MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Eubacterium rectale DSM 17629 draft genome

Total Repeats: 227

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021010	TTTTCT	2	12	6400	6411	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021010	ATTTAT	2	12	8815	8826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021010	GCAGGA	2	12	46558	46569	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021010	GTGGAC	2	12	47928	47939	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021010	AAATAA	2	12	53508	53519	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021010	GATGAG	2	12	61469	61480	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021010	GATGAG	2	12	63218	63229	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021010	GTGTTG	2	12	78556	78567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021010	TGAGCT	2	12	89089	89100	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021010	TTTATG	2	12	89344	89355	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021010	TGTAAC	2	12	90228	90239	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021010	GTATAT	2	12	98715	98726	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021010	GAGAAA	2	12	100877	100888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021010	TGAAAG	2	12	101503	101514	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021010	TCAAAT	2	12	112238	112249	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021010	AACAGT	2	12	153364	153375	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021010	GAGCCG	2	12	170909	170920	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021010	GGAAAA	2	12	217798	217809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021010	CAGATA	2	12	221134	221145	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021010	GCAGAT	2	12	248230	248241	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021010	AATTTA	2	12	257809	257820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021010	CTTTTT	2	12	311749	311760	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021010	AGGAAC	2	12	323915	323926	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021010	TATGAT	2	12	324825	324836	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021010	ATAGTA	2	12	337646	337657	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021010	GGAGAA	2	12	352093	352104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021010	AACAGT	2	12	356736	356747	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021010	CTGATT	2	12	364852	364863	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021010	GACCAT	2	12	366143	366154	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021010	TGCGCT	2	12	399713	399724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021010	TATTTT	2	12	403621	403632	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021010	TAATGA	2	12	430396	430407	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021010	TACAGA	2	12	430528	430539	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021010	CTTTTT	2	12	451963	451974	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021010	GGCAAT	2	12	474616	474627	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021010	TGCGAA	2	12	503145	503156	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021010	GCAGTA	2	12	514526	514537	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021010	AAAGGA	2	12	558917	558928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021010	TGAAAA	2	12	569881	569892	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021010	TGTGGC	2	12	572491	572502	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021010	GAATAT	2	12	601572	601583	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021010	AATGCA	2	12	612066	612077	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021010	AAAAAT	2	12	617404	617415	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021010	TAAAAA	2	12	632656	632667	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021010	TGATAT	2	12	643303	643314	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021010	TAGCGA	2	12	643352	643363	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021010	AAGCGG	2	12	695646	695657	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021010	GAGAAG	2	12	697155	697166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021010	TACAAG	2	12	705607	705618	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021010	GTACCC	2	12	747762	747773	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021010	GAGGGC	2	12	750439	750450	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021010	AAATGT	2	12	751374	751385	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021010	CTTTTT	2	12	769879	769890	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021010	CTGGTC	2	12	773595	773606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021010	GGATAC	2	12	782123	782134	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021010	ACTTCG	2	12	782274	782285	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021010	ATAAAT	2	12	788921	788932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021010	TATTTT	2	12	819841	819852	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021010	TATATT	2	12	820451	820462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021010	CGAGCT	2	12	847008	847019	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021010	AAGATA	2	12	847399	847410	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021010	CAGATG	2	12	848558	848569	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021010	ATGAAA	2	12	856387	856398	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021010	AAGAAA	2	12	863490	863501	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021010	AAATAA	2	12	906607	906618	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021010	GATTTT	2	12	930370	930381	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021010	TTTAAT	2	12	936787	936798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021010	TTGTAT	2	12	952325	952336	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021010	ATTCTT	2	12	956175	956186	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021010	CAACCT	2	12	993646	993657	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021010	ATGTTA	2	12	1037822	1037833	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021010	TTTTAA	2	12	1037839	1037850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021010	TTTATA	2	12	1074990	1075001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021010	TAGAAA	2	12	1077739	1077750	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021010	TCTAAA	2	12	1078989	1079000	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021010	TTTTAT	2	12	1098777	1098788	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021010	CCCAAT	2	12	1137275	1137286	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021010	TCTTTA	2	12	1138526	1138537	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021010	CTTATC	2	12	1160255	1160266	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021010	TCATAA	2	12	1165369	1165380	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021010	CATAAC	2	12	1170850	1170861	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021010	TGCTTC	2	12	1187837	1187848	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021010	CTTTTT	2	12	1188172	1188183	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021010	TCTTTT	2	12	1200077	1200088	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021010	ATATTA	2	12	1249074	1249085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021010	ATGACA	2	12	1257871	1257882	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021010	TAAAAA	2	12	1288936	1288947	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021010	GCAAAC	2	12	1288982	1288993	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021010	TATTTT	2	12	1318057	1318068	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021010	TGCAGC	2	12	1324423	1324434	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021010	AGTGCA	3	18	1331380	1331397	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021010	GTAGCC	2	12	1331493	1331504	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021010	AAGCTC	2	12	1337055	1337066	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021010	ATAAAA	2	12	1344986	1344997	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021010	TATTGG	2	12	1349560	1349571	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021010	AACACT	2	12	1381749	1381760	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021010	AGCTCA	2	12	1382064	1382075	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021010	ATATCA	2	12	1389771	1389782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_021010	GTTAAT	2	12	1431647	1431658	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021010	GACAAA	2	12	1440299	1440310	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_021010	ATTTTT	2	12	1444350	1444361	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021010	AAATAC	2	12	1445256	1445267	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_021010	AATATT	2	12	1449269	1449280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021010	AAACAA	2	12	1451159	1451170	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_021010	TTATCT	2	12	1460303	1460314	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021010	GCGTTT	2	12	1529097	1529108	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021010	ACCGTT	2	12	1537316	1537327	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021010	ACTTCT	2	12	1548253	1548264	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021010	ATTTTT	2	12	1559236	1559247	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021010	TAATTA	2	12	1577650	1577661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021010	AGCTGA	2	12	1604069	1604080	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_021010	TGCCAG	2	12	1608332	1608343	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021010	TTTTTA	2	12	1610215	1610226	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021010	GTATCC	2	12	1630199	1630210	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021010	TGTAAT	2	12	1635936	1635947	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021010	TTCCTA	2	12	1642678	1642689	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021010	TTCCGT	2	12	1649413	1649424	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021010	CCTTTT	2	12	1649656	1649667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021010	CGTCTT	2	12	1649751	1649762	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021010	ATATTC	2	12	1686149	1686160	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_021010	TATGAT	2	12	1697477	1697488	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021010	CCTTTG	2	12	1702231	1702242	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021010	TAACCA	2	12	1702296	1702307	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021010	CCTTTG	2	12	1705773	1705784	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021010	TCTTTT	2	12	1725382	1725393	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_021010	TCTCCT	2	12	1734973	1734984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021010	AAATAT	2	12	1763304	1763315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021010	GTAATC	2	12	1772566	1772577	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_021010	CTTATC	2	12	1774151	1774162	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021010	TGTAAT	2	12	1774251	1774262	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021010	ATCAAA	2	12	1808731	1808742	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_021010	CGGAGT	2	12	1808777	1808788	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_021010	CTCAAA	2	12	1816383	1816394	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021010	TATTTT	2	12	1818278	1818289	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021010	CTATTC	2	12	1819394	1819405	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021010	TTTCTA	2	12	1827819	1827830	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_021010	TACCGA	2	12	1834770	1834781	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021010	CTTTTT	2	12	1837460	1837471	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_021010	TTTGCT	2	12	1855714	1855725	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_021010	TTAATT	2	12	1897690	1897701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021010	TTTGTT	2	12	1945606	1945617	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021010	TTGTCA	2	12	1946531	1946542	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_021010	TTTTAT	2	12	1959658	1959669	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021010	CAGGGA	2	12	1971290	1971301	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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146	NC_021010	CATAAC	2	12	2044297	2044308	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_021010	AAAAAT	2	12	2051388	2051399	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021010	AATGAC	2	12	2051607	2051618	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_021010	TGTATG	2	12	2061260	2061271	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021010	AATGAA	2	12	2073668	2073679	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_021010	AAAACA	2	12	2121307	2121318	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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166	NC_021010	TTAATA	2	12	2342717	2342728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_021010	ATATTT	2	12	2354955	2354966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.