MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL02

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018749	TTA	2	6	3584	3589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018749	AAG	2	6	3593	3598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018749	TAA	2	6	3699	3704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018749	TTA	2	6	3804	3809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018749	ATA	2	6	6541	6546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018749	CTT	2	6	6635	6640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018749	GAA	2	6	9473	9478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018749	TAT	2	6	9837	9842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018749	TCG	2	6	10655	10660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018749	TTA	2	6	11485	11490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018749	CAA	2	6	11551	11556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018749	AAT	2	6	12877	12882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018749	ATT	2	6	14084	14089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018749	CTT	2	6	14096	14101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018749	ATT	2	6	14137	14142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018749	CTT	2	6	14149	14154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018749	ATC	2	6	14186	14191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018749	CTT	2	6	14236	14241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018749	TAA	2	6	15639	15644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018749	ATT	2	6	15685	15690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018749	TTG	2	6	15721	15726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018749	AAG	2	6	15748	15753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018749	TAA	2	6	15757	15762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018749	CAA	2	6	15893	15898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018749	TAT	3	9	15923	15931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018749	ATT	2	6	15956	15961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018749	TGA	2	6	16135	16140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018749	TAA	2	6	16157	16162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018749	CGT	2	6	16226	16231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018749	ATC	2	6	17325	17330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018749	TAT	2	6	17427	17432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018749	ATG	2	6	17490	17495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018749	AAT	2	6	17496	17501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018749	GTA	2	6	17592	17597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018749	GAA	2	6	17695	17700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018749	TCT	2	6	17786	17791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018749	TAT	2	6	17805	17810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018749	TTA	2	6	17813	17818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018749	TGT	2	6	17843	17848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018749	ATT	2	6	17899	17904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018749	TGG	2	6	19064	19069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018749	TGG	2	6	19125	19130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018749	CAA	2	6	19135	19140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018749	TCA	2	6	19182	19187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018749	ATT	2	6	19915	19920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018749	GTT	2	6	20082	20087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018749	AGA	2	6	23444	23449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018749	TGT	2	6	23475	23480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018749	TTG	2	6	23507	23512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018749	GTT	2	6	23536	23541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018749	ATG	2	6	23555	23560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018749	GTT	2	6	23608	23613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018749	CAT	2	6	25607	25612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018749	TTC	2	6	25626	25631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018749	TTG	2	6	25685	25690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018749	TTG	2	6	25782	25787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018749	TTA	2	6	25849	25854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018749	AAC	2	6	25890	25895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018749	GGA	2	6	30706	30711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018749	TGA	3	9	30747	30755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018749	TAG	2	6	30806	30811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018749	TGG	2	6	31163	31168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018749	TAA	2	6	31315	31320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018749	TTC	2	6	31350	31355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018749	CAG	2	6	31430	31435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018749	ATT	2	6	31490	31495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018749	TAT	2	6	31506	31511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018749	ATT	2	6	31571	31576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018749	CTA	2	6	32093	32098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018749	AAG	2	6	32154	32159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018749	TTG	2	6	32330	32335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018749	AGT	2	6	34518	34523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018749	TAT	2	6	35810	35815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018749	ACA	2	6	35817	35822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018749	AAT	2	6	36188	36193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018749	TTA	2	6	42243	42248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018749	AGA	2	6	45198	45203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018749	CTA	2	6	45227	45232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018749	TTA	2	6	45326	45331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018749	GGA	2	6	45343	45348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018749	AGA	2	6	45359	45364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018749	ACT	2	6	45415	45420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018749	AAG	2	6	45423	45428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018749	TAG	2	6	45519	45524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018749	ATA	2	6	45533	45538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018749	TAT	2	6	45557	45562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018749	AAT	2	6	46942	46947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018749	TAG	2	6	48309	48314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018749	TAA	2	6	48525	48530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018749	ATA	2	6	48579	48584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018749	CTG	2	6	48693	48698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018749	TGC	2	6	48711	48716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018749	TGA	2	6	48739	48744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018749	TCA	2	6	48762	48767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018749	TAA	2	6	49123	49128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018749	ATT	2	6	49158	49163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018749	CCT	2	6	49179	49184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_018749	TAT	2	6	49279	49284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018749	TGA	2	6	50604	50609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018749	ACA	2	6	50657	50662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018749	ATT	2	6	50851	50856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018749	ACA	3	9	51128	51136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018749	TAG	2	6	51454	51459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018749	TAA	2	6	52183	52188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018749	TAT	2	6	56648	56653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018749	TAA	2	6	57402	57407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018749	TAA	2	6	59080	59085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018749	GTA	2	6	71074	71079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018749	TGA	2	6	71103	71108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018749	ATA	2	6	71290	71295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018749	TAA	2	6	72920	72925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018749	ATT	2	6	72948	72953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018749	TTG	2	6	72972	72977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018749	ATT	2	6	72987	72992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018749	TAA	2	6	73065	73070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018749	TGA	2	6	73130	73135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018749	ACT	2	6	73190	73195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018749	TCA	2	6	75913	75918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018749	TTA	2	6	77901	77906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018749	GAA	2	6	77934	77939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018749	AAT	2	6	77952	77957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018749	TAA	2	6	77958	77963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018749	ACA	2	6	78059	78064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018749	TAT	2	6	78156	78161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018749	ATT	2	6	78168	78173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018749	TAA	2	6	81293	81298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018749	TAT	2	6	90787	90792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018749	TTC	2	6	90795	90800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018749	AAC	2	6	91633	91638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018749	ACT	2	6	93763	93768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018749	ATA	2	6	93817	93822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018749	ACT	2	6	93845	93850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018749	CAT	2	6	93941	93946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018749	TAT	2	6	93954	93959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018749	ACT	2	6	93964	93969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018749	ACT	2	6	94182	94187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018749	ACT	2	6	94203	94208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018749	ACT	2	6	94224	94229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018749	ACT	2	6	94246	94251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018749	ACT	2	6	94268	94273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.