGG	2	8	5139	5146	0 %	0 %	50 %	50 %	86738728
16	NC_007777	CGGT	2	8	5362	5369	0 %	25 %	50 %	25 %	86738728
17	NC_007777	GCGA	2	8	5421	5428	25 %	0 %	50 %	25 %	86738728
18	NC_007777	GGCC	2	8	5709	5716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007777	GCAT	2	8	6253	6260	25 %	25 %	25 %	25 %	86738729
20	NC_007777	CCCG	2	8	6454	6461	0 %	0 %	25 %	75 %	86738729
21	NC_007777	GGTC	2	8	8002	8009	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007777	CCCG	2	8	8060	8067	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_007777	CCGC	2	8	8515	8522	0 %	0 %	25 %	75 %	86738730
24	NC_007777	GCGG	2	8	8907	8914	0 %	0 %	75 %	25 %	86738730
25	NC_007777	GAGC	2	8	10660	10667	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007777	CCAC	2	8	10699	10706	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_007777	GTGA	2	8	10784	10791	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007777	GCCG	2	8	10884	10891	0 %	0 %	50 %	50 %	86738731
29	NC_007777	GGCC	2	8	10906	10913	0 %	0 %	50 %	50 %	86738731
30	NC_007777	GCCG	2	8	11060	11067	0 %	0 %	50 %	50 %	86738731
31	NC_007777	CGGC	2	8	11181	11188	0 %	0 %	50 %	50 %	86738731
32	NC_007777	CCGC	2	8	11797	11804	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_007777	GCCC	2	8	11866	11873	0 %	0 %	25 %	75 %	86738732
34	NC_007777	GCGG	2	8	12067	12074	0 %	0 %	75 %	25 %	86738732
35	NC_007777	CCGC	3	12	12120	12131	0 %	0 %	25 %	75 %	86738732
36	NC_007777	GACG	2	8	13102	13109	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007777	TGCC	2	8	13424	13431	0 %	25 %	25 %	50 %	86738733
38	NC_007777	GGCG	2	8	14323	14330	0 %	0 %	75 %	25 %	86738733
39	NC_007777	CCGG	2	8	15031	15038	0 %	0 %	50 %	50 %	86738734
40	NC_007777	GGAT	2	8	15475	15482	25 %	25 %	50 %	0 %	86738735
41	NC_007777	GGTC	2	8	15929	15936	0 %	25 %	50 %	25 %	86738735
42	NC_007777	GGCC	2	8	16161	16168	0 %	0 %	50 %	50 %	86738735
43	NC_007777	CGGA	2	8	16334	16341	25 %	0 %	50 %	25 %	86738735
44	NC_007777	CGCC	2	8	16368	16375	0 %	0 %	25 %	75 %	86738735
45	NC_007777	CGGC	2	8	16397	16404	0 %	0 %	50 %	50 %	86738735
46	NC_007777	GCCG	2	8	16759	16766	0 %	0 %	50 %	50 %	86738736
47	NC_007777	ACAG	2	8	17386	17393	50 %	0 %	25 %	25 %	86738737
48	NC_007777	CGAT	2	8	17752	17759	25 %	25 %	25 %	25 %	86738737
49	NC_007777	TTCG	2	8	17922	17929	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007777	GGAT	2	8	18642	18649	25 %	25 %	50 %	0 %	86738738
51	NC_007777	TCGA	2	8	18750	18757	25 %	25 %	25 %	25 %	86738738
52	NC_007777	CGGC	2	8	18801	18808	0 %	0 %	50 %	50 %	86738738
53	NC_007777	GCCT	2	8	18832	18839	0 %	25 %	25 %	50 %	86738738
54	NC_007777	CGCC	2	8	19427	19434	0 %	0 %	25 %	75 %	86738738
55	NC_007777	CCGG	2	8	19886	19893	0 %	0 %	50 %	50 %	86738738
56	NC_007777	GACC	2	8	19944	19951	25 %	0 %	25 %	50 %	86738738
57	NC_007777	CCGC	2	8	20180	20187	0 %	0 %	25 %	75 %	86738738
58	NC_007777	GACG	2	8	20925	20932	25 %	0 %	50 %	25 %	86738739
59	NC_007777	GCCG	2	8	21161	21168	0 %	0 %	50 %	50 %	86738739
60	NC_007777	TCTA	2	8	21387	21394	25 %	50 %	0 %	25 %	86738739
61	NC_007777	GGCT	2	8	21413	21420	0 %	25 %	50 %	25 %	86738739
62	NC_007777	CTGC	2	8	21469	21476	0 %	25 %	25 %	50 %	86738739
63	NC_007777	GCCC	2	8	21652	21659	0 %	0 %	25 %	75 %	86738739
64	NC_007777	GTCA	2	8	21932	21939	25 %	25 %	25 %	25 %	86738739
65	NC_007777	GTGG	2	8	21958	21965	0 %	25 %	75 %	0 %	86738739
66	NC_007777	TGGA	2	8	21997	22004	25 %	25 %	50 %	0 %	86738739
67	NC_007777	GCCG	2	8	22219	22226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007777	TGGC	2	8	22748	22755	0 %	25 %	50 %	25 %	86738740
69	NC_007777	AGCC	2	8	23266	23273	25 %	0 %	25 %	50 %	86738740
70	NC_007777	CGGC	2	8	23274	23281	0 %	0 %	50 %	50 %	86738740
71	NC_007777	GGCT	2	8	23478	23485	0 %	25 %	50 %	25 %	86738740
72	NC_007777	GGCG	2	8	23669	23676	0 %	0 %	75 %	25 %	86738740
73	NC_007777	GGCC	2	8	23807	23814	0 %	0 %	50 %	50 %	86738740
74	NC_007777	CGGC	2	8	24497	24504	0 %	0 %	50 %	50 %	86738740
75	NC_007777	CAGG	2	8	24788	24795	25 %	0 %	50 %	25 %	86738740
76	NC_007777	CCGG	2	8	24990	24997	0 %	0 %	50 %	50 %	86738740
77	NC_007777	GGCT	2	8	25906	25913	0 %	25 %	50 %	25 %	86738741
78	NC_007777	GCAC	2	8	26569	26576	25 %	0 %	25 %	50 %	86738741
79	NC_007777	GTCC	2	8	26633	26640	0 %	25 %	25 %	50 %	86738741
80	NC_007777	CTCG	2	8	27140	27147	0 %	25 %	25 %	50 %	86738741
81	NC_007777	CGGC	2	8	29465	29472	0 %	0 %	50 %	50 %	86738744
82	NC_007777	ACCC	2	8	29679	29686	25 %	0 %	0 %	75 %	86738744
83	NC_007777	GCCC	2	8	29772	29779	0 %	0 %	25 %	75 %	86738744
84	NC_007777	ACCT	2	8	30049	30056	25 %	25 %	0 %	50 %	86738745
85	NC_007777	GACC	2	8	30214	30221	25 %	0 %	25 %	50 %	86738745
86	NC_007777	TCCC	2	8	30423	30430	0 %	25 %	0 %	75 %	86738745
87	NC_007777	CCGC	2	8	30656	30663	0 %	0 %	25 %	75 %	86738745
88	NC_007777	CCCG	2	8	30766	30773	0 %	0 %	25 %	75 %	86738745
89	NC_007777	GGCC	2	8	30861	30868	0 %	0 %	50 %	50 %	86738745
90	NC_007777	CCGT	2	8	30999	31006	0 %	25 %	25 %	50 %	86738746
91	NC_007777	CGCC	2	8	31222	31229	0 %	0 %	25 %	75 %	86738746
92	NC_007777	AGGA	2	8	31698	31705	50 %	0 %	50 %	0 %	86738746
93	NC_007777	ACGA	2	8	32044	32051	50 %	0 %	25 %	25 %	86738747
94	NC_007777	TCCC	2	8	32430	32437	0 %	25 %	0 %	75 %	86738748
95	NC_007777	CTTC	2	8	33097	33104	0 %	50 %	0 %	50 %	86738750
96	NC_007777	CCGG	2	8	33355	33362	0 %	0 %	50 %	50 %	86738750
97	NC_007777	CTTC	2	8	33707	33714	0 %	50 %	0 %	50 %	86738750
98	NC_007777	CTTC	2	8	34196	34203	0 %	50 %	0 %	50 %	86738750
99	NC_007777	AGGA	2	8	34450	34457	50 %	0 %	50 %	0 %	86738750
100	NC_007777	CGTC	2	8	34898	34905	0 %	25 %	25 %	50 %	86738751
101	NC_007777	CGAC	2	8	35100	35107	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007777	CGGT	2	8	35524	35531	0 %	25 %	50 %	25 %	86738752
103	NC_007777	GGGT	2	8	35680	35687	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007777	GCGG	2	8	35703	35710	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_007777	GACG	2	8	36204	36211	25 %	0 %	50 %	25 %	86738753
106	NC_007777	GCCG	2	8	36272	36279	0 %	0 %	50 %	50 %	86738753
107	NC_007777	GGCC	2	8	37371	37378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_007777	CGGG	2	8	37595	37602	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_007777	CGCC	2	8	38643	38650	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
110	NC_007777	CGGT	2	8	38829	38836	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007777	GGAA	2	8	39382	39389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007777	TCCG	2	8	39500	39507	0 %	25 %	25 %	50 %	86738756
113	NC_007777	CCCG	2	8	40024	40031	0 %	0 %	25 %	75 %	86738757
114	NC_007777	CGGC	2	8	40076	40083	0 %	0 %	50 %	50 %	86738757
115	NC_007777	GCCG	2	8	40125	40132	0 %	0 %	50 %	50 %	86738757
116	NC_007777	TCCA	2	8	40631	40638	25 %	25 %	0 %	50 %	86738757
117	NC_007777	AGCC	2	8	41170	41177	25 %	0 %	25 %	50 %	86738757
118	NC_007777	CCGA	2	8	41374	41381	25 %	0 %	25 %	50 %	86738757
119	NC_007777	CGCC	2	8	41489	41496	0 %	0 %	25 %	75 %	86738757
120	NC_007777	GCCG	2	8	41911	41918	0 %	0 %	50 %	50 %	86738757
121	NC_007777	CTGG	2	8	41994	42001	0 %	25 %	50 %	25 %	86738757
122	NC_007777	CCGG	2	8	42441	42448	0 %	0 %	50 %	50 %	86738758
123	NC_007777	GCCA	2	8	42539	42546	25 %	0 %	25 %	50 %	86738758
124	NC_007777	TCGA	2	8	42706	42713	25 %	25 %	25 %	25 %	86738758
125	NC_007777	AGGT	2	8	42910	42917	25 %	25 %	50 %	0 %	86738758
126	NC_007777	CCCG	2	8	43761	43768	0 %	0 %	25 %	75 %	86738759
127	NC_007777	GCCG	3	12	43895	43906	0 %	0 %	50 %	50 %	86738759
128	NC_007777	TGGC	2	8	45091	45098	0 %	25 %	50 %	25 %	86738760
129	NC_007777	CGGG	2	8	45640	45647	0 %	0 %	75 %	25 %	86738760
130	NC_007777	GACG	2	8	45674	45681	25 %	0 %	50 %	25 %	86738760
131	NC_007777	CCGC	2	8	45861	45868	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_007777	CGGC	2	8	47563	47570	0 %	0 %	50 %	50 %	86738762
133	NC_007777	CGGC	2	8	47694	47701	0 %	0 %	50 %	50 %	86738762
134	NC_007777	CGGC	2	8	47712	47719	0 %	0 %	50 %	50 %	86738762
135	NC_007777	GACG	2	8	47770	47777	25 %	0 %	50 %	25 %	86738762
136	NC_007777	GCCG	2	8	47845	47852	0 %	0 %	50 %	50 %	86738762
137	NC_007777	TCGG	2	8	47900	47907	0 %	25 %	50 %	25 %	86738762
138	NC_007777	GGCA	2	8	48013	48020	25 %	0 %	50 %	25 %	86738762
139	NC_007777	GCCG	2	8	48200	48207	0 %	0 %	50 %	50 %	86738762
140	NC_007777	CGGC	2	8	48260	48267	0 %	0 %	50 %	50 %	86738762
141	NC_007777	CGTA	2	8	48575	48582	25 %	25 %	25 %	25 %	86738762
142	NC_007777	TTAC	2	8	48790	48797	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_007777	GGGT	2	8	48881	48888	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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