MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL03

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018743	TAAT	2	8	70	77	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018743	GAAA	2	8	7032	7039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018743	TCAT	2	8	7541	7548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018743	TAAA	2	8	7567	7574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018743	AATT	2	8	7585	7592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018743	GTTT	2	8	8353	8360	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018743	TCAT	2	8	9019	9026	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018743	CATC	2	8	9306	9313	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018743	TATT	2	8	9517	9524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018743	CGAC	2	8	9592	9599	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018743	CGAC	2	8	9975	9982	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018743	TAAA	2	8	11713	11720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018743	TAGA	2	8	11771	11778	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018743	ACTT	2	8	11848	11855	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018743	ACAA	2	8	12017	12024	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018743	GTAA	2	8	12946	12953	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018743	CGAA	2	8	15124	15131	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018743	TGAG	2	8	15429	15436	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018743	AAAG	2	8	15584	15591	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018743	TAAA	2	8	15862	15869	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018743	GATT	2	8	18702	18709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018743	TTAC	2	8	22706	22713	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018743	TTCA	2	8	24706	24713	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018743	AATA	2	8	49381	49388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018743	AGGT	2	8	49662	49669	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018743	ACTT	2	8	49938	49945	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018743	AAAG	2	8	50193	50200	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018743	ACCT	2	8	50661	50668	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018743	TGTC	2	8	50869	50876	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018743	TATC	2	8	51004	51011	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018743	CTTT	2	8	53234	53241	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018743	TCTT	2	8	53326	53333	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018743	CTTT	2	8	53338	53345	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018743	AGCC	2	8	55189	55196	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018743	TCCA	2	8	55587	55594	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018743	CAAA	2	8	55599	55606	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018743	CTTC	2	8	56148	56155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018743	ATTG	2	8	58200	58207	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018743	CTAC	2	8	58656	58663	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018743	ATAA	2	8	58817	58824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018743	ATTA	2	8	58914	58921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.