MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 chromosome

Total Repeats: 14103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018650	CCA	2	6	197318	197323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_018650	CGG	2	6	197386	197391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_018650	T	7	7	197425	197431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_018650	TCA	2	6	197509	197514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_018650	GAATAC	2	12	197527	197538	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
506	NC_018650	TG	3	6	197616	197621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_018650	TAA	2	6	197622	197627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_018650	CCG	3	9	197663	197671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_018650	CTG	2	6	197728	197733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_018650	TTG	2	6	197747	197752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_018650	CGC	2	6	197769	197774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_018650	AGGGGC	2	12	197899	197910	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
513	NC_018650	CAG	2	6	197929	197934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_018650	AGC	2	6	197953	197958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_018650	TTC	2	6	197981	197986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_018650	GCTG	2	8	198000	198007	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
517	NC_018650	TAA	2	6	198008	198013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_018650	CGG	2	6	198021	198026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_018650	ATCC	2	8	198069	198076	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
520	NC_018650	CGG	2	6	198114	198119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_018650	TGGA	2	8	198125	198132	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_018650	ATC	2	6	198134	198139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_018650	GGC	2	6	198209	198214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_018650	GTTCCC	2	12	198344	198355	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
525	NC_018650	GGC	2	6	198394	198399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_018650	AGGA	2	8	198412	198419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
527	NC_018650	GGC	2	6	198433	198438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_018650	TGG	2	6	198447	198452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_018650	TGC	2	6	198465	198470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_018650	A	6	6	198564	198569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_018650	GTT	2	6	199677	199682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_018650	CGC	2	6	199728	199733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_018650	TCA	2	6	199778	199783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_018650	CTG	2	6	200976	200981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_018650	ATTC	2	8	203763	203770	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
536	NC_018650	GA	3	6	203781	203786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_018650	TAA	2	6	204847	204852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_018650	TTG	2	6	204977	204982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_018650	TCA	2	6	205029	205034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_018650	ATTTT	2	10	205039	205048	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_018650	GCGA	2	8	205049	205056	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
542	NC_018650	CAT	2	6	205136	205141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_018650	T	7	7	206552	206558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_018650	CGAT	2	8	206565	206572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
545	NC_018650	CCTG	2	8	208037	208044	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
546	NC_018650	TA	3	6	208069	208074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_018650	TAAT	3	12	208081	208092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_018650	A	7	7	210078	210084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_018650	AAT	2	6	210119	210124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_018650	ATAA	2	8	210192	210199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_018650	TCCA	2	8	210565	210572	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_018650	CCTT	2	8	210588	210595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_018650	GGC	2	6	211540	211545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_018650	TTA	2	6	213625	213630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_018650	T	7	7	213653	213659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_018650	ATA	2	6	213671	213676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_018650	TAA	2	6	213687	213692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_018650	TCT	2	6	213693	213698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_018650	AT	3	6	213718	213723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_018650	T	7	7	213737	213743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_018650	GAA	2	6	213760	213765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_018650	TTA	2	6	213772	213777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_018650	CAGA	2	8	213833	213840	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
564	NC_018650	CGG	2	6	214102	214107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_018650	ATTT	2	8	214158	214165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_018650	ATA	2	6	214175	214180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_018650	CGAT	2	8	214196	214203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
568	NC_018650	TATT	2	8	214204	214211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_018650	A	7	7	214227	214233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_018650	TAA	2	6	214508	214513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_018650	TAC	2	6	214618	214623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_018650	CAA	2	6	214688	214693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_018650	TCA	2	6	214737	214742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_018650	CTC	2	6	215072	215077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_018650	GATTC	2	10	215175	215184	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
576	NC_018650	AT	3	6	215236	215241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_018650	A	6	6	215312	215317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_018650	T	6	6	215334	215339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_018650	ACA	2	6	215349	215354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_018650	GT	3	6	215457	215462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_018650	T	7	7	215473	215479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_018650	TC	3	6	217237	217242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_018650	ATG	2	6	217278	217283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_018650	GAA	2	6	217294	217299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_018650	TAA	2	6	218007	218012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_018650	ATT	2	6	218071	218076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_018650	GTAA	2	8	218098	218105	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
588	NC_018650	CTA	2	6	221537	221542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_018650	AAT	2	6	221568	221573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_018650	AAC	2	6	222337	222342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_018650	ATA	2	6	222375	222380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_018650	AAT	2	6	222390	222395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_018650	TCAT	2	8	222403	222410	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
594	NC_018650	TTA	2	6	222514	222519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_018650	AAAT	2	8	223755	223762	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_018650	T	6	6	223790	223795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_018650	AAT	2	6	223817	223822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_018650	AT	3	6	223836	223841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_018650	TA	3	6	223852	223857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_018650	TAAATA	2	12	223863	223874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_018650	A	6	6	223882	223887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_018650	T	6	6	223903	223908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_018650	AATT	2	8	223915	223922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_018650	TTG	2	6	223944	223949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_018650	AAT	2	6	223971	223976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_018650	T	6	6	223981	223986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_018650	AAC	2	6	224021	224026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_018650	TA	3	6	224043	224048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_018650	ATC	2	6	224604	224609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_018650	TC	3	6	224608	224613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
611	NC_018650	ATT	2	6	224638	224643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_018650	CG	3	6	229653	229658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
613	NC_018650	GTTT	2	8	229750	229757	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
614	NC_018650	CTG	2	6	231457	231462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_018650	TTCG	2	8	231571	231578	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
616	NC_018650	T	6	6	231649	231654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_018650	TCGAC	2	10	231700	231709	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
618	NC_018650	GCG	2	6	231771	231776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_018650	AC	3	6	231796	231801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
620	NC_018650	CA	3	6	231802	231807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_018650	T	7	7	231874	231880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_018650	T	7	7	231896	231902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_018650	TGGC	2	8	231913	231920	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
624	NC_018650	T	7	7	231991	231997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_018650	CTG	2	6	232082	232087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_018650	T	7	7	232105	232111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_018650	TTTG	2	8	232116	232123	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
628	NC_018650	GGA	2	6	232214	232219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_018650	A	6	6	232286	232291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_018650	A	6	6	232293	232298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_018650	ACA	2	6	232334	232339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_018650	GCA	2	6	234020	234025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_018650	AGAA	2	8	239361	239368	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
634	NC_018650	A	6	6	239441	239446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_018650	GAG	2	6	239476	239481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_018650	TGG	2	6	239687	239692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_018650	GA	4	8	239705	239712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
638	NC_018650	TA	3	6	239733	239738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_018650	ACA	2	6	239743	239748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_018650	ACA	2	6	239807	239812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_018650	GGC	2	6	239815	239820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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952	NC_018650	ATT	2	6	341423	341428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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