MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus faecalis D32 chromosome

Total Repeats: 407

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018221	ATATA	2	10	1535	1544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018221	ATAAA	2	10	10636	10645	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018221	TTTAA	2	10	13186	13195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018221	TTATT	2	10	13596	13605	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018221	TAAAA	2	10	18816	18825	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018221	TAAAA	2	10	21840	21849	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018221	AAATA	2	10	37095	37104	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018221	GATAA	2	10	44512	44521	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018221	GGAGA	2	10	45546	45555	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018221	ATGCT	2	10	57189	57198	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018221	TCCAT	2	10	63028	63037	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_018221	GTATT	2	10	73345	73354	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018221	ACAAA	2	10	73404	73413	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018221	AAATT	2	10	88089	88098	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018221	AATTT	2	10	88385	88394	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018221	TAAAA	2	10	91453	91462	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018221	GTAAA	2	10	104352	104361	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018221	AGTAT	2	10	117014	117023	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018221	TGGAA	2	10	133700	133709	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018221	AAAAG	2	10	142219	142228	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018221	TTTCT	2	10	149539	149548	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018221	AGTTT	2	10	159493	159502	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018221	TAGAA	2	10	166850	166859	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018221	GATTT	2	10	168401	168410	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018221	TGTCT	2	10	176232	176241	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018221	GAAAA	2	10	191399	191408	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018221	AAACA	2	10	201130	201139	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018221	GTAAA	2	10	201168	201177	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018221	AAGAG	2	10	214315	214324	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018221	ATTCA	2	10	218386	218395	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018221	TCGTG	2	10	219564	219573	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018221	CCGTA	2	10	221904	221913	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_018221	AGGGA	2	10	223005	223014	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018221	AAAAG	2	10	224617	224626	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018221	CTTTT	2	10	224777	224786	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018221	TTGGT	2	10	225203	225212	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018221	TATCA	2	10	240419	240428	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018221	CGTTA	2	10	254250	254259	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018221	ACGTT	3	15	254268	254282	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018221	TAAAT	2	10	260870	260879	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018221	CTTTT	2	10	266487	266496	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018221	GAATC	2	10	269846	269855	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018221	GGAAG	2	10	297377	297386	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018221	TTAGA	2	10	313605	313614	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018221	AGGAA	2	10	313646	313655	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018221	CAAGA	2	10	330659	330668	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018221	TTGTA	2	10	354370	354379	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018221	TAGTT	2	10	355140	355149	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018221	AAGGA	2	10	362248	362257	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018221	CTAAA	2	10	367267	367276	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018221	CTTTT	2	10	399966	399975	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018221	TTTTA	2	10	401835	401844	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018221	CTATT	2	10	415572	415581	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_018221	AATTT	2	10	416691	416700	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018221	TAACT	4	20	416774	416793	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018221	AAAGA	2	10	417439	417448	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018221	ACAAA	2	10	417461	417470	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018221	TTTAT	2	10	417562	417571	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018221	TTATT	2	10	418460	418469	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018221	AGTTT	2	10	420800	420809	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018221	CATTT	3	15	431786	431800	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018221	ATTTA	2	10	434716	434725	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018221	TAAAA	2	10	439498	439507	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018221	TATCA	2	10	449651	449660	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018221	AAAGA	2	10	451731	451740	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018221	TTATT	2	10	453425	453434	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018221	GAAGA	2	10	455214	455223	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018221	TAACA	2	10	462320	462329	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018221	ACGAT	2	10	491603	491612	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_018221	TAAAA	2	10	505816	505825	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018221	ATAGA	2	10	506882	506891	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018221	ATGAT	2	10	509783	509792	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018221	CTTTA	2	10	516735	516744	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018221	GATAT	2	10	525395	525404	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018221	CTTTA	2	10	525449	525458	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018221	TAAAG	2	10	543319	543328	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018221	TTTTA	2	10	563793	563802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018221	AATAG	2	10	576226	576235	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018221	TTTGC	2	10	578293	578302	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018221	ATTTT	2	10	579876	579885	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018221	ATAAA	2	10	590781	590790	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018221	ATAAA	2	10	610844	610853	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018221	CACTA	2	10	614804	614813	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_018221	TAAAA	2	10	627029	627038	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018221	AACAT	2	10	653499	653508	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018221	AAACA	2	10	660530	660539	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018221	GGGAA	2	10	663722	663731	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018221	TTTTA	2	10	664295	664304	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018221	GAAAA	2	10	667965	667974	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018221	TTTTG	2	10	672477	672486	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018221	TTTGG	2	10	674066	674075	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018221	GATAA	2	10	698446	698455	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018221	TCTGC	2	10	701008	701017	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_018221	AATAA	2	10	704735	704744	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018221	TTTTA	2	10	704854	704863	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018221	TAAAC	2	10	711571	711580	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_018221	CTAAA	2	10	714467	714476	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018221	AATAA	2	10	722045	722054	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018221	GAAGA	2	10	752510	752519	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018221	AATGA	2	10	770181	770190	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018221	AAAAT	2	10	775786	775795	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018221	CTTTT	2	10	782338	782347	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018221	TATAA	2	10	782479	782488	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018221	AAATA	2	10	782990	782999	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018221	GGATG	2	10	783033	783042	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018221	GTTTT	2	10	783144	783153	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018221	ATAAA	2	10	800483	800492	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018221	AGTAA	2	10	804638	804647	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018221	AGGAA	2	10	848307	848316	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018221	GTTTT	2	10	852978	852987	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018221	TCTAT	2	10	873044	873053	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018221	ACTTT	2	10	873109	873118	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_018221	GAAAA	2	10	877191	877200	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018221	TTTTA	2	10	880789	880798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018221	TATAT	2	10	889184	889193	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018221	ATTCA	2	10	897716	897725	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018221	TCGTG	2	10	898894	898903	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018221	CCGTA	2	10	901233	901242	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_018221	AGGGA	2	10	902334	902343	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018221	ATATT	2	10	904085	904094	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018221	TATTC	2	10	907383	907392	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_018221	ATTGG	2	10	918440	918449	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018221	ATCAA	2	10	919128	919137	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018221	TAAAA	2	10	919159	919168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018221	ATTGT	2	10	920635	920644	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018221	TTATT	2	10	929343	929352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018221	CTTTA	2	10	936384	936393	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018221	ATAGC	2	10	946382	946391	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018221	AGATT	2	10	946649	946658	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018221	AATAA	2	10	947683	947692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018221	ATAGC	2	10	954522	954531	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_018221	AAATG	2	10	956783	956792	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018221	TAAAC	2	10	968798	968807	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018221	AAATG	2	10	968972	968981	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018221	TAAAT	2	10	975866	975875	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018221	AAAAC	2	10	979688	979697	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_018221	ACATC	2	10	991300	991309	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_018221	TATAT	2	10	995581	995590	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018221	AGAAT	2	10	996260	996269	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018221	CTTTT	2	10	1017728	1017737	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_018221	AGAAA	2	10	1023036	1023045	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018221	TAAAC	2	10	1024590	1024599	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_018221	TGTAT	2	10	1028505	1028514	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018221	CTTTT	2	10	1034745	1034754	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_018221	GTAGA	2	10	1051605	1051614	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018221	AGAAA	2	10	1073153	1073162	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018221	AAAGA	2	10	1075811	1075820	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018221	ATCCT	2	10	1104600	1104609	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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289	NC_018221	TTTTA	2	10	2072556	2072565	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_018221	TAGTG	2	10	2099625	2099634	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.