MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 chromosome

Total Repeats: 1922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018658	ATCG	2	8	8553	8560	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018658	TCAC	2	8	14390	14397	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018658	TACT	2	8	16833	16840	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018658	CTTA	2	8	17339	17346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018658	GGGA	2	8	30007	30014	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018658	TAAA	2	8	30592	30599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018658	ATGC	2	8	36696	36703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018658	TATG	2	8	45676	45683	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018658	AATT	2	8	47107	47114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018658	AAAT	2	8	47676	47683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018658	ATTC	2	8	47719	47726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018658	ATGA	2	8	51680	51687	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018658	CGAT	2	8	56184	56191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018658	CGAT	2	8	56197	56204	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018658	ATCG	2	8	56214	56221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018658	TCTG	2	8	57285	57292	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018658	TCAG	2	8	58196	58203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018658	TTTA	2	8	58641	58648	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018658	GACG	2	8	58869	58876	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018658	GATA	2	8	59000	59007	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018658	TTAT	2	8	59668	59675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018658	CCGT	2	8	60284	60291	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018658	CTGC	2	8	60539	60546	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018658	GTGA	2	8	62249	62256	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018658	TCCC	2	8	62921	62928	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_018658	TTGA	2	8	64718	64725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018658	CAAT	2	8	64783	64790	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018658	CTGG	2	8	64967	64974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018658	GCGG	2	8	65028	65035	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018658	CAGC	2	8	65120	65127	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018658	CGGC	2	8	69457	69464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018658	TAAC	2	8	93636	93643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018658	AAAT	2	8	93814	93821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018658	TCTG	2	8	111340	111347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018658	AAAG	2	8	111517	111524	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018658	TCAA	2	8	111584	111591	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018658	AAAG	2	8	112465	112472	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018658	AAAT	2	8	118773	118780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018658	AGGA	2	8	121828	121835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018658	TGAT	2	8	121881	121888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018658	ATAA	2	8	133446	133453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018658	ATCA	2	8	134495	134502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018658	TTAT	2	8	134573	134580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018658	GCTG	2	8	142130	142137	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018658	TACA	2	8	146131	146138	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018658	AATG	2	8	149925	149932	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018658	GAAA	2	8	155989	155996	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018658	TTAA	2	8	156092	156099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018658	ATTA	2	8	156798	156805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018658	GAGT	2	8	163509	163516	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018658	TAAA	2	8	163531	163538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018658	TCAT	2	8	163548	163555	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018658	CTTA	2	8	163753	163760	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018658	TTGC	2	8	164286	164293	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018658	ACCT	2	8	164554	164561	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018658	TGTT	2	8	167492	167499	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018658	TTCC	2	8	167502	167509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018658	TAAA	2	8	167550	167557	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018658	ATTT	2	8	171820	171827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018658	ATTA	2	8	175858	175865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018658	AAAT	2	8	175873	175880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018658	TGTC	2	8	189558	189565	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018658	TGAT	2	8	191233	191240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018658	AAGG	2	8	194191	194198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018658	GTTT	2	8	194426	194433	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018658	GGCG	2	8	194454	194461	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018658	GCTG	2	8	195923	195930	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018658	ATCC	2	8	195992	195999	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018658	TGGA	2	8	196048	196055	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018658	AGGA	2	8	196335	196342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018658	ATTC	2	8	201686	201693	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018658	GCGA	2	8	202972	202979	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_018658	CGAT	2	8	204488	204495	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018658	CCTG	2	8	205960	205967	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018658	TAAT	3	12	206004	206015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018658	ATAA	2	8	208115	208122	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018658	TCCA	2	8	208488	208495	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018658	CCTT	2	8	208511	208518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018658	CAGA	2	8	211756	211763	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018658	ATTT	2	8	212081	212088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018658	CGAT	2	8	212119	212126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018658	TATT	2	8	212127	212134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018658	GTAA	2	8	216021	216028	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018658	TCAT	2	8	220326	220333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018658	AAAT	2	8	221678	221685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018658	AATT	2	8	221838	221845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018658	GTTT	2	8	227673	227680	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018658	TTCG	2	8	229494	229501	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_018658	TGGC	2	8	229836	229843	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018658	TTTG	2	8	230039	230046	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018658	AGAA	2	8	237284	237291	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018658	GCAA	2	8	240909	240916	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_018658	ATTA	2	8	241896	241903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018658	CTGG	2	8	260398	260405	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018658	TAAA	2	8	264255	264262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018658	CAGC	2	8	267575	267582	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018658	GGCT	2	8	267594	267601	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018658	ATTG	2	8	269539	269546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018658	AAAT	2	8	271251	271258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018658	TGCT	2	8	272847	272854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_018658	ATTT	2	8	272957	272964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018658	ATCA	2	8	272965	272972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_018658	ATTA	2	8	273000	273007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018658	TAAG	2	8	280667	280674	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018658	CTTT	2	8	280858	280865	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_018658	AATA	2	8	286442	286449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018658	ACTA	2	8	286901	286908	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018658	CAGA	2	8	288041	288048	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018658	CTGG	2	8	290829	290836	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_018658	CTGG	2	8	291060	291067	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018658	GTAA	2	8	293783	293790	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018658	CTAT	2	8	299298	299305	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018658	TACT	2	8	302830	302837	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018658	ATCT	2	8	310717	310724	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018658	AACC	2	8	310878	310885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018658	AGTT	2	8	310889	310896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018658	GGCT	2	8	316399	316406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018658	ATTT	2	8	317964	317971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018658	TAAA	2	8	330735	330742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018658	ATTG	2	8	334369	334376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018658	GGAA	2	8	335310	335317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018658	ATAA	2	8	336714	336721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018658	GGAT	2	8	336779	336786	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018658	TTAA	2	8	338063	338070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018658	GGCA	2	8	338841	338848	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_018658	TTTA	2	8	339217	339224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018658	CGAT	2	8	339713	339720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018658	TAAT	2	8	340075	340082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018658	GCAT	2	8	340315	340322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_018658	GGAT	2	8	340556	340563	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018658	GAAA	2	8	345818	345825	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018658	AAGG	2	8	345925	345932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018658	GCGT	2	8	346028	346035	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018658	ATCT	2	8	346467	346474	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018658	TCAT	2	8	355613	355620	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018658	TACG	2	8	356358	356365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018658	TATC	2	8	367788	367795	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_018658	GCGG	2	8	369115	369122	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018658	TTGA	2	8	372828	372835	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018658	TAAA	2	8	381018	381025	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018658	TTAT	2	8	382963	382970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018658	AAAT	2	8	383064	383071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018658	AAGG	2	8	383078	383085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018658	AGCC	2	8	383816	383823	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_018658	GCCT	2	8	385834	385841	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_018658	CTCG	2	8	385855	385862	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018658	ATCT	2	8	386010	386017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_018658	GGAT	2	8	387076	387083	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018658	TTGT	2	8	406089	406096	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018658	AAAG	2	8	406097	406104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018658	TAAT	2	8	414906	414913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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