MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL05

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018745	GTT	2	6	309	314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018745	TAA	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018745	TTC	2	6	656	661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018745	TAA	2	6	693	698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018745	AAT	2	6	1004	1009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018745	TAC	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018745	TAG	2	6	1048	1053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018745	TGA	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018745	TCA	2	6	1268	1273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018745	ATT	3	9	1310	1318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018745	TAA	2	6	1321	1326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018745	ATT	2	6	1847	1852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018745	TTG	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018745	AGA	2	6	9618	9623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018745	TGG	2	6	9689	9694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018745	ATT	2	6	14139	14144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018745	ACA	2	6	14386	14391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018745	CTT	2	6	14447	14452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018745	AAT	2	6	14489	14494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018745	CTT	2	6	14544	14549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018745	AAT	2	6	14580	14585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018745	TCT	2	6	14681	14686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018745	GTT	2	6	14765	14770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018745	TCA	3	9	14878	14886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018745	CGA	2	6	14947	14952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018745	TCA	2	6	14984	14989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018745	ATA	2	6	15019	15024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018745	TAC	2	6	18396	18401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018745	TTA	2	6	18417	18422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018745	AGA	2	6	18591	18596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018745	AGG	2	6	18648	18653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018745	ATT	2	6	18656	18661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018745	TGA	2	6	18747	18752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018745	AAT	2	6	18944	18949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018745	GAA	2	6	19806	19811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018745	AAT	2	6	19865	19870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018745	TCT	2	6	19889	19894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018745	TAA	2	6	19898	19903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018745	ATA	2	6	19921	19926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018745	TAA	2	6	19980	19985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018745	TAA	2	6	19990	19995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018745	AAT	2	6	20008	20013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018745	GAT	2	6	20203	20208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018745	CAT	2	6	20215	20220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018745	CTT	2	6	20281	20286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018745	ACA	2	6	25052	25057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018745	TAT	2	6	25142	25147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018745	TGA	2	6	25179	25184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018745	AAT	2	6	25256	25261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018745	ATA	2	6	25278	25283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018745	GCA	2	6	25381	25386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018745	GTT	2	6	25679	25684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018745	AAT	2	6	25721	25726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018745	TTA	2	6	25941	25946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018745	AAT	3	9	26223	26231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018745	ATT	2	6	28801	28806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018745	GAA	2	6	28856	28861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018745	ATA	2	6	30040	30045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018745	GAA	2	6	30205	30210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018745	ATA	2	6	30216	30221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018745	ATA	2	6	30245	30250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018745	ACC	2	6	30325	30330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_018745	CTA	2	6	30356	30361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018745	ATA	2	6	30380	30385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018745	TAT	2	6	30395	30400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018745	ATC	2	6	30417	30422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018745	AAT	2	6	30444	30449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018745	TCG	2	6	30454	30459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018745	TTC	2	6	33004	33009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018745	ATA	2	6	34022	34027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018745	TAG	2	6	34034	34039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.