MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus faecalis D32 chromosome

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018221	TTTTTC	2	12	85946	85957	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018221	AATTCA	2	12	88587	88598	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018221	TAAAAA	2	12	130168	130179	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018221	ACCTCT	2	12	194807	194818	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018221	GTTATT	2	12	201109	201120	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018221	TAGGCG	2	12	221664	221675	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018221	TGGAAG	2	12	223114	223125	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018221	TCATAT	2	12	223552	223563	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018221	GTTTAG	2	12	274468	274479	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018221	AAAAAG	2	12	310078	310089	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018221	AAAAAG	2	12	340857	340868	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018221	AAAAAT	2	12	372421	372432	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018221	GTCCTC	2	12	378665	378676	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018221	TACAAA	2	12	393668	393679	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018221	TTTAAA	2	12	419759	419770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018221	TAAAAA	2	12	421230	421241	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018221	AGAAAA	2	12	439287	439298	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018221	AAATAT	2	12	465902	465913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018221	ATTAAA	2	12	532427	532438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018221	AAAAAG	2	12	551062	551073	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018221	TTTTCA	2	12	555946	555957	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018221	TGAAAA	2	12	556109	556120	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018221	AAACAA	2	12	564020	564031	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018221	TTACAT	2	12	633939	633950	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018221	GGTGAC	2	12	636407	636418	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018221	TAGAAG	2	12	652592	652603	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018221	AAAGGA	2	12	663710	663721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018221	CTTTAT	2	12	666606	666617	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018221	AGAAAA	2	12	685496	685507	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018221	CTTTTT	2	12	685727	685738	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018221	ATATAA	2	12	688066	688077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018221	TTTTAT	2	12	726585	726596	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018221	TTAAAA	2	12	783748	783759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018221	AGTCTA	2	12	811642	811653	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018221	TTCATT	2	12	846278	846289	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018221	AATAAA	2	12	876490	876501	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018221	CTTTTT	2	12	882390	882401	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018221	TAGGCG	2	12	900993	901004	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018221	TGGAAG	2	12	902443	902454	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018221	AAAAAG	2	12	932721	932732	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018221	AAAAAT	2	12	934848	934859	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018221	AGAAAA	2	12	946053	946064	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018221	TATGCT	2	12	947068	947079	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018221	AATGAA	2	12	956042	956053	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018221	AAAGGA	2	12	960966	960977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018221	AATGAA	2	12	989669	989680	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018221	GTTATT	2	12	992447	992458	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018221	ACTATC	2	12	1047696	1047707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018221	TTTGTA	2	12	1056650	1056661	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018221	TTTTTC	2	12	1068973	1068984	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018221	ATGAGA	2	12	1069030	1069041	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018221	TTTAAA	2	12	1073193	1073204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018221	TAAAAA	2	12	1093519	1093530	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018221	AAAAAG	2	12	1124071	1124082	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018221	AATTCC	2	12	1177901	1177912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018221	AAGAAA	2	12	1213876	1213887	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018221	GAGATA	2	12	1271667	1271678	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018221	ATACTA	2	12	1276618	1276629	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018221	TTTAAT	2	12	1390341	1390352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018221	ATCTCT	2	12	1457825	1457836	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018221	ATAAAA	2	12	1542938	1542949	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018221	TAAAAC	2	12	1557022	1557033	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018221	TGGTTA	2	12	1569417	1569428	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018221	TAAAAA	2	12	1581050	1581061	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018221	ATTGTA	2	12	1591471	1591482	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018221	TTTTAT	2	12	1606736	1606747	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018221	TTTCAT	2	12	1662051	1662062	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018221	GAAAAA	2	12	1681293	1681304	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018221	TATAAA	2	12	1683971	1683982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018221	CTTTCA	2	12	1696498	1696509	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018221	AAATAT	2	12	1713036	1713047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018221	TAAAAT	2	12	1713516	1713527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018221	AACTTA	2	12	1737059	1737070	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018221	TTTTAT	2	12	1745373	1745384	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018221	CGAAAA	2	12	1758782	1758793	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018221	TTGCCT	2	12	1772467	1772478	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018221	AATTTT	2	12	1779264	1779275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018221	ACGTAA	2	12	1861816	1861827	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018221	ACGTAA	2	12	1861873	1861884	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018221	GATAAT	2	12	1907847	1907858	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018221	AAACAA	2	12	1912993	1913004	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018221	TAAATT	2	12	1926697	1926708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018221	AAAAAG	2	12	1937088	1937099	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018221	AAAATA	2	12	1937132	1937143	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018221	TTTTTA	2	12	1941346	1941357	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018221	ATCAAA	2	12	1949796	1949807	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018221	TTTGAT	2	12	1972038	1972049	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018221	AACAAA	2	12	2023279	2023290	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018221	TCTCCT	2	12	2027902	2027913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018221	AACATA	2	12	2062581	2062592	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018221	TAAACT	2	12	2076477	2076488	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018221	TATACT	2	12	2127421	2127432	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018221	TTTTAA	2	12	2147124	2147135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018221	TTATTT	2	12	2200186	2200197	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018221	TATCTA	2	12	2343909	2343920	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018221	CTAACT	2	12	2356807	2356818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018221	TCATTC	2	12	2361587	2361598	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018221	CCCTTC	2	12	2386010	2386021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_018221	AATCAA	2	12	2397491	2397502	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018221	TCTTTT	2	12	2416458	2416469	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018221	TATTTT	2	12	2428170	2428181	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018221	GATAAA	2	12	2430969	2430980	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018221	CAATGA	2	12	2430987	2430998	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018221	CTTTTT	2	12	2491529	2491540	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018221	TTTTGC	2	12	2541044	2541055	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018221	TTACTT	2	12	2541331	2541342	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018221	CTTCCA	2	12	2541403	2541414	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018221	CGCCTA	2	12	2542853	2542864	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018221	CTTTCT	2	12	2573027	2573038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018221	CAAATC	2	12	2600565	2600576	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018221	TTTTTG	2	12	2666139	2666150	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018221	CAAAAT	2	12	2710174	2710185	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_018221	TTCCTT	2	12	2712714	2712725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018221	TTTTTA	2	12	2774293	2774304	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018221	TATTTT	2	12	2782264	2782275	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018221	TTTTTA	2	12	2782311	2782322	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018221	TTTTTC	2	12	2791100	2791111	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_018221	AAGACG	2	12	2816731	2816742	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018221	CAACGT	2	12	2857381	2857392	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018221	TCCTCA	2	12	2858733	2858744	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018221	ATATGA	2	12	2927741	2927752	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018221	CTTCCA	2	12	2928179	2928190	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018221	CGCCTA	2	12	2929629	2929640	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018221	TCAATT	2	12	2978512	2978523	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.