MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021987	TTTCA	2	10	4688	4697	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021987	ATAAA	2	10	4959	4968	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021987	ATCAA	2	10	5768	5777	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021987	TTTCC	2	10	5867	5876	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_021987	TATAT	2	10	7218	7227	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021987	TTATA	2	10	15532	15541	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021987	GTTCA	2	10	17065	17074	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_021987	CAAAA	2	10	19373	19382	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021987	TCGGG	2	10	21078	21087	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_021987	GTCTA	2	10	22139	22148	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021987	TATTT	2	10	25381	25390	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021987	GATAA	2	10	29590	29599	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021987	TCTTT	2	10	31643	31652	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021987	CTATG	2	10	32963	32972	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_021987	TCTTT	2	10	43794	43803	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_021987	TTTCT	2	10	45603	45612	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021987	TTGTT	2	10	48585	48594	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021987	AAATA	2	10	48680	48689	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021987	ACTAG	2	10	49259	49268	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_021987	TTATT	2	10	51504	51513	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021987	ACTAG	2	10	51869	51878	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021987	AACCA	2	10	52782	52791	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_021987	GTTTA	2	10	56509	56518	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021987	AATTA	2	10	56664	56673	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021987	TAAAT	2	10	57046	57055	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021987	TTTCT	2	10	58719	58728	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021987	GACTT	2	10	60735	60744	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021987	CTTTT	2	10	72495	72504	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021987	ATTTA	2	10	72665	72674	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021987	TTGTT	2	10	74051	74060	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021987	ATTAA	2	10	76548	76557	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021987	GAAAT	2	10	79473	79482	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021987	CTTGC	2	10	91835	91844	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_021987	ACTTT	2	10	91927	91936	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_021987	TAAAC	2	10	93604	93613	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021987	GAATA	2	10	93896	93905	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021987	ATTTC	2	10	105031	105040	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_021987	GTTAT	2	10	105173	105182	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021987	CAAAA	2	10	105808	105817	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021987	TTATT	2	10	124114	124123	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021987	GAATA	2	10	124350	124359	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021987	CTTTT	2	10	126371	126380	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.