MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid pAA-09EL50

Total Repeats: 265

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018654	TTC	2	6	1345	1350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018654	GCG	2	6	3389	3394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018654	AAT	2	6	3397	3402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018654	GGT	2	6	4769	4774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018654	GCC	2	6	4818	4823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_018654	TCT	2	6	5501	5506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018654	CAC	3	9	5610	5618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_018654	ACG	2	6	5667	5672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018654	AGG	2	6	5753	5758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018654	ATT	2	6	5802	5807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018654	CAT	2	6	7058	7063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018654	ATA	2	6	7069	7074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018654	TTA	2	6	7138	7143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018654	AGG	2	6	7185	7190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018654	AGG	2	6	9581	9586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018654	TAA	2	6	10067	10072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018654	ATA	2	6	10073	10078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018654	CAC	2	6	10699	10704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_018654	CGC	2	6	11226	11231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_018654	CTG	2	6	11246	11251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018654	GTG	2	6	11387	11392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018654	CCA	2	6	11394	11399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_018654	TGC	2	6	13766	13771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018654	TAC	2	6	14686	14691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018654	TAA	2	6	14749	14754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018654	CTC	2	6	15262	15267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_018654	CGG	2	6	15357	15362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018654	GCA	2	6	15412	15417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018654	CAC	2	6	15485	15490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_018654	GCA	2	6	15504	15509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018654	TAA	2	6	15585	15590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018654	TAT	2	6	15595	15600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018654	TAA	2	6	15688	15693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018654	GGA	2	6	16971	16976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018654	ATG	2	6	17269	17274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018654	TTG	2	6	17301	17306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018654	TCA	2	6	17592	17597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018654	TAT	2	6	17614	17619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018654	TAT	2	6	17693	17698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018654	TAA	2	6	17722	17727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018654	GAA	2	6	19087	19092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018654	GAA	2	6	19149	19154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018654	GAA	2	6	19177	19182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018654	TAG	2	6	19208	19213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018654	CAT	2	6	19239	19244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018654	TGC	2	6	19325	19330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018654	AGT	2	6	20287	20292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018654	ATT	2	6	20318	20323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018654	TGA	2	6	20348	20353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018654	TCA	2	6	20403	20408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018654	TAT	2	6	20914	20919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018654	AAT	2	6	20972	20977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018654	TTA	2	6	21894	21899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018654	ATT	2	6	21954	21959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018654	ATC	2	6	22073	22078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018654	GCT	2	6	22152	22157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018654	AAC	3	9	22178	22186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018654	GCC	2	6	22257	22262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_018654	GGC	2	6	22292	22297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018654	AAT	2	6	22306	22311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018654	GAA	2	6	22397	22402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018654	AAT	2	6	22420	22425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018654	CAA	2	6	23357	23362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018654	GAA	2	6	23385	23390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018654	GAT	2	6	23476	23481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018654	GAA	2	6	23507	23512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018654	CAC	2	6	23551	23556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_018654	AGG	2	6	23583	23588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018654	GCA	2	6	23653	23658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018654	CCT	2	6	23730	23735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_018654	GTA	2	6	23831	23836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018654	GAG	2	6	25495	25500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018654	TCA	2	6	25576	25581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018654	GAC	2	6	25634	25639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018654	CGA	2	6	25923	25928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018654	CTC	2	6	25951	25956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_018654	TTA	2	6	25976	25981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018654	GAT	2	6	25998	26003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018654	TGG	2	6	26066	26071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018654	ATT	2	6	26218	26223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018654	AAC	2	6	26315	26320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018654	TTG	2	6	26335	26340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018654	TAA	2	6	26352	26357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018654	ACC	2	6	26501	26506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_018654	GCC	2	6	26658	26663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_018654	CCT	2	6	26664	26669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_018654	AGG	2	6	26673	26678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018654	ATA	2	6	26684	26689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018654	TAT	2	6	26770	26775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018654	GAA	2	6	27933	27938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018654	GAA	2	6	27995	28000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018654	GAA	2	6	28023	28028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018654	ATA	2	6	28084	28089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018654	AGA	2	6	28152	28157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018654	CAA	2	6	28189	28194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018654	GCA	2	6	28385	28390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018654	ATT	2	6	28427	28432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018654	CAA	2	6	28704	28709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018654	TAG	2	6	28797	28802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018654	CGG	2	6	28965	28970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018654	GTG	2	6	28996	29001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018654	CTG	2	6	29030	29035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018654	TGC	2	6	29151	29156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018654	CTG	2	6	29289	29294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018654	AGA	2	6	29350	29355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018654	GCA	2	6	29475	29480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018654	TAT	2	6	29515	29520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018654	TGG	2	6	29565	29570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018654	ATT	2	6	29589	29594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018654	CGG	2	6	29629	29634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018654	CAT	2	6	29667	29672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018654	GTT	2	6	29832	29837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018654	GTT	2	6	30077	30082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018654	TAA	2	6	30096	30101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018654	TAG	2	6	30148	30153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018654	TTC	2	6	30364	30369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018654	AGT	2	6	30539	30544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018654	TAT	2	6	30550	30555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018654	TAC	2	6	30556	30561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018654	TAC	2	6	30673	30678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018654	ATA	3	9	30690	30698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018654	CGC	2	6	30719	30724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_018654	TTG	2	6	30901	30906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018654	AAC	2	6	30936	30941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018654	GAT	2	6	30947	30952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018654	GTC	2	6	31116	31121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018654	ATG	2	6	31213	31218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018654	CCT	2	6	31307	31312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_018654	AAT	2	6	31323	31328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018654	CAG	2	6	31590	31595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018654	GTC	2	6	31648	31653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018654	CAG	2	6	31677	31682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018654	ATA	2	6	31693	31698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018654	GTG	2	6	31714	31719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018654	TAA	2	6	31739	31744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018654	GGC	2	6	31766	31771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018654	CAT	2	6	31784	31789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018654	TAT	2	6	31914	31919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018654	GCA	2	6	31955	31960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018654	ATT	2	6	32279	32284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018654	GCA	2	6	32306	32311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018654	CCG	2	6	32376	32381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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144	NC_018654	CGG	2	6	32416	32421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_018654	TAT	2	6	37964	37969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_018654	ATC	2	6	38465	38470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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173	NC_018654	CTG	2	6	47592	47597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_018654	GTA	2	6	47627	47632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_018654	CGC	2	6	74035	74040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.