MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus faecium DO plasmid 2

Total Repeats: 173

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017962	TCC	2	6	1202	1207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017962	TAT	2	6	1221	1226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017962	TAG	2	6	1241	1246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017962	AGG	2	6	1483	1488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017962	AGC	2	6	2243	2248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017962	AAG	2	6	2382	2387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017962	ATT	2	6	3017	3022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017962	CAC	2	6	6336	6341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017962	AAT	2	6	6384	6389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017962	TAA	2	6	6394	6399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017962	AGG	2	6	6402	6407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017962	CAA	2	6	6718	6723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017962	CTT	2	6	9323	9328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017962	AAG	2	6	9377	9382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017962	CCT	2	6	9415	9420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017962	TTA	2	6	9453	9458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017962	GTT	2	6	9511	9516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017962	CTA	2	6	9592	9597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017962	AAT	2	6	9611	9616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017962	AGG	2	6	9630	9635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017962	ATA	2	6	10756	10761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017962	CTC	3	9	10810	10818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017962	TCA	2	6	10821	10826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017962	ATT	2	6	11138	11143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017962	ATA	3	9	11153	11161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017962	AAG	2	6	11198	11203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017962	AAT	2	6	12786	12791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017962	GTT	2	6	12990	12995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017962	GAA	2	6	13011	13016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017962	TAT	2	6	13059	13064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017962	AAG	2	6	13099	13104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017962	TAA	2	6	13111	13116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017962	ATT	2	6	13167	13172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017962	TAA	2	6	13205	13210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017962	ACA	2	6	13240	13245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017962	TAA	2	6	13304	13309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017962	TTG	2	6	13322	13327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017962	TCC	2	6	13937	13942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017962	TAG	2	6	14037	14042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017962	AGC	2	6	14050	14055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017962	AGG	2	6	14161	14166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017962	CTT	2	6	14169	14174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017962	AAT	2	6	16538	16543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017962	AAT	2	6	16572	16577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017962	TGT	2	6	17785	17790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017962	AAT	2	6	17924	17929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017962	TAT	2	6	17975	17980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017962	TTA	2	6	18008	18013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017962	ACA	2	6	18047	18052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017962	TAT	2	6	18160	18165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017962	TAA	2	6	18208	18213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017962	AGA	2	6	20033	20038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017962	ATT	2	6	20059	20064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017962	GAA	2	6	20073	20078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017962	CAA	2	6	20087	20092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017962	AGA	3	9	20117	20125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017962	ACA	2	6	22374	22379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017962	ACT	2	6	22899	22904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017962	CAT	2	6	22950	22955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017962	ATT	2	6	23668	23673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017962	CAA	2	6	23838	23843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017962	GTA	2	6	24036	24041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017962	TGT	2	6	25085	25090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017962	TAA	2	6	25171	25176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017962	CCA	2	6	25210	25215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017962	CAA	2	6	26821	26826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017962	CGG	2	6	26835	26840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017962	TCA	2	6	26877	26882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017962	GCC	2	6	27009	27014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017962	GAT	2	6	27021	27026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017962	TCT	2	6	27034	27039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017962	AGA	2	6	27041	27046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017962	GAT	2	6	29388	29393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017962	AAT	2	6	29494	29499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017962	TTC	2	6	29513	29518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017962	GAT	2	6	29720	29725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017962	CCT	2	6	30848	30853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_017962	ATT	2	6	30855	30860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017962	TAA	2	6	30875	30880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017962	AAT	2	6	30941	30946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017962	TAC	2	6	31024	31029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017962	TAA	2	6	33388	33393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017962	ACT	2	6	33394	33399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017962	ATT	2	6	33400	33405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017962	TAC	2	6	33431	33436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017962	CAA	2	6	36060	36065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017962	ATA	2	6	37863	37868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017962	CAA	2	6	37932	37937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017962	TCC	2	6	39538	39543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017962	TAT	2	6	39557	39562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017962	TAG	2	6	39577	39582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017962	TCC	2	6	40572	40577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017962	TAT	2	6	41636	41641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017962	AAG	2	6	41678	41683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017962	CTC	2	6	43182	43187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017962	CTG	2	6	44817	44822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017962	TTA	2	6	45152	45157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017962	TAT	2	6	45876	45881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017962	ACT	2	6	45938	45943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017962	AAC	2	6	46200	46205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017962	TTG	2	6	46232	46237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017962	CTT	2	6	46339	46344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017962	AGT	2	6	46355	46360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017962	TAA	2	6	46366	46371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017962	CTT	2	6	47391	47396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017962	TCT	2	6	47684	47689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017962	ATC	2	6	47702	47707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017962	AAT	2	6	48033	48038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017962	AGG	2	6	48052	48057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017962	TCT	2	6	50521	50526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017962	GAG	2	6	50531	50536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017962	TGA	2	6	50630	50635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017962	ATA	2	6	50712	50717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017962	ATT	2	6	50735	50740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017962	CCT	2	6	50741	50746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017962	AGG	2	6	50773	50778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017962	ATT	2	6	51668	51673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017962	TTG	2	6	51684	51689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017962	TAA	2	6	51719	51724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017962	GAA	2	6	51730	51735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017962	GTG	2	6	51738	51743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017962	CTA	2	6	52520	52525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017962	AAT	2	6	52539	52544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017962	AGG	2	6	52558	52563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017962	TCA	2	6	53482	53487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017962	AAC	2	6	53514	53519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017962	AGC	2	6	53552	53557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017962	AAG	2	6	53568	53573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017962	ATT	2	6	53626	53631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017962	AAT	2	6	53768	53773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017962	TAA	2	6	53796	53801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017962	CTG	2	6	54998	55003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017962	AGT	2	6	55029	55034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017962	AAT	2	6	55132	55137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017962	TAC	2	6	55195	55200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017962	ATA	2	6	56401	56406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017962	ATT	2	6	56454	56459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017962	ATT	2	6	56495	56500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017962	AAT	2	6	56521	56526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017962	TTA	2	6	56533	56538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017962	AGC	2	6	56579	56584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017962	AAT	2	6	56591	56596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_017962	CCT	2	6	66195	66200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.