MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis SCHU S4 chromosome

Total Repeats: 1487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006570	AAGAA	2	10	1226	1235	80 %	0 %	20 %	0 %	56707188
2	NC_006570	CATCT	2	10	3558	3567	20 %	40 %	0 %	40 %	56707190
3	NC_006570	TTCTT	2	10	3630	3639	0 %	80 %	0 %	20 %	56707190
4	NC_006570	AATCA	2	10	4443	4452	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_006570	ATGGT	2	10	4477	4486	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006570	ATTAA	2	10	4629	4638	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006570	TTTGC	2	10	4736	4745	0 %	60 %	20 %	20 %	56707191
8	NC_006570	CGTAC	2	10	4880	4889	20 %	20 %	20 %	40 %	56707191
9	NC_006570	TTCAA	2	10	5251	5260	40 %	40 %	0 %	20 %	56707191
10	NC_006570	TTGCG	2	10	5339	5348	0 %	40 %	40 %	20 %	56707191
11	NC_006570	TAGCT	2	10	5904	5913	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_006570	ATGCA	2	10	7386	7395	40 %	20 %	20 %	20 %	56707192
13	NC_006570	AAAGA	2	10	8698	8707	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006570	TTTCT	2	10	11649	11658	0 %	80 %	0 %	20 %	56707193
15	NC_006570	AAATA	2	10	11737	11746	80 %	20 %	0 %	0 %	56707193
16	NC_006570	ACAGT	2	10	13710	13719	40 %	20 %	20 %	20 %	56707195
17	NC_006570	CTTTT	2	10	14499	14508	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_006570	TAATG	2	10	14615	14624	40 %	40 %	20 %	0 %	56707196
19	NC_006570	TAGGT	2	10	16928	16937	20 %	40 %	40 %	0 %	56707198
20	NC_006570	TTTGA	2	10	17926	17935	20 %	60 %	20 %	0 %	56707199
21	NC_006570	TAGAT	2	10	18200	18209	40 %	40 %	20 %	0 %	56707200
22	NC_006570	GATTA	2	10	20040	20049	40 %	40 %	20 %	0 %	56707201
23	NC_006570	GATGT	2	10	20196	20205	20 %	40 %	40 %	0 %	56707201
24	NC_006570	GATTT	2	10	21871	21880	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006570	ATTTT	2	10	22304	22313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006570	ATTAA	2	10	24591	24600	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006570	GTATG	2	10	26120	26129	20 %	40 %	40 %	0 %	56707207
28	NC_006570	GCTAA	2	10	27329	27338	40 %	20 %	20 %	20 %	56707208
29	NC_006570	ATTCT	2	10	30000	30009	20 %	60 %	0 %	20 %	56707209
30	NC_006570	GTTTT	2	10	30245	30254	0 %	80 %	20 %	0 %	56707209
31	NC_006570	CAAGG	2	10	33253	33262	40 %	0 %	40 %	20 %	56707214
32	NC_006570	ACCAA	2	10	35809	35818	60 %	0 %	0 %	40 %	56707217
33	NC_006570	TACAG	2	10	39231	39240	40 %	20 %	20 %	20 %	56707219
34	NC_006570	ATTTT	2	10	39644	39653	20 %	80 %	0 %	0 %	56707220
35	NC_006570	ATTTT	2	10	40068	40077	20 %	80 %	0 %	0 %	56707220
36	NC_006570	TATTC	2	10	43213	43222	20 %	60 %	0 %	20 %	56707223
37	NC_006570	TAGTT	2	10	44568	44577	20 %	60 %	20 %	0 %	56707224
38	NC_006570	AAGCT	2	10	45878	45887	40 %	20 %	20 %	20 %	56707225
39	NC_006570	GATTT	2	10	46139	46148	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006570	TTGGT	2	10	46340	46349	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006570	GATAG	2	10	47038	47047	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006570	TTAAT	2	10	47441	47450	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006570	AAAAT	2	10	49592	49601	80 %	20 %	0 %	0 %	56707228
44	NC_006570	TAATT	2	10	50622	50631	40 %	60 %	0 %	0 %	56707228
45	NC_006570	TGAAA	2	10	52934	52943	60 %	20 %	20 %	0 %	56707229
46	NC_006570	TAAAT	2	10	54434	54443	60 %	40 %	0 %	0 %	56707231
47	NC_006570	CAAAC	2	10	55558	55567	60 %	0 %	0 %	40 %	56707232
48	NC_006570	GCAAA	2	10	56606	56615	60 %	0 %	20 %	20 %	56707233
49	NC_006570	TTTAG	2	10	57513	57522	20 %	60 %	20 %	0 %	56707234
50	NC_006570	AAACA	2	10	58176	58185	80 %	0 %	0 %	20 %	56707234
51	NC_006570	TAAGA	2	10	59166	59175	60 %	20 %	20 %	0 %	56707235
52	NC_006570	AATTT	2	10	59575	59584	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006570	AATAA	2	10	60102	60111	80 %	20 %	0 %	0 %	56707237
54	NC_006570	TACTG	2	10	62601	62610	20 %	40 %	20 %	20 %	56707241
55	NC_006570	GTGAA	2	10	63280	63289	40 %	20 %	40 %	0 %	56707241
56	NC_006570	GTGCA	2	10	65868	65877	20 %	20 %	40 %	20 %	56707243
57	NC_006570	GCATA	2	10	66291	66300	40 %	20 %	20 %	20 %	56707244
58	NC_006570	ATAAA	2	10	68355	68364	80 %	20 %	0 %	0 %	56707245
59	NC_006570	TATCT	2	10	71976	71985	20 %	60 %	0 %	20 %	56707249
60	NC_006570	AAAAT	2	10	72289	72298	80 %	20 %	0 %	0 %	56707250
61	NC_006570	TCACT	2	10	74218	74227	20 %	40 %	0 %	40 %	56707251
62	NC_006570	TTATC	2	10	74365	74374	20 %	60 %	0 %	20 %	56707252
63	NC_006570	AAGAA	2	10	76048	76057	80 %	0 %	20 %	0 %	56707253
64	NC_006570	ATAGA	2	10	77743	77752	60 %	20 %	20 %	0 %	56707255
65	NC_006570	TAATG	2	10	77990	77999	40 %	40 %	20 %	0 %	56707255
66	NC_006570	ACTCT	2	10	79174	79183	20 %	40 %	0 %	40 %	56707255
67	NC_006570	TAAAT	2	10	79998	80007	60 %	40 %	0 %	0 %	56707255
68	NC_006570	GAACC	2	10	83301	83310	40 %	0 %	20 %	40 %	56707258
69	NC_006570	GTCTT	2	10	84350	84359	0 %	60 %	20 %	20 %	56707260
70	NC_006570	AAACT	2	10	85571	85580	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_006570	TTTGA	2	10	86247	86256	20 %	60 %	20 %	0 %	56707262
72	NC_006570	GTATT	2	10	87421	87430	20 %	60 %	20 %	0 %	56707263
73	NC_006570	TTTAT	2	10	88685	88694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006570	TAGTA	2	10	89849	89858	40 %	40 %	20 %	0 %	56707265
75	NC_006570	TGATA	2	10	91674	91683	40 %	40 %	20 %	0 %	56707266
76	NC_006570	ATAGA	2	10	91757	91766	60 %	20 %	20 %	0 %	56707266
77	NC_006570	ATTAG	2	10	92311	92320	40 %	40 %	20 %	0 %	56707266
78	NC_006570	GTTTT	2	10	92917	92926	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006570	TATCA	2	10	93766	93775	40 %	40 %	0 %	20 %	56707267
80	NC_006570	AATGT	2	10	96724	96733	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006570	AATAT	2	10	96753	96762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006570	TTAAC	2	10	97449	97458	40 %	40 %	0 %	20 %	56707269
83	NC_006570	GTCAA	2	10	97591	97600	40 %	20 %	20 %	20 %	56707269
84	NC_006570	CAGAT	2	10	100492	100501	40 %	20 %	20 %	20 %	56707272
85	NC_006570	CATCT	2	10	102569	102578	20 %	40 %	0 %	40 %	56707274
86	NC_006570	TTCTT	2	10	102641	102650	0 %	80 %	0 %	20 %	56707274
87	NC_006570	TTTCT	2	10	103733	103742	0 %	80 %	0 %	20 %	56707275
88	NC_006570	ATTTA	2	10	104837	104846	40 %	60 %	0 %	0 %	56707276
89	NC_006570	CATAT	2	10	105083	105092	40 %	40 %	0 %	20 %	56707276
90	NC_006570	CATTT	2	10	105239	105248	20 %	60 %	0 %	20 %	56707276
91	NC_006570	ACAAT	2	10	105440	105449	60 %	20 %	0 %	20 %	56707276
92	NC_006570	TTGAT	2	10	105641	105650	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006570	AAACT	2	10	108577	108586	60 %	20 %	0 %	20 %	56707278
94	NC_006570	TTCAT	2	10	110009	110018	20 %	60 %	0 %	20 %	56707279
95	NC_006570	AGCAC	2	10	110909	110918	40 %	0 %	20 %	40 %	56707279
96	NC_006570	CTCTA	2	10	111535	111544	20 %	40 %	0 %	40 %	56707279
97	NC_006570	AAACT	2	10	111681	111690	60 %	20 %	0 %	20 %	56707279
98	NC_006570	TTTTC	2	10	115121	115130	0 %	80 %	0 %	20 %	56707282
99	NC_006570	GTTTG	2	10	115154	115163	0 %	60 %	40 %	0 %	56707282
100	NC_006570	TAAAA	2	10	117354	117363	80 %	20 %	0 %	0 %	56707284
101	NC_006570	CAAGC	2	10	119185	119194	40 %	0 %	20 %	40 %	56707285
102	NC_006570	GCTTT	2	10	119284	119293	0 %	60 %	20 %	20 %	56707285
103	NC_006570	CAAAA	2	10	122694	122703	80 %	0 %	0 %	20 %	56707287
104	NC_006570	TTTTA	2	10	124962	124971	20 %	80 %	0 %	0 %	56707289
105	NC_006570	TGTAT	2	10	125493	125502	20 %	60 %	20 %	0 %	56707290
106	NC_006570	TGCAA	2	10	125961	125970	40 %	20 %	20 %	20 %	56707290
107	NC_006570	GTATT	2	10	130765	130774	20 %	60 %	20 %	0 %	56707294
108	NC_006570	GTATG	2	10	134986	134995	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006570	GGTGT	2	10	136228	136237	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006570	ATTAC	2	10	140004	140013	40 %	40 %	0 %	20 %	56707299
111	NC_006570	CTGGT	2	10	142351	142360	0 %	40 %	40 %	20 %	56707301
112	NC_006570	CATCT	2	10	143921	143930	20 %	40 %	0 %	40 %	56707302
113	NC_006570	TTCTT	2	10	143993	144002	0 %	80 %	0 %	20 %	56707302
114	NC_006570	ATCTT	2	10	144924	144933	20 %	60 %	0 %	20 %	56707303
115	NC_006570	CTTAT	2	10	146251	146260	20 %	60 %	0 %	20 %	56707304
116	NC_006570	CTAGT	2	10	147822	147831	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_006570	AAATC	2	10	148254	148263	60 %	20 %	0 %	20 %	56707306
118	NC_006570	GGTAA	2	10	153471	153480	40 %	20 %	40 %	0 %	56707311
119	NC_006570	AATGA	2	10	153916	153925	60 %	20 %	20 %	0 %	56707312
120	NC_006570	TTCCT	2	10	156934	156943	0 %	60 %	0 %	40 %	56707314
121	NC_006570	CTAAG	2	10	160202	160211	40 %	20 %	20 %	20 %	56707315
122	NC_006570	TACAT	2	10	160335	160344	40 %	40 %	0 %	20 %	56707315
123	NC_006570	CTATA	2	10	160582	160591	40 %	40 %	0 %	20 %	56707315
124	NC_006570	GTGAT	2	10	162089	162098	20 %	40 %	40 %	0 %	56707315
125	NC_006570	ATGGT	2	10	162500	162509	20 %	40 %	40 %	0 %	56707315
126	NC_006570	TTTAT	2	10	168728	168737	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006570	ACTAC	2	10	168930	168939	40 %	20 %	0 %	40 %	56707322
128	NC_006570	TGCTA	2	10	169243	169252	20 %	40 %	20 %	20 %	56707322
129	NC_006570	AGAGA	2	10	169830	169839	60 %	0 %	40 %	0 %	56707323
130	NC_006570	AGCTA	2	10	170358	170367	40 %	20 %	20 %	20 %	56707324
131	NC_006570	TAAAA	2	10	173746	173755	80 %	20 %	0 %	0 %	56707328
132	NC_006570	AGCTA	2	10	174582	174591	40 %	20 %	20 %	20 %	56707329
133	NC_006570	AGTAA	2	10	174772	174781	60 %	20 %	20 %	0 %	56707329
134	NC_006570	GCATG	2	10	176653	176662	20 %	20 %	40 %	20 %	56707332
135	NC_006570	TACCT	2	10	177169	177178	20 %	40 %	0 %	40 %	56707333
136	NC_006570	GATGA	2	10	178738	178747	40 %	20 %	40 %	0 %	56707333
137	NC_006570	CAAAA	2	10	179469	179478	80 %	0 %	0 %	20 %	56707334
138	NC_006570	GTAAT	2	10	180937	180946	40 %	40 %	20 %	0 %	56707335
139	NC_006570	TTTTC	2	10	181340	181349	0 %	80 %	0 %	20 %	56707335
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141	NC_006570	TTACT	2	10	181737	181746	20 %	60 %	0 %	20 %	56707336
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143	NC_006570	TAAAA	2	10	182571	182580	80 %	20 %	0 %	0 %	56707337
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256	NC_006570	TAATA	2	10	337679	337688	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_006570	TGAGA	2	10	339852	339861	40 %	20 %	40 %	0 %	56707481
258	NC_006570	GATCA	2	10	340509	340518	40 %	20 %	20 %	20 %	56707483
259	NC_006570	GAAAA	2	10	341883	341892	80 %	0 %	20 %	0 %	56707486
260	NC_006570	ATTTT	2	10	342354	342363	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_006570	TTATT	2	10	346984	346993	20 %	80 %	0 %	0 %	56707498
262	NC_006570	ATCCT	2	10	350331	350340	20 %	40 %	0 %	40 %	56707503
263	NC_006570	ATTTC	2	10	351071	351080	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
264	NC_006570	AAAGA	2	10	351553	351562	80 %	0 %	20 %	0 %	56707505
265	NC_006570	AGAAA	2	10	352177	352186	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
266	NC_006570	TCAAT	2	10	352822	352831	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
267	NC_006570	CATTA	2	10	353011	353020	40 %	40 %	0 %	20 %	56707506
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269	NC_006570	CATCT	2	10	354559	354568	20 %	40 %	0 %	40 %	56707507
270	NC_006570	TTCTT	2	10	354631	354640	0 %	80 %	0 %	20 %	56707507
271	NC_006570	CTTTT	2	10	357044	357053	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
272	NC_006570	CATCT	2	10	357715	357724	20 %	40 %	0 %	40 %	56707509
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