MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Exiguobacterium sp. MH3

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022794	TCTTTT	2	12	11967	11978	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022794	AAGTAG	2	12	20128	20139	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022794	TTTCGT	2	12	167836	167847	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022794	AAACGT	2	12	192378	192389	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022794	TATAAG	2	12	303704	303715	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022794	TCGCTC	2	12	313483	313494	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022794	AAAACG	2	12	397404	397415	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022794	ATTTAA	2	12	439753	439764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022794	GAGTCT	2	12	508725	508736	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_022794	AAGTGA	2	12	511051	511062	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022794	TGATAA	2	12	521860	521871	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022794	TATGAA	2	12	544916	544927	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022794	AATTTA	2	12	548415	548426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022794	ACCCGA	2	12	589148	589159	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022794	AGAATG	2	12	645475	645486	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022794	GACTCC	2	12	869012	869023	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022794	ATCTAA	2	12	875927	875938	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022794	TGTTTA	2	12	877818	877829	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022794	AGTAAG	2	12	880390	880401	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022794	TTCGAT	2	12	925975	925986	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022794	AATTAA	2	12	944610	944621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022794	TCGACG	2	12	944745	944756	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022794	TGGGGG	2	12	964490	964501	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022794	TGAAAT	2	12	985384	985395	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022794	TAGAAA	2	12	1002960	1002971	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022794	TTTTTC	2	12	1016980	1016991	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022794	GAAAAG	2	12	1069520	1069531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022794	TACGCA	2	12	1131295	1131306	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022794	GCATCT	2	12	1148737	1148748	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022794	GATGCG	2	12	1148759	1148770	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022794	ACTAGA	2	12	1148879	1148890	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_022794	GAATGA	2	12	1178522	1178533	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022794	GATGGT	2	12	1197160	1197171	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022794	CGAAAT	2	12	1256496	1256507	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_022794	AGAAAA	2	12	1271481	1271492	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022794	ATTTCA	2	12	1293641	1293652	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022794	TTCCCT	2	12	1333665	1333676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_022794	AATCAA	2	12	1346476	1346487	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022794	TTTTTA	2	12	1359967	1359978	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022794	ACAAGG	2	12	1371069	1371080	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022794	ACTATG	2	12	1380689	1380700	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022794	GATACC	2	12	1390950	1390961	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022794	ATTTTT	2	12	1432066	1432077	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022794	TTGAAA	2	12	1449104	1449115	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022794	AGAAAG	2	12	1464447	1464458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022794	TTTCGT	2	12	1473406	1473417	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022794	GACGAT	2	12	1476008	1476019	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_022794	GGAGAC	2	12	1486574	1486585	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_022794	AAAATA	2	12	1492895	1492906	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022794	ACTTTA	2	12	1495178	1495189	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_022794	ATTTTA	2	12	1668062	1668073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022794	ACTATG	2	12	1668083	1668094	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_022794	AATTAA	2	12	1709521	1709532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022794	TGTTTT	2	12	1749948	1749959	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022794	TTGAAT	2	12	1757121	1757132	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022794	AAATGT	2	12	1764889	1764900	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022794	TCCTTC	2	12	1837110	1837121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_022794	CTGTCC	2	12	1848859	1848870	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_022794	TATCAC	2	12	1895105	1895116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022794	TCTGCT	2	12	1953377	1953388	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022794	TCGAGT	2	12	1954478	1954489	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_022794	GGTCGG	2	12	1954818	1954829	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022794	AGTCGC	2	12	2016338	2016349	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_022794	ATTTCA	2	12	2087493	2087504	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_022794	TCTTTT	2	12	2091042	2091053	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_022794	AAATAA	2	12	2249275	2249286	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022794	GGAAGA	2	12	2412745	2412756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022794	GATAAG	2	12	2451457	2451468	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022794	CGGTCT	2	12	2480860	2480871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022794	CCACGT	2	12	2537701	2537712	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022794	TGATCT	2	12	2569545	2569556	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022794	TTTATT	2	12	2586621	2586632	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022794	TTTATT	2	12	2599848	2599859	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022794	CGAATA	2	12	2659502	2659513	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022794	GAATAC	2	12	2683490	2683501	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_022794	TCTTTT	2	12	2697108	2697119	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_022794	ATAAAA	2	12	2698849	2698860	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022794	TTTTTA	2	12	2705309	2705320	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022794	TTCCGT	2	12	2729190	2729201	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022794	TTCTTT	2	12	2768487	2768498	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_022794	TCCCCT	2	12	2776100	2776111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_022794	TAAATT	2	12	2789890	2789901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022794	TTTCCT	2	12	2818092	2818103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_022794	ATCATT	2	12	2858673	2858684	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_022794	ATGAAG	2	12	2892384	2892395	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022794	TCTTTA	2	12	2937689	2937700	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_022794	GAAAGA	2	12	2951639	2951650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022794	ACAATA	2	12	3012427	3012438	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_022794	TACAAC	2	12	3069874	3069885	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022794	GAAAAA	2	12	3089287	3089298	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022794	CGACAC	2	12	3120771	3120782	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_022794	AAAAGA	2	12	3127290	3127301	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022794	ATTTTT	2	12	3152553	3152564	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.