MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL02

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018749	TTAA	2	8	1	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018749	AATT	2	8	22	29	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018749	AGTA	2	8	3615	3622	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018749	GTAA	2	8	6448	6455	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018749	TTTC	2	8	14413	14420	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018749	ATTA	2	8	15557	15564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018749	ATGT	2	8	15826	15833	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018749	ACTA	2	8	15876	15883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018749	AATC	2	8	16003	16010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018749	GGCT	3	12	16319	16330	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018749	GATT	2	8	17281	17288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018749	TAAA	2	8	17461	17468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018749	ACTA	2	8	18728	18735	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018749	TGGT	2	8	18859	18866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018749	TGCC	2	8	20130	20137	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018749	AAAC	2	8	25818	25825	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018749	TAGA	2	8	29238	29245	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018749	TTGA	2	8	29488	29495	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018749	TAAT	2	8	29519	29526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018749	GATT	2	8	31138	31145	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018749	TTTG	2	8	32231	32238	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018749	TTTA	2	8	34255	34262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018749	CATT	2	8	34265	34272	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018749	ACAA	2	8	35762	35769	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018749	ATCA	2	8	35781	35788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018749	TAAA	2	8	35789	35796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018749	CTTA	2	8	36202	36209	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018749	AAAT	2	8	41475	41482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018749	ATCC	2	8	45168	45175	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018749	TAAT	2	8	48331	48338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018749	ATAA	2	8	48392	48399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018749	TGAT	2	8	48603	48610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018749	CTGA	2	8	48724	48731	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018749	ATTG	2	8	48910	48917	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018749	GATT	2	8	49015	49022	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018749	TATT	2	8	49112	49119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018749	TTTG	2	8	50736	50743	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018749	GAAC	2	8	50812	50819	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018749	ATTA	2	8	50900	50907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018749	TCTT	2	8	51020	51027	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018749	AAAT	2	8	51031	51038	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018749	AATT	2	8	51291	51298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018749	TATT	2	8	56609	56616	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018749	TAAA	2	8	57443	57450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018749	TTCT	2	8	57456	57463	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018749	TAAT	2	8	71041	71048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018749	ATTT	2	8	71088	71095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018749	GTTT	2	8	71265	71272	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018749	TTTA	2	8	75808	75815	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018749	TACG	2	8	75826	75833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018749	TAAG	2	8	75855	75862	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018749	TAAT	2	8	75879	75886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018749	TAGT	2	8	77843	77850	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018749	CATT	2	8	78080	78087	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018749	TCTT	2	8	91506	91513	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018749	ACAA	2	8	91599	91606	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018749	TCAC	2	8	93751	93758	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018749	TTCA	2	8	93809	93816	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018749	ACTA	2	8	94069	94076	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018749	TCTT	2	8	94123	94130	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018749	GCTA	2	8	94140	94147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018749	CAAT	2	8	94157	94164	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018749	TCTT	2	8	94325	94332	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018749	AATA	2	8	96634	96641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.