MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Erysipelothrix rhusiopathiae SY1027

Total Repeats: 233

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021354	TGATA	2	10	15537	15546	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021354	TTTTA	2	10	42352	42361	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021354	GAATA	2	10	42466	42475	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021354	TAATT	2	10	53575	53584	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021354	AAAGA	2	10	83738	83747	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021354	CTTTT	2	10	109938	109947	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_021354	TGATA	2	10	125310	125319	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021354	AATTT	2	10	153444	153453	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021354	TAGAA	2	10	172153	172162	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021354	ATAAA	2	10	180869	180878	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021354	ACTCA	2	10	232595	232604	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_021354	TTTAA	2	10	232661	232670	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021354	AGAAA	2	10	234666	234675	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021354	AATTA	2	10	242404	242413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021354	TTAAT	2	10	252656	252665	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021354	TCAAA	2	10	255957	255966	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021354	AGTGC	2	10	256093	256102	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021354	ATAGG	2	10	257838	257847	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021354	TATAA	2	10	262158	262167	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021354	GGTAT	2	10	265591	265600	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021354	TTGGT	2	10	265894	265903	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021354	ATGAT	2	10	265904	265913	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021354	CTTGA	2	10	266000	266009	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_021354	TAAAT	2	10	267372	267381	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021354	CCAAA	2	10	276441	276450	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_021354	GGCAT	2	10	276509	276518	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021354	GAGAC	2	10	285462	285471	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021354	ATTTT	3	15	288215	288229	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021354	ACATA	2	10	326619	326628	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021354	GAGAA	2	10	334415	334424	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021354	CGATT	2	10	341666	341675	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_021354	CTTAA	2	10	345685	345694	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_021354	TATAA	2	10	358285	358294	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021354	GAAAC	2	10	358493	358502	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_021354	ATTGG	2	10	362446	362455	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021354	TATAG	2	10	369119	369128	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021354	GATAT	2	10	369209	369218	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021354	ACCAT	2	10	379477	379486	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_021354	AAAAC	2	10	385850	385859	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021354	TAAAC	2	10	395217	395226	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021354	CAAAT	2	10	398163	398172	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_021354	ATTAA	2	10	398410	398419	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021354	GTAAA	2	10	398854	398863	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021354	CAACT	2	10	399040	399049	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_021354	CATTG	2	10	399290	399299	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_021354	AATGA	2	10	412211	412220	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021354	TTGAT	2	10	449591	449600	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021354	ATAAA	2	10	483049	483058	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021354	TCAAA	2	10	495212	495221	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_021354	AAACG	2	10	513048	513057	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_021354	TAAAT	2	10	522713	522722	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021354	CAATG	2	10	522881	522890	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_021354	CCCTG	2	10	523313	523322	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_021354	AGTTA	2	10	524018	524027	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021354	CGTCC	2	10	546705	546714	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_021354	TATCG	2	10	569342	569351	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_021354	TTATT	2	10	573701	573710	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021354	AAAGA	2	10	599310	599319	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021354	TACTT	2	10	602764	602773	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_021354	TTTCA	2	10	611875	611884	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_021354	TTCTT	2	10	612040	612049	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021354	CTTTG	2	10	624937	624946	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_021354	TCGGT	2	10	625708	625717	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_021354	TTTTC	2	10	626254	626263	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_021354	CACGA	2	10	627256	627265	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_021354	TTACC	2	10	628059	628068	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_021354	TATCA	2	10	638316	638325	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_021354	TATTG	2	10	644304	644313	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021354	ATATT	2	10	652958	652967	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021354	AATTA	2	10	653595	653604	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021354	ATCCA	2	10	655813	655822	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_021354	TAAAA	2	10	662295	662304	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021354	TTTCA	2	10	669784	669793	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_021354	ATTAT	2	10	670718	670727	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021354	TTTTA	2	10	682467	682476	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021354	TCCTG	2	10	688989	688998	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_021354	ATTTG	2	10	692386	692395	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021354	GAAAA	2	10	701524	701533	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021354	AAATT	2	10	703332	703341	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021354	TATAA	2	10	703921	703930	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021354	AATGA	2	10	705321	705330	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021354	CCAAA	2	10	709952	709961	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_021354	AACTT	2	10	714222	714231	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021354	TAACT	2	10	741138	741147	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021354	TATAG	2	10	746665	746674	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021354	ACTAC	2	10	747081	747090	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_021354	CAGTT	2	10	747137	747146	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_021354	ATCGT	2	10	751239	751248	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_021354	TAGAA	2	10	758557	758566	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021354	TGTCA	2	10	788501	788510	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_021354	ATGAT	2	10	812909	812918	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021354	TCACC	2	10	817087	817096	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_021354	TATCA	2	10	817099	817108	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_021354	AATCG	2	10	817503	817512	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021354	AACCA	2	10	818000	818009	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_021354	TTACG	2	10	818535	818544	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_021354	CATAG	2	10	822733	822742	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_021354	TCAAA	2	10	822756	822765	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_021354	TAATC	2	10	822847	822856	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_021354	CAATT	2	10	823775	823784	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_021354	TTATT	2	10	824411	824420	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021354	GAGAA	2	10	827536	827545	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021354	ATATT	2	10	831932	831941	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021354	TATCA	2	10	832759	832768	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_021354	TGGTA	2	10	832795	832804	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021354	TTATG	2	10	840260	840269	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021354	TAAAA	2	10	840951	840960	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021354	GATAA	2	10	850836	850845	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021354	ATCAG	2	10	850989	850998	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021354	TTTTA	2	10	866776	866785	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021354	ATCAA	2	10	876334	876343	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_021354	TTTAA	2	10	885544	885553	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021354	TATAA	2	10	895667	895676	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021354	AAAGA	2	10	898631	898640	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021354	TATTT	2	10	901454	901463	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021354	TAAAA	2	10	909758	909767	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021354	GTTAT	2	10	922628	922637	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021354	TTAGT	2	10	926580	926589	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021354	ACATT	2	10	926782	926791	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_021354	AAAAC	2	10	932190	932199	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_021354	TAAAA	2	10	940580	940589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021354	ATCAT	2	10	941954	941963	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_021354	TTTAT	2	10	949973	949982	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021354	TTATT	2	10	950026	950035	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021354	CCTTT	2	10	957975	957984	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_021354	ATGTT	2	10	962547	962556	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021354	CGAAT	2	10	981088	981097	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_021354	AGATT	2	10	981740	981749	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021354	ACGAT	2	10	982105	982114	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_021354	TTCAA	2	10	1014668	1014677	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_021354	TCGGT	2	10	1014779	1014788	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_021354	TCCAT	2	10	1019439	1019448	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_021354	AAGAA	2	10	1029238	1029247	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021354	GTAAT	2	10	1031202	1031211	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021354	TATCA	2	10	1032132	1032141	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021354	ACTAA	2	10	1044920	1044929	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_021354	TAAAA	2	10	1046043	1046052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021354	ATTCT	2	10	1057510	1057519	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_021354	CACAT	2	10	1062264	1062273	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_021354	ATGTG	2	10	1062286	1062295	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021354	TAGAA	2	10	1065590	1065599	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021354	TTCTA	2	10	1069938	1069947	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021354	TAGGT	2	10	1070341	1070350	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021354	TCTTT	2	10	1075236	1075245	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_021354	ATTTT	2	10	1077365	1077374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021354	AATAA	2	10	1088110	1088119	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_021354	ATCAA	2	10	1386159	1386168	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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198	NC_021354	TTCCT	2	10	1541491	1541500	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.