MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021987	TAAA	2	8	810	817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021987	AAAT	2	8	2677	2684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021987	AAAT	2	8	3489	3496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021987	TTGG	2	8	4136	4143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021987	TAAA	2	8	4531	4538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021987	AATA	2	8	4587	4594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021987	TCCC	2	8	5721	5728	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_021987	TTCT	2	8	5816	5823	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021987	ATTT	2	8	5891	5898	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021987	AAAT	2	8	5937	5944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021987	AGTT	2	8	15569	15576	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021987	AAAG	2	8	17266	17273	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021987	TCAT	2	8	17314	17321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021987	TTAC	2	8	18806	18813	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021987	ATCA	2	8	19707	19714	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021987	ATTT	2	8	20717	20724	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021987	CAAA	2	8	21034	21041	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021987	TTTG	2	8	21104	21111	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021987	TGAT	2	8	21113	21120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021987	AATA	2	8	22240	22247	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021987	ATTC	2	8	23925	23932	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021987	CATA	2	8	25207	25214	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021987	TATT	2	8	25285	25292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021987	TAAA	2	8	25336	25343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021987	CGTT	2	8	28295	28302	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021987	TTTA	2	8	30385	30392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021987	TCTT	2	8	31441	31448	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021987	AATG	2	8	31694	31701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021987	ATTT	2	8	32754	32761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021987	ATCA	2	8	33072	33079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021987	GAAA	2	8	34250	34257	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021987	ATGG	2	8	34931	34938	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021987	AATC	2	8	35631	35638	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021987	AGCA	2	8	42145	42152	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021987	TTAC	2	8	45695	45702	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021987	TATT	2	8	48757	48764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021987	AGCA	2	8	51783	51790	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021987	ATTT	2	8	53437	53444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021987	AGTA	2	8	54653	54660	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021987	CTAT	2	8	54807	54814	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021987	CTTA	2	8	56579	56586	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021987	TTAA	2	8	56605	56612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021987	AAAT	2	8	56726	56733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021987	CAAT	2	8	57138	57145	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021987	ACAA	2	8	57484	57491	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021987	ATCT	2	8	57720	57727	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021987	AGTA	2	8	59057	59064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021987	TTGT	2	8	59082	59089	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021987	ATTT	2	8	59329	59336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021987	GTAA	2	8	60799	60806	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021987	ACGG	2	8	60807	60814	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021987	CTAA	2	8	60884	60891	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021987	ATTC	2	8	60985	60992	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021987	TCAC	2	8	61140	61147	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021987	CTTT	2	8	67161	67168	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_021987	ATTT	2	8	72535	72542	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021987	TAAT	2	8	72583	72590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021987	ATAA	2	8	72607	72614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021987	TTAA	2	8	74029	74036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021987	CTTT	2	8	77701	77708	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021987	AGAA	2	8	84512	84519	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021987	CAAA	2	8	84604	84611	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021987	TTGT	2	8	84884	84891	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021987	ATTT	2	8	86662	86669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021987	TAAA	2	8	88738	88745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021987	TAAT	2	8	88746	88753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021987	TTTA	2	8	88761	88768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021987	TTGG	2	8	89034	89041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021987	AAAT	2	8	90204	90211	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021987	AATA	2	8	90227	90234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021987	TATG	2	8	90263	90270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021987	CAAA	2	8	90710	90717	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021987	CAAA	2	8	91727	91734	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021987	TGCA	2	8	91875	91882	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021987	ATAA	2	8	91951	91958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021987	ATTT	2	8	91978	91985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021987	ATGA	2	8	93837	93844	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021987	TAAA	2	8	93950	93957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021987	ATAC	2	8	95370	95377	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_021987	ATTA	2	8	97532	97539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021987	CATA	2	8	101403	101410	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021987	ATTA	2	8	101447	101454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021987	CACC	2	8	101952	101959	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_021987	GGTG	2	8	102795	102802	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021987	GTCG	2	8	104688	104695	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021987	TTGA	2	8	104697	104704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021987	CTTA	2	8	104916	104923	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021987	TATT	2	8	105820	105827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021987	TAAA	2	8	105941	105948	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021987	ATTT	2	8	106462	106469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021987	TTTA	2	8	106563	106570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021987	ATAA	2	8	106712	106719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021987	TAAT	2	8	107965	107972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021987	TTTG	2	8	108514	108521	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021987	AAAG	2	8	108585	108592	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021987	GCTT	2	8	108978	108985	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_021987	ATTT	2	8	109991	109998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021987	AGGG	2	8	118126	118133	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021987	GTTC	2	8	121039	121046	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021987	ATTC	2	8	121168	121175	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_021987	AAAG	2	8	121192	121199	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021987	AATC	2	8	121241	121248	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021987	AGAA	2	8	123004	123011	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021987	AAAT	2	8	123525	123532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021987	TGTT	2	8	124180	124187	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021987	GTTA	2	8	124314	124321	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021987	ATTT	2	8	124463	124470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021987	TTTA	2	8	125557	125564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021987	TAAA	2	8	126400	126407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021987	TCAA	2	8	126410	126417	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021987	ATTA	2	8	128185	128192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.