MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Exiguobacterium antarcticum B7 chromosome

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018665	CCGGTT	2	12	26455	26466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018665	AAGTAG	2	12	55703	55714	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018665	AAACAA	2	12	137248	137259	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018665	TGATTT	2	12	177458	177469	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018665	TGCGGT	2	12	177789	177800	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018665	CATTTG	2	12	177831	177842	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018665	TAAAGT	2	12	243691	243702	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018665	AACCAT	2	12	243708	243719	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018665	GCAAAT	2	12	248036	248047	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018665	TTTAAG	2	12	251001	251012	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018665	AAACGG	2	12	258964	258975	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018665	CAGAGA	2	12	351465	351476	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018665	AACGGA	2	12	383943	383954	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018665	GAAAAC	2	12	386652	386663	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018665	CAATTC	2	12	401784	401795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018665	TCACGA	2	12	510528	510539	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018665	TCGTCA	2	12	526624	526635	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018665	GAAGTT	2	12	528322	528333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018665	TATGAA	2	12	530112	530123	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018665	AAAAAC	2	12	540089	540100	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018665	CGCATG	2	12	545241	545252	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018665	AAAATA	2	12	548523	548534	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018665	TCCGAT	2	12	556001	556012	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018665	ATCAGA	2	12	567343	567354	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018665	TAAAAT	2	12	589736	589747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018665	GGAACG	2	12	626984	626995	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018665	GAGATG	2	12	691194	691205	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018665	AAAGAG	2	12	793300	793311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018665	GCGTAA	2	12	825855	825866	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018665	GTATAT	2	12	839200	839211	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018665	AAAGAG	2	12	875457	875468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018665	AAATAA	2	12	914943	914954	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018665	TTACTT	2	12	935397	935408	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018665	TGTCAT	2	12	935473	935484	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018665	GAACGT	2	12	968722	968733	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018665	TGATAT	2	12	983998	984009	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018665	GACGAA	2	12	1066234	1066245	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018665	TAAAGT	2	12	1167435	1167446	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018665	AACCAT	2	12	1167452	1167463	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018665	TCATTT	2	12	1231998	1232009	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018665	AAAGTG	2	12	1248564	1248575	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018665	AATGAA	2	12	1249686	1249697	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018665	AGACGA	2	12	1260181	1260192	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018665	GTTTCT	2	12	1273154	1273165	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018665	CCTTGA	2	12	1286486	1286497	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018665	AAACAG	2	12	1290282	1290293	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018665	GTGAAA	2	12	1296835	1296846	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018665	AAATGT	2	12	1306405	1306416	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018665	AAACGA	2	12	1356432	1356443	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018665	TCCGGC	2	12	1357478	1357489	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018665	TGAAAG	2	12	1368481	1368492	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018665	GAATGA	2	12	1372075	1372086	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018665	TTTTTC	2	12	1372332	1372343	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018665	AAACGG	2	12	1375306	1375317	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018665	TAAAGT	2	12	1378133	1378144	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018665	AACCAT	2	12	1378150	1378161	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018665	TTTAGA	2	12	1378213	1378224	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018665	GCGAAT	2	12	1378604	1378615	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018665	ACGGAT	2	12	1378973	1378984	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018665	GAAGCG	2	12	1382718	1382729	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018665	TAAGCA	2	12	1413589	1413600	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018665	GATAAT	2	12	1453460	1453471	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018665	GACATT	2	12	1466236	1466247	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018665	GTTTTT	2	12	1467841	1467852	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018665	GTTTTT	2	12	1477039	1477050	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018665	TTTTCC	2	12	1491876	1491887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018665	CCTATC	2	12	1508407	1508418	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018665	TACCGG	2	12	1509846	1509857	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018665	ACAATC	2	12	1552821	1552832	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018665	GGAATG	2	12	1558931	1558942	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018665	ACCGTC	2	12	1576971	1576982	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018665	TTTTCA	2	12	1578024	1578035	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_018665	GTCCCT	2	12	1578114	1578125	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018665	TCTTTT	2	12	1579177	1579188	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018665	TCCTTC	2	12	1579271	1579282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018665	CTGTCC	2	12	1591292	1591303	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018665	ACTTTC	2	12	1599818	1599829	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018665	AGAAAA	2	12	1616811	1616822	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018665	TATCAC	2	12	1637428	1637439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018665	AGATTA	2	12	1788305	1788316	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018665	GTTTTT	2	12	1807660	1807671	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018665	AATAAC	2	12	1854081	1854092	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018665	ATTTTT	2	12	1858942	1858953	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018665	TCGACT	2	12	1898503	1898514	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018665	TTTCAT	2	12	1940022	1940033	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018665	TCGTTT	2	12	1943735	1943746	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018665	TCATTT	2	12	2052809	2052820	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018665	CCTTTT	2	12	2091601	2091612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018665	AAAGTG	2	12	2097695	2097706	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018665	AGTACT	2	12	2188258	2188269	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018665	GGCAGA	2	12	2230522	2230533	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018665	TAACAC	2	12	2297344	2297355	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018665	AGAAAA	2	12	2305854	2305865	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018665	CTTCCC	2	12	2322523	2322534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_018665	GTTTTA	3	18	2334123	2334140	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018665	ACCTTT	2	12	2391700	2391711	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018665	CGAATA	2	12	2392541	2392552	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018665	TAGTAT	2	12	2436213	2436224	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018665	TTCTGT	2	12	2451981	2451992	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018665	AAAAGA	2	12	2494336	2494347	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018665	TCAAAA	2	12	2500662	2500673	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018665	TAAAAA	2	12	2512384	2512395	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018665	TCGCTT	2	12	2541927	2541938	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018665	TCATTC	2	12	2550375	2550386	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018665	CGACAT	2	12	2562768	2562779	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018665	TTTGTT	2	12	2566815	2566826	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018665	TTAAAA	2	12	2579381	2579392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018665	TCTCTA	2	12	2584423	2584434	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018665	CACTTC	2	12	2585200	2585211	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018665	TGCAGA	2	12	2594776	2594787	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018665	AAAATG	2	12	2602182	2602193	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018665	TAAGAA	2	12	2616437	2616448	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018665	ACTAAA	2	12	2627043	2627054	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_018665	TTCCCT	2	12	2649972	2649983	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018665	CGTTTT	2	12	2655709	2655720	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018665	ACCGTT	2	12	2669064	2669075	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018665	ATTTTT	2	12	2681778	2681789	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018665	ACAATA	2	12	2704761	2704772	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018665	ATCCGT	2	12	2710376	2710387	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018665	ATTCGC	2	12	2710745	2710756	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018665	TCTAAA	2	12	2711136	2711147	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018665	CTTTTC	2	12	2711261	2711272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018665	GAAAAG	2	12	2716569	2716580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018665	AAGACG	2	12	2781673	2781684	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_018665	GAAAAG	2	12	2803471	2803482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018665	AAAAGA	2	12	2813895	2813906	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.