MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pESBL-EA11

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018659	TG	3	6	588	593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018659	AG	3	6	1286	1291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018659	AT	3	6	3025	3030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018659	AC	3	6	20169	20174	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018659	GT	3	6	20829	20834	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018659	AT	3	6	30184	30189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018659	TA	3	6	31719	31724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018659	GA	3	6	31805	31810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018659	AT	3	6	32115	32120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018659	GT	3	6	32336	32341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018659	AC	3	6	32710	32715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018659	TC	3	6	33898	33903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018659	AT	3	6	34920	34925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018659	GA	3	6	36306	36311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018659	CG	3	6	37941	37946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018659	TA	3	6	38427	38432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018659	AT	3	6	38442	38447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018659	AT	3	6	39978	39983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018659	TC	3	6	39984	39989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018659	TA	3	6	44592	44597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018659	GT	3	6	46104	46109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018659	CA	3	6	46161	46166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018659	AT	3	6	47605	47610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018659	AT	3	6	49746	49751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018659	CA	3	6	53137	53142	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018659	GT	3	6	53186	53191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018659	GT	3	6	53317	53322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018659	CG	3	6	58487	58492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018659	GT	3	6	58863	58868	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018659	CG	3	6	60054	60059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018659	GT	3	6	65207	65212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018659	CT	3	6	66007	66012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018659	GT	3	6	68607	68612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018659	GA	3	6	68736	68741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018659	TC	3	6	70226	70231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018659	TC	3	6	80307	80312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018659	TA	3	6	82241	82246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018659	TC	3	6	82278	82283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018659	AT	3	6	82303	82308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018659	AG	3	6	87390	87395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018659	AG	3	6	88227	88232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018659	CA	3	6	88233	88238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.