MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli JJ1886

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022648	GAAAAT	2	12	10500	10511	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022648	AAGGGA	2	12	93149	93160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022648	ATTGTT	2	12	160858	160869	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022648	TATGAA	2	12	169530	169541	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022648	ATTTAA	2	12	170290	170301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022648	GTAGTG	2	12	217610	217621	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022648	CTTTTC	2	12	262098	262109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022648	TTTTCT	2	12	352858	352869	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022648	CTATTT	2	12	353895	353906	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_022648	GTCACT	2	12	357396	357407	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022648	AATTTC	2	12	360616	360627	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022648	TGTCTG	2	12	370541	370552	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022648	TGAGGT	2	12	370734	370745	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022648	TTTATT	2	12	382613	382624	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022648	AACAAT	2	12	434144	434155	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022648	TATTGA	2	12	436990	437001	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022648	CAGGCG	2	12	517811	517822	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022648	TGCAAA	2	12	623605	623616	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022648	ATTTTT	2	12	724490	724501	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022648	TTTACC	2	12	735402	735413	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022648	AAGTGA	2	12	773414	773425	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022648	TTTTCT	2	12	803993	804004	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022648	AAAAAC	2	12	857288	857299	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_022648	TTCATT	2	12	921531	921542	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022648	TAACCG	2	12	929361	929372	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022648	ATGGCA	2	12	954073	954084	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022648	AAATAA	2	12	996647	996658	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022648	CTGGAA	2	12	1045815	1045826	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022648	AAAGAT	2	12	1068609	1068620	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022648	TAAGGA	2	12	1104357	1104368	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022648	ATAATG	2	12	1105772	1105783	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022648	CAGCCC	2	12	1119557	1119568	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_022648	TGGTAA	2	12	1129455	1129466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022648	TGTTAA	2	12	1138005	1138016	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022648	CAAAAA	2	12	1181612	1181623	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022648	TTTCTG	2	12	1274117	1274128	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022648	AAAATG	2	12	1302696	1302707	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022648	GGTGAA	2	12	1314182	1314193	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022648	CCATTG	2	12	1363887	1363898	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022648	CTTATT	2	12	1415508	1415519	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022648	GATCAA	2	12	1421585	1421596	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022648	CAAAAG	2	12	1422559	1422570	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022648	CTGATC	2	12	1433037	1433048	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022648	CTTTTT	2	12	1468588	1468599	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_022648	TATAAC	2	12	1543940	1543951	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022648	TAAATT	2	12	1589866	1589877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022648	CGTTGT	2	12	1674179	1674190	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_022648	ACCGTT	2	12	1680362	1680373	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022648	CAAAAA	2	12	1719714	1719725	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022648	GCGAAG	2	12	1763278	1763289	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_022648	ATACTT	2	12	1806037	1806048	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022648	AAAATA	2	12	1819695	1819706	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022648	TGTTTT	2	12	1820328	1820339	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022648	AAGACT	2	12	1820588	1820599	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022648	TATTAC	2	12	1934095	1934106	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022648	TTTCTT	2	12	1946548	1946559	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_022648	ACTGTC	2	12	1994148	1994159	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022648	AATTCA	2	12	2041619	2041630	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_022648	TTCTGA	2	12	2043203	2043214	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_022648	ACCGGA	2	12	2066947	2066958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022648	TACAAA	2	12	2083602	2083613	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_022648	TCTTAT	2	12	2098035	2098046	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022648	GTGTAT	2	12	2110117	2110128	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022648	CGTCAG	2	12	2167945	2167956	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_022648	ATTTTT	2	12	2223975	2223986	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022648	CTGATA	2	12	2233065	2233076	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022648	GAAAAC	2	12	2258870	2258881	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022648	GCATGA	2	12	2266008	2266019	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022648	TGATAA	2	12	2304779	2304790	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022648	TTTTGT	2	12	2323062	2323073	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022648	CCTTAC	2	12	2406144	2406155	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_022648	TCTTCC	2	12	2464625	2464636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_022648	TAAATG	2	12	2599981	2599992	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022648	TGTCAC	2	12	2613615	2613626	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_022648	AGCGGA	2	12	2615776	2615787	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_022648	AGAAAA	2	12	2622919	2622930	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022648	CTGATG	2	12	2689509	2689520	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_022648	GTTATG	2	12	2707351	2707362	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022648	TCGATA	2	12	2717977	2717988	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_022648	CAAGTG	2	12	2724320	2724331	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_022648	TCCTTC	2	12	2820002	2820013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_022648	TGAGCG	2	12	2854364	2854375	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_022648	TGGACA	2	12	2864374	2864385	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_022648	CAGTTT	2	12	2878979	2878990	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_022648	TAAATT	2	12	2932531	2932542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022648	GGAGAA	2	12	3007503	3007514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022648	GGTTTT	2	12	3103052	3103063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022648	ACAAGA	2	12	3107382	3107393	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_022648	TTTGTT	2	12	3132206	3132217	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022648	TCCGCC	2	12	3172488	3172499	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_022648	GTAAGG	2	12	3278891	3278902	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022648	TTTTGT	2	12	3340709	3340720	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022648	TATTGT	2	12	3347600	3347611	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022648	ATCTTG	2	12	3360363	3360374	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_022648	ATCAGT	2	12	3368245	3368256	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_022648	TAAATA	2	12	3374767	3374778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022648	CGTGCG	2	12	3392499	3392510	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022648	ATAAAC	2	12	3395446	3395457	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_022648	TAAACA	2	12	3396251	3396262	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_022648	ATTCCG	2	12	3409892	3409903	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_022648	TTTTCG	2	12	3451670	3451681	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_022648	ATAAAA	2	12	3516703	3516714	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022648	ATTTAA	2	12	3527443	3527454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022648	AGTTGT	2	12	3558637	3558648	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022648	CTTTTT	2	12	3563313	3563324	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_022648	AATGAT	2	12	3564148	3564159	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022648	TCTCCC	2	12	3586957	3586968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_022648	GTAACC	2	12	3613908	3613919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_022648	TGCATT	2	12	3622727	3622738	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_022648	TTTTAT	2	12	3624624	3624635	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022648	AAGCGA	2	12	3630023	3630034	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_022648	CTTTCT	2	12	3653890	3653901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022648	ACAGAA	2	12	3677423	3677434	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_022648	AGCGTT	2	12	3759199	3759210	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_022648	TTTATA	2	12	3775884	3775895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022648	AATTTA	2	12	3882823	3882834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022648	GTGATG	2	12	3954873	3954884	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022648	AAGATA	2	12	3966777	3966788	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022648	AGATGC	2	12	3982049	3982060	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_022648	TGAAAA	2	12	4005935	4005946	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022648	TTTGCC	2	12	4043532	4043543	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_022648	CTGAAG	2	12	4048065	4048076	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_022648	TTATGG	2	12	4193715	4193726	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022648	CTTTTT	2	12	4279833	4279844	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_022648	CAAATG	2	12	4403415	4403426	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_022648	AAATGG	2	12	4410149	4410160	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022648	GATATC	2	12	4436229	4436240	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_022648	GGGAGT	2	12	4441971	4441982	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022648	TCATTT	2	12	4577115	4577126	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_022648	TAACCA	2	12	4596587	4596598	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_022648	ATTTAT	2	12	4645502	4645513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022648	GTCTTT	2	12	4654312	4654323	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_022648	AATATC	2	12	4686640	4686651	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_022648	CTGATA	2	12	4722313	4722324	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_022648	TTTTTA	2	12	4787763	4787774	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022648	TTTAAT	2	12	4819616	4819627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_022648	AATAAA	2	12	4881834	4881845	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_022648	TTCTGC	2	12	4974288	4974299	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_022648	CGCGTG	2	12	4981866	4981877	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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150	NC_022648	AATGAT	2	12	5094230	5094241	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.