MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus casseliflavus EC20

Total Repeats: 438

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020995	AAGAA	2	10	1448	1457	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020995	TAGCA	2	10	21584	21593	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_020995	TAAAC	2	10	21662	21671	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_020995	CCTCT	2	10	26411	26420	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_020995	ATAAG	2	10	34288	34297	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020995	GCTAT	2	10	35416	35425	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020995	AAAAC	2	10	44663	44672	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_020995	TACAT	2	10	54738	54747	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020995	AGAAC	2	10	84690	84699	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_020995	TAAAG	2	10	90016	90025	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020995	TATAA	2	10	94532	94541	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020995	TCCAA	2	10	95193	95202	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_020995	TGCTA	2	10	99258	99267	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020995	TGTCA	2	10	107778	107787	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_020995	ATAAC	2	10	107954	107963	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_020995	TAAAA	2	10	108013	108022	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020995	TTTTA	2	10	156250	156259	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020995	AAAGA	2	10	157895	157904	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020995	TACAA	2	10	159428	159437	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_020995	GATTT	2	10	179887	179896	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020995	ATAAA	2	10	181513	181522	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020995	AGGCA	2	10	187779	187788	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_020995	TGGAG	2	10	188942	188951	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020995	GGGGA	2	10	198075	198084	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020995	TCAAT	2	10	198134	198143	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_020995	ATGGA	2	10	203630	203639	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020995	TTCTG	2	10	214996	215005	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_020995	TCCAT	2	10	221445	221454	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_020995	AAGTA	2	10	231470	231479	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020995	ATAAA	2	10	237105	237114	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020995	GAAAA	2	10	240023	240032	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020995	GAGAC	2	10	240044	240053	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020995	TTAAG	2	10	245635	245644	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020995	GTTCG	2	10	266250	266259	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020995	GAAAT	2	10	282363	282372	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020995	TTTTG	2	10	309703	309712	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020995	TGGAT	2	10	309773	309782	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020995	GAAAG	2	10	324993	325002	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020995	AGGAA	2	10	330398	330407	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020995	CTTTG	2	10	330432	330441	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_020995	TTAAT	2	10	339809	339818	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020995	TATAC	2	10	353800	353809	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_020995	CTTTC	2	10	359561	359570	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_020995	AGTCA	2	10	366370	366379	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_020995	AGGGA	2	10	366491	366500	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020995	TTTAA	2	10	381497	381506	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020995	ATCAA	2	10	404753	404762	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_020995	AGTAA	2	10	422895	422904	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020995	CCAAT	2	10	429086	429095	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_020995	TGTTT	2	10	437613	437622	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020995	TATAG	2	10	448268	448277	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020995	TAAAA	2	10	462871	462880	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020995	AAATA	2	10	470169	470178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020995	TACAC	2	10	495263	495272	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_020995	TTCCT	2	10	500124	500133	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_020995	AGCCT	2	10	501505	501514	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_020995	CCTTA	2	10	508633	508642	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_020995	AAAGA	2	10	509192	509201	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020995	CTTTC	2	10	511386	511395	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_020995	GTTTT	2	10	520261	520270	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020995	ATTTT	2	10	520861	520870	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020995	GAAAG	2	10	520877	520886	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020995	TAAAA	2	10	521839	521848	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020995	TAAAA	2	10	536404	536413	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020995	ATTTC	2	10	536427	536436	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_020995	TGTGC	2	10	538207	538216	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_020995	TTGTA	2	10	544884	544893	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020995	TATCC	2	10	547209	547218	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_020995	ATAAA	2	10	553947	553956	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020995	TGCTG	2	10	558015	558024	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_020995	TTAGT	2	10	558116	558125	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020995	AGCTT	2	10	564702	564711	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_020995	TCTTT	2	10	565309	565318	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_020995	CTAAA	2	10	587892	587901	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_020995	ATTTT	2	10	588052	588061	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020995	ATAAA	2	10	597168	597177	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020995	AAAGT	2	10	597753	597762	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020995	ACAGG	2	10	603563	603572	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_020995	AGAAA	2	10	603676	603685	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020995	GAAAA	2	10	605522	605531	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020995	AGAAA	2	10	606696	606705	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020995	GAAAA	2	10	609006	609015	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020995	AGGAA	2	10	627646	627655	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020995	TTATT	2	10	629540	629549	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020995	TGTTT	2	10	629669	629678	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020995	GCAAC	2	10	632077	632086	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_020995	CTTCT	2	10	633550	633559	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_020995	TAATT	2	10	641971	641980	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020995	ACGTT	2	10	652343	652352	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_020995	CACTT	2	10	654101	654110	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_020995	TATGC	2	10	657247	657256	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_020995	GCCAT	2	10	661515	661524	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_020995	TGATA	2	10	666454	666463	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020995	TCGTG	2	10	667714	667723	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_020995	GCTAA	2	10	667914	667923	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_020995	AGGGA	2	10	671158	671167	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020995	GTTTC	2	10	672874	672883	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_020995	TTAAA	2	10	673665	673674	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020995	TTAAT	2	10	673859	673868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020995	ATTGA	2	10	674144	674153	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020995	GGGAA	2	10	674794	674803	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020995	ATGAA	2	10	679521	679530	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020995	AGCTC	2	10	681270	681279	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_020995	AAAAC	2	10	686626	686635	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020995	AGGAA	2	10	704295	704304	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020995	AACCA	2	10	717564	717573	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_020995	ATCAA	2	10	720806	720815	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_020995	TAAAA	2	10	729897	729906	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020995	TTGTT	2	10	738474	738483	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020995	GAAAG	2	10	755152	755161	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020995	AGGTG	2	10	758719	758728	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020995	ACATA	2	10	758951	758960	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_020995	GCTTT	2	10	774831	774840	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_020995	ATCCA	2	10	775335	775344	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_020995	GATCT	2	10	775616	775625	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_020995	ACAAA	2	10	775870	775879	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_020995	TAAAG	2	10	776979	776988	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020995	CTTGC	2	10	788048	788057	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_020995	CGTAT	2	10	789629	789638	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_020995	AAAAG	2	10	796474	796483	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020995	AAAGT	2	10	804620	804629	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020995	AAGGA	2	10	808351	808360	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020995	AAAAG	2	10	810300	810309	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020995	AGGGA	2	10	816130	816139	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020995	AAATT	2	10	821654	821663	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020995	TTTCT	2	10	826746	826755	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_020995	GACAT	2	10	827284	827293	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_020995	ATTTT	2	10	836969	836978	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020995	AAAGT	2	10	851892	851901	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020995	TTGGG	2	10	855355	855364	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020995	CTTTC	2	10	864641	864650	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_020995	TATTT	2	10	869614	869623	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020995	TTTTA	2	10	870012	870021	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020995	AGAAA	2	10	871280	871289	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020995	ATTTT	2	10	872854	872863	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020995	GAAAA	2	10	872877	872886	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020995	AAAGC	2	10	874511	874520	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_020995	TGATA	2	10	882776	882785	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020995	AATCA	2	10	905282	905291	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_020995	CAAAA	2	10	944101	944110	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_020995	GAAGA	2	10	953370	953379	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020995	TGAGG	2	10	956337	956346	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020995	GAAAA	2	10	988116	988125	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020995	TAACA	2	10	992568	992577	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_020995	AGATA	2	10	1000172	1000181	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020995	AAGGA	2	10	1002607	1002616	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020995	CAACA	2	10	1019577	1019586	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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424	NC_020995	GTAAA	2	10	3340882	3340891	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
425	NC_020995	CACAT	2	10	3343207	3343216	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
426	NC_020995	AGATT	2	10	3345269	3345278	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
427	NC_020995	TATTT	2	10	3367248	3367257	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_020995	TTTCT	2	10	3378681	3378690	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
429	NC_020995	CTCTC	2	10	3382247	3382256	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
430	NC_020995	TCTCT	2	10	3386708	3386717	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
431	NC_020995	GATTT	2	10	3393403	3393412	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
432	NC_020995	TCCCT	2	10	3394560	3394569	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
433	NC_020995	TTAGC	2	10	3397804	3397813	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
434	NC_020995	CACGA	2	10	3398004	3398013	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
435	NC_020995	TATCA	2	10	3399264	3399273	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
436	NC_020995	AAAGA	2	10	3409325	3409334	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
437	NC_020995	TAAAA	2	10	3424057	3424066	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_020995	ACGTA	2	10	3424502	3424511	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.