MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Edwardsiella tarda C07-087

Total Repeats: 191

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020796	CGATGT	2	12	123778	123789	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020796	TAAGAC	2	12	153121	153132	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_020796	TAAGAC	2	12	187241	187252	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020796	AAATAA	2	12	208958	208969	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020796	CACGAT	2	12	217146	217157	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020796	TCAGGA	2	12	222744	222755	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020796	TTTTCA	2	12	234358	234369	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_020796	CAGATA	2	12	260201	260212	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020796	GCGCTG	2	12	266072	266083	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020796	TTAAAT	2	12	266860	266871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020796	CAGTGT	2	12	331514	331525	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020796	GTCGAC	2	12	339038	339049	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020796	GTTGTC	2	12	345620	345631	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_020796	AAGTTG	2	12	345700	345711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020796	ATCGCG	2	12	366140	366151	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020796	AACCCT	16	96	379599	379694	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020796	CGGCGC	2	12	390651	390662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020796	GTATCC	2	12	393514	393525	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020796	ACGCAG	2	12	397167	397178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020796	TTTACC	2	12	436470	436481	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020796	AATCTA	2	12	476057	476068	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020796	TCACCG	2	12	480586	480597	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020796	GAAAAA	2	12	508182	508193	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020796	TAGATT	2	12	525334	525345	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020796	GATAGC	2	12	531490	531501	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020796	TTTTTG	2	12	546743	546754	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020796	ATTGGC	2	12	546883	546894	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020796	ATATGT	2	12	574862	574873	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020796	TTATTT	2	12	582078	582089	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020796	ACGTGT	2	12	597998	598009	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_020796	TAAGAC	2	12	614967	614978	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020796	ATAATG	2	12	625242	625253	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020796	TGTTAT	2	12	626171	626182	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020796	ATTTAA	2	12	658406	658417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020796	CGGCGT	2	12	685120	685131	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020796	GCGTTG	2	12	691428	691439	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020796	TGGCGC	2	12	691552	691563	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020796	ACGCTG	2	12	691641	691652	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020796	ATTTTT	2	12	692437	692448	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020796	TTTATA	2	12	699906	699917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020796	ACAATG	2	12	747587	747598	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020796	TTTAAT	2	12	802708	802719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020796	TGGGTG	2	12	802727	802738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020796	ATGTAA	2	12	818279	818290	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020796	CGTCGC	3	18	880932	880949	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020796	AGCGCG	2	12	887283	887294	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020796	ACGCTG	2	12	933385	933396	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020796	GGCTTT	2	12	956554	956565	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_020796	TTATTT	2	12	980992	981003	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020796	GAATAT	2	12	999046	999057	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020796	GATAAC	2	12	999544	999555	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020796	GCCGTC	2	12	1045182	1045193	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020796	CAGAGC	2	12	1053693	1053704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020796	TGCGCC	2	12	1065624	1065635	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020796	GCCTTC	2	12	1163111	1163122	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020796	TTTTGA	2	12	1164987	1164998	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020796	CTCTCC	2	12	1246215	1246226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_020796	GCGAGG	2	12	1276541	1276552	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_020796	ATAGGA	2	12	1286992	1287003	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020796	CAACGG	2	12	1328965	1328976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020796	CTCTGG	2	12	1341396	1341407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020796	GCGTCG	2	12	1353421	1353432	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020796	TTTCCC	6	36	1405188	1405223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020796	GGCGAT	2	12	1422190	1422201	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_020796	CGATGG	2	12	1422228	1422239	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020796	CGGCGC	2	12	1442428	1442439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020796	TCGCTC	2	12	1480376	1480387	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_020796	TAAAAA	2	12	1480674	1480685	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020796	CCCTCC	2	12	1487564	1487575	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
70	NC_020796	AACATA	2	12	1540647	1540658	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_020796	TTCGCA	2	12	1576146	1576157	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020796	CTTATT	2	12	1576255	1576266	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020796	GGGCGC	2	12	1581022	1581033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020796	TGATAA	2	12	1589811	1589822	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020796	TTATTT	2	12	1614956	1614967	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020796	ACGATG	2	12	1638713	1638724	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_020796	ATTACA	2	12	1691109	1691120	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020796	GTCACA	2	12	1714277	1714288	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020796	GTCACA	2	12	1727604	1727615	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020796	GCTGAT	2	12	1736857	1736868	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_020796	ATCGGC	2	12	1739547	1739558	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020796	CGGCGC	2	12	1752899	1752910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020796	GGCGCT	2	12	1753203	1753214	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020796	ATTACC	2	12	1760398	1760409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020796	CGGACG	2	12	1760457	1760468	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020796	TGTTAA	2	12	1791163	1791174	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020796	TGAATA	2	12	1819766	1819777	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020796	GAAAAT	2	12	1819967	1819978	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020796	TTTATT	2	12	1831559	1831570	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020796	TGATGC	2	12	1853994	1854005	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_020796	GGCGCC	2	12	1862769	1862780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020796	CGCGGT	2	12	1873260	1873271	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020796	GTCAAG	2	12	1888431	1888442	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_020796	CAAAAG	2	12	1894553	1894564	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_020796	ATCCAC	2	12	1903065	1903076	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020796	ATAGCA	2	12	1912405	1912416	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_020796	GAACAG	2	12	1915948	1915959	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_020796	AATATT	2	12	1933822	1933833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020796	CCGGCC	2	12	1957437	1957448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_020796	GCCTGA	2	12	1972004	1972015	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020796	CGCGGC	2	12	1976822	1976833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020796	TAAATT	2	12	1993560	1993571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020796	TAATCC	2	12	2002631	2002642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020796	ATATTG	2	12	2041583	2041594	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020796	CGTCGC	2	12	2043540	2043551	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020796	GCTATG	2	12	2060298	2060309	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_020796	GCGCTC	2	12	2062593	2062604	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020796	CCGCGC	2	12	2084389	2084400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_020796	GCCGCA	2	12	2093088	2093099	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020796	CAAAAA	2	12	2121739	2121750	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_020796	GACGTC	2	12	2131805	2131816	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020796	GCCAGC	2	12	2175883	2175894	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020796	CTCACT	2	12	2178653	2178664	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020796	ACCGAT	2	12	2211531	2211542	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020796	CGGTAG	3	18	2278650	2278667	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_020796	ATCAAA	2	12	2280562	2280573	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_020796	CACGCC	2	12	2314780	2314791	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_020796	GTTATC	2	12	2329400	2329411	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_020796	TACGCC	2	12	2338592	2338603	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020796	CCCTTC	2	12	2385296	2385307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_020796	TAAAAA	2	12	2424341	2424352	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020796	CGTCAC	2	12	2432697	2432708	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020796	GCCGAC	4	24	2438345	2438368	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020796	TCAGTT	2	12	2439011	2439022	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_020796	ATTTTA	2	12	2460572	2460583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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128	NC_020796	GGCGCC	2	12	2514013	2514024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020796	CTGACG	2	12	2534557	2534568	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.