MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid p09EL50

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018651	TAA	2	6	59	64	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018651	CAG	2	6	77	82	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018651	TAA	2	6	233	238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018651	ATC	2	6	268	273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018651	GCG	2	6	285	290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018651	ATC	2	6	358	363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018651	TGA	2	6	371	376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018651	GCT	2	6	589	594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018651	CGG	2	6	599	604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018651	CTG	2	6	605	610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018651	GCA	2	6	637	642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018651	GTT	2	6	725	730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018651	AAT	2	6	738	743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018651	CAT	2	6	762	767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018651	CGA	2	6	959	964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018651	GAA	2	6	1096	1101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018651	TCA	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018651	CCT	2	6	1235	1240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_018651	AGT	2	6	1365	1370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018651	ACC	2	6	1471	1476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_018651	TTG	2	6	1515	1520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018651	GCC	2	6	1561	1566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_018651	TGC	2	6	1677	1682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018651	TGC	2	6	1695	1700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018651	CTG	2	6	1820	1825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018651	GTT	2	6	2032	2037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018651	CAT	2	6	2208	2213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018651	CAA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018651	CTG	2	6	2330	2335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018651	ACG	2	6	2404	2409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018651	CTG	2	6	2424	2429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018651	ACC	2	6	2466	2471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_018651	CCA	2	6	2489	2494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_018651	CAG	2	6	2528	2533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018651	ATC	2	6	2613	2618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018651	AAT	2	6	2703	2708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018651	GCA	2	6	2749	2754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018651	ACC	2	6	2841	2846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_018651	CCA	2	6	2863	2868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_018651	TTG	2	6	2978	2983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018651	TCG	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018651	CTT	2	6	3056	3061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018651	GAA	2	6	3172	3177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018651	CAT	2	6	4204	4209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018651	TAA	2	6	4228	4233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018651	TGT	2	6	6258	6263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018651	AAT	2	6	6303	6308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018651	AAC	2	6	13070	13075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018651	TAA	2	6	13163	13168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018651	TTA	2	6	13174	13179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018651	CTA	2	6	18342	18347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018651	ATG	2	6	18353	18358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018651	TCA	2	6	18994	18999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018651	TTA	2	6	20755	20760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018651	ATT	2	6	20834	20839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018651	CGA	2	6	20857	20862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018651	TCG	2	6	20949	20954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018651	ATG	2	6	22225	22230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018651	CAA	2	6	22259	22264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018651	TAT	2	6	22471	22476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018651	CAC	2	6	22502	22507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_018651	CGA	2	6	22556	22561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018651	TCA	2	6	22565	22570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018651	CCA	2	6	22613	22618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_018651	TGG	2	6	22739	22744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018651	TTG	2	6	23299	23304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018651	CCA	2	6	23443	23448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_018651	GTG	2	6	23452	23457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018651	TAA	2	6	23462	23467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018651	TGT	2	6	23509	23514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018651	TGA	2	6	23539	23544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018651	AGA	2	6	23546	23551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018651	AAC	2	6	24953	24958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018651	ATA	2	6	24979	24984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018651	TTC	2	6	25040	25045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018651	TGT	2	6	25442	25447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018651	TGC	2	6	25506	25511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018651	TGG	2	6	25549	25554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018651	TGT	2	6	25819	25824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018651	TTG	2	6	25829	25834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018651	TTA	2	6	25838	25843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018651	ATT	2	6	25936	25941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018651	TGG	2	6	25965	25970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018651	CGC	2	6	26155	26160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_018651	GAT	2	6	26303	26308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018651	AGG	2	6	26335	26340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018651	CCT	2	6	26348	26353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_018651	CTT	2	6	26379	26384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018651	TGT	2	6	26394	26399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018651	GGT	2	6	26533	26538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018651	TCT	2	6	26539	26544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018651	TCG	2	6	26557	26562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018651	TTC	2	6	26575	26580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018651	GTT	2	6	26619	26624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018651	GTT	2	6	26633	26638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018651	TTC	2	6	26780	26785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018651	GTT	2	6	26952	26957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018651	GTT	2	6	26977	26982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018651	TTG	2	6	27028	27033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018651	GTC	2	6	27046	27051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018651	CTG	2	6	27082	27087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018651	AAG	2	6	27105	27110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018651	TTG	2	6	27165	27170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018651	GTT	2	6	27183	27188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018651	AAC	2	6	27203	27208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018651	ACT	2	6	27848	27853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018651	GTT	2	6	27863	27868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018651	TTA	2	6	27881	27886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018651	AGG	2	6	27938	27943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018651	GTT	2	6	27996	28001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018651	CTT	2	6	30050	30055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018651	TCT	2	6	36901	36906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018651	TTA	2	6	38137	38142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018651	ATG	2	6	39891	39896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018651	ATT	2	6	39899	39904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018651	GGT	2	6	40742	40747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018651	TTA	2	6	40835	40840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018651	ATA	2	6	40890	40895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018651	GTT	2	6	41515	41520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018651	GTT	2	6	42244	42249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018651	AAC	2	6	42299	42304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018651	TTG	2	6	42755	42760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018651	GAA	2	6	42803	42808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018651	CAA	2	6	42816	42821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018651	CAA	2	6	42837	42842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018651	TCA	2	6	42896	42901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018651	AAT	2	6	42926	42931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018651	GCC	2	6	43046	43051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_018651	TAA	2	6	43801	43806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018651	TTA	2	6	43807	43812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018651	TAA	2	6	44673	44678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018651	AAG	2	6	45418	45423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018651	ATT	2	6	50193	50198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018651	TGG	2	6	50250	50255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018651	CCA	2	6	50263	50268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_018651	TAG	2	6	50315	50320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018651	CTT	2	6	51218	51223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018651	GTT	2	6	52461	52466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018651	AGA	2	6	52502	52507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018651	CCA	2	6	52523	52528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_018651	CTT	2	6	58185	58190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018651	AAC	2	6	59520	59525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.