MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Frankia sp. CcI3 chromosome

Total Repeats: 149059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007777	GAG	2	6	24	29	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007777	CAG	2	6	161	166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738725
3	NC_007777	CTG	2	6	218	223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738725
4	NC_007777	CTT	2	6	274	279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86738725
5	NC_007777	ACACC	2	10	405	414	40 %	0 %	0 %	60 %	86738725
6	NC_007777	GCC	2	6	482	487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738725
7	NC_007777	GCC	2	6	499	504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738725
8	NC_007777	TCG	2	6	518	523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738725
9	NC_007777	CGGTGC	2	12	525	536	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86738725
10	NC_007777	CCGGCA	2	12	542	553	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	86738725
11	NC_007777	GCC	2	6	559	564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738725
12	NC_007777	CGG	2	6	570	575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738725
13	NC_007777	ACC	2	6	622	627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86738725
14	NC_007777	GCG	2	6	659	664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738725
15	NC_007777	GAG	2	6	911	916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86738725
16	NC_007777	TCA	2	6	930	935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86738725
17	NC_007777	GAC	2	6	947	952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738725
18	NC_007777	CAG	2	6	956	961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738725
19	NC_007777	GCG	2	6	970	975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738725
20	NC_007777	GAC	2	6	1004	1009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738725
21	NC_007777	AGG	2	6	1041	1046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86738725
22	NC_007777	TTC	2	6	1049	1054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86738725
23	NC_007777	ACG	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738725
24	NC_007777	GGA	2	6	1135	1140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86738725
25	NC_007777	TGA	2	6	1170	1175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86738725
26	NC_007777	CCCG	2	8	1186	1193	0 %	0 %	25 %	75 %	86738725
27	NC_007777	GAA	2	6	1222	1227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86738725
28	NC_007777	GGC	2	6	1228	1233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738725
29	NC_007777	TGC	2	6	1386	1391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738725
30	NC_007777	GCC	3	9	1430	1438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738725
31	NC_007777	CGG	2	6	1452	1457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738725
32	NC_007777	GGA	2	6	1477	1482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86738725
33	NC_007777	GACC	2	8	1555	1562	25 %	0 %	25 %	50 %	86738725
34	NC_007777	ACG	2	6	1607	1612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738725
35	NC_007777	CATG	2	8	1615	1622	25 %	25 %	25 %	25 %	86738725
36	NC_007777	GC	3	6	1657	1662	0 %	0 %	50 %	50 %	86738725
37	NC_007777	CCG	2	6	1743	1748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_007777	CAC	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_007777	CGC	2	6	1757	1762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_007777	CCA	2	6	1763	1768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_007777	CCG	2	6	1769	1774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_007777	GCA	2	6	1776	1781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007777	CCG	2	6	1785	1790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_007777	GCA	2	6	1792	1797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007777	CCG	2	6	1801	1806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_007777	GCA	2	6	1808	1813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007777	TCC	2	6	1818	1823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_007777	C	6	6	1829	1834	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_007777	GCC	2	6	1863	1868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_007777	CGC	2	6	1922	1927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_007777	ACGG	2	8	1962	1969	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007777	GAC	2	6	1985	1990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007777	GGT	2	6	2007	2012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007777	GC	3	6	2160	2165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007777	CCAC	2	8	2176	2183	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_007777	CAA	2	6	2199	2204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007777	CTA	3	9	2252	2260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007777	TCG	2	6	2397	2402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007777	CTG	2	6	2407	2412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007777	AAC	2	6	2456	2461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007777	AGG	2	6	2475	2480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007777	CGCA	2	8	2538	2545	25 %	0 %	25 %	50 %	86738726
63	NC_007777	GCCG	2	8	2555	2562	0 %	0 %	50 %	50 %	86738726
64	NC_007777	ACC	2	6	2563	2568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86738726
65	NC_007777	CTC	2	6	2593	2598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86738726
66	NC_007777	GACCG	2	10	2604	2613	20 %	0 %	40 %	40 %	86738726
67	NC_007777	CGC	2	6	2625	2630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738726
68	NC_007777	GCC	2	6	2647	2652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738726
69	NC_007777	GGA	2	6	2679	2684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86738726
70	NC_007777	TGC	2	6	2816	2821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738726
71	NC_007777	GAC	2	6	2827	2832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738726
72	NC_007777	CGC	2	6	2889	2894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738726
73	NC_007777	GAC	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738726
74	NC_007777	ATCGAG	2	12	2962	2973	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86738726
75	NC_007777	CGC	2	6	2991	2996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738726
76	NC_007777	GACC	2	8	2997	3004	25 %	0 %	25 %	50 %	86738726
77	NC_007777	GGC	2	6	3035	3040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738726
78	NC_007777	GCC	2	6	3052	3057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738726
79	NC_007777	C	6	6	3093	3098	0 %	0 %	0 %	100 %	86738726
80	NC_007777	GAC	3	9	3249	3257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738726
81	NC_007777	AGG	2	6	3347	3352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86738726
82	NC_007777	CGC	2	6	3375	3380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738726
83	NC_007777	ACC	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86738726
84	NC_007777	ACG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738726
85	NC_007777	CGT	2	6	3515	3520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738726
86	NC_007777	CGT	2	6	3555	3560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738726
87	NC_007777	GGA	2	6	3582	3587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86738726
88	NC_007777	CGG	2	6	3590	3595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738726
89	NC_007777	GGC	2	6	3597	3602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738726
90	NC_007777	CGA	3	9	3633	3641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738726
91	NC_007777	CTG	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738726
92	NC_007777	TCG	2	6	3720	3725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738727
93	NC_007777	GTGG	2	8	3782	3789	0 %	25 %	75 %	0 %	86738727
94	NC_007777	GCCA	2	8	3845	3852	25 %	0 %	25 %	50 %	86738727
95	NC_007777	TGG	2	6	3942	3947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86738727
96	NC_007777	AGATCG	2	12	3948	3959	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86738727
97	NC_007777	TCG	2	6	4020	4025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738727
98	NC_007777	CTG	2	6	4028	4033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738727
99	NC_007777	GGA	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86738727
100	NC_007777	CGT	2	6	4091	4096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738727
101	NC_007777	CGA	2	6	4105	4110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738727
102	NC_007777	GCT	2	6	4111	4116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738727
103	NC_007777	AAC	2	6	4173	4178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86738727
104	NC_007777	CCG	2	6	4197	4202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738727
105	NC_007777	G	6	6	4220	4225	0 %	0 %	100 %	0 %	86738727
106	NC_007777	CG	3	6	4294	4299	0 %	0 %	50 %	50 %	86738727
107	NC_007777	TCG	2	6	4308	4313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738727
108	NC_007777	CGGC	2	8	4322	4329	0 %	0 %	50 %	50 %	86738727
109	NC_007777	GCCA	2	8	4446	4453	25 %	0 %	25 %	50 %	86738727
110	NC_007777	AGC	2	6	4455	4460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738727
111	NC_007777	CGG	2	6	4482	4487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738727
112	NC_007777	GCC	2	6	4535	4540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738727
113	NC_007777	GGTC	2	8	4573	4580	0 %	25 %	50 %	25 %	86738727
114	NC_007777	CGA	2	6	4588	4593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738727
115	NC_007777	CCCTCG	2	12	4656	4667	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	86738727
116	NC_007777	CTG	2	6	4691	4696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738727
117	NC_007777	GAC	2	6	4730	4735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738727
118	NC_007777	CGC	3	9	4757	4765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738727
119	NC_007777	TCG	2	6	4782	4787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738727
120	NC_007777	GGA	2	6	4871	4876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86738727
121	NC_007777	CG	3	6	5072	5077	0 %	0 %	50 %	50 %	86738728
122	NC_007777	CCGC	2	8	5113	5120	0 %	0 %	25 %	75 %	86738728
123	NC_007777	CCGG	2	8	5139	5146	0 %	0 %	50 %	50 %	86738728
124	NC_007777	CGG	2	6	5186	5191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738728
125	NC_007777	GGC	2	6	5235	5240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738728
126	NC_007777	CGG	2	6	5277	5282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738728
127	NC_007777	GAC	2	6	5295	5300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738728
128	NC_007777	CCG	2	6	5309	5314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738728
129	NC_007777	CGCCC	2	10	5333	5342	0 %	0 %	20 %	80 %	86738728
130	NC_007777	CGGT	2	8	5362	5369	0 %	25 %	50 %	25 %	86738728
131	NC_007777	GCT	2	6	5390	5395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738728
132	NC_007777	GGC	2	6	5396	5401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738728
133	NC_007777	GCGA	2	8	5421	5428	25 %	0 %	50 %	25 %	86738728
134	NC_007777	TCG	2	6	5458	5463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738728
135	NC_007777	CTC	2	6	5574	5579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86738728
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137	NC_007777	TCG	2	6	5623	5628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738728
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