MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p2

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021995	AGT	2	6	1036	1041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021995	TAA	2	6	1274	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021995	CTT	2	6	1333	1338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021995	TGC	2	6	1348	1353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021995	GTT	2	6	1387	1392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021995	TGA	2	6	1419	1424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021995	TCG	2	6	1519	1524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021995	ATT	2	6	1868	1873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021995	CAA	2	6	2322	2327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021995	GTG	2	6	2412	2417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021995	ATA	2	6	2434	2439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021995	AGC	2	6	2506	2511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021995	TCT	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021995	GGA	2	6	2574	2579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021995	TGC	2	6	2601	2606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021995	CTA	2	6	2667	2672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021995	TAG	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021995	GGT	2	6	2787	2792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021995	GGA	2	6	3462	3467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021995	ACG	2	6	3501	3506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021995	AAT	2	6	3507	3512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021995	GTA	2	6	3519	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021995	AGG	2	6	3556	3561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021995	GAA	2	6	3885	3890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021995	ATG	2	6	4141	4146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021995	ATT	2	6	5244	5249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021995	TAT	2	6	5252	5257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021995	TAA	2	6	6116	6121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021995	GAG	2	6	6893	6898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021995	AGG	2	6	9648	9653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021995	GAA	2	6	10426	10431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021995	ATA	2	6	14922	14927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021995	GCC	2	6	14984	14989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_021995	TAT	2	6	15241	15246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021995	TAA	2	6	15259	15264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021995	TTG	2	6	15344	15349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021995	AAG	2	6	15388	15393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021995	GGA	2	6	25140	25145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021995	GTA	2	6	31703	31708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021995	ATA	2	6	32070	32075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021995	AGG	2	6	32091	32096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021995	AGG	2	6	34157	34162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021995	AAG	2	6	34521	34526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021995	GTG	2	6	34597	34602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021995	AGG	2	6	34632	34637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021995	AAG	2	6	34638	34643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021995	GAA	2	6	36228	36233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021995	CCT	2	6	36237	36242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_021995	ACT	2	6	36360	36365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021995	AGG	2	6	36460	36465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021995	GAG	2	6	36622	36627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021995	CAA	2	6	45036	45041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021995	TAT	2	6	45107	45112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021995	CCT	2	6	45240	45245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_021995	TAT	2	6	45285	45290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021995	AAG	2	6	45616	45621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021995	GAA	2	6	45760	45765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021995	CAA	2	6	45891	45896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021995	CAA	2	6	45989	45994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021995	AGG	2	6	46041	46046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021995	ATT	2	6	46074	46079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021995	ATT	2	6	46099	46104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021995	CAC	2	6	46119	46124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_021995	CGC	2	6	47737	47742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_021995	GGT	2	6	47746	47751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021995	TGT	2	6	47822	47827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021995	TGC	2	6	47862	47867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021995	GTA	2	6	47887	47892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021995	CTA	2	6	47953	47958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021995	GAT	2	6	47964	47969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021995	GAA	2	6	48214	48219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021995	ATT	2	6	48263	48268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021995	AGG	2	6	48274	48279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021995	CTT	2	6	48976	48981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021995	CTT	2	6	49000	49005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021995	ATT	2	6	49009	49014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021995	TTC	2	6	49169	49174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021995	ATT	2	6	49294	49299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021995	ATA	2	6	49336	49341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021995	ATC	2	6	49415	49420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021995	GCT	2	6	49448	49453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021995	AAT	2	6	49479	49484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021995	TAG	2	6	53549	53554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021995	ATT	2	6	53584	53589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021995	ATT	2	6	53592	53597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021995	ATT	2	6	54638	54643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021995	GTT	2	6	54661	54666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021995	AGT	2	6	55267	55272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021995	AAT	2	6	55276	55281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021995	GTG	2	6	55288	55293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021995	ATA	2	6	55338	55343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021995	GGA	2	6	55424	55429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021995	ACT	2	6	55885	55890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021995	CAC	2	6	55891	55896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_021995	CTT	2	6	55936	55941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021995	TGA	2	6	56029	56034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021995	TCA	2	6	57728	57733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021995	TTA	2	6	60046	60051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021995	TTA	2	6	61605	61610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021995	TGT	2	6	61616	61621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021995	TTA	2	6	61716	61721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021995	AAG	3	9	61774	61782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021995	CTT	2	6	61804	61809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021995	AAT	2	6	63804	63809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021995	TAT	2	6	63823	63828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021995	AAT	2	6	63838	63843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021995	AAG	2	6	64239	64244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021995	ATT	2	6	64248	64253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021995	TAA	2	6	64273	64278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021995	ATT	2	6	64286	64291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021995	TGC	2	6	64297	64302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021995	AAT	2	6	64319	64324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021995	TCC	2	6	64342	64347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_021995	AAT	2	6	64353	64358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021995	CTC	2	6	65645	65650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_021995	TAA	2	6	65672	65677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021995	TAA	2	6	65690	65695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021995	ATT	2	6	65702	65707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021995	AAT	2	6	65728	65733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021995	ATA	2	6	66996	67001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021995	AGT	2	6	67026	67031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021995	ATT	2	6	67154	67159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021995	ACT	2	6	67188	67193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021995	CAG	2	6	67219	67224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.