MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia blattae DSM 4481 chromosome

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017910	ATGGTA	2	12	46205	46216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017910	TAAATA	2	12	50277	50288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017910	CTGTGC	2	12	50470	50481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017910	AAAATA	2	12	70852	70863	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017910	CATTGT	2	12	70915	70926	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017910	CGTCAG	2	12	101573	101584	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017910	GTTGAG	2	12	137593	137604	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017910	TGCGAA	2	12	208353	208364	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017910	GGTATT	2	12	240376	240387	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017910	TCCGGA	2	12	338987	338998	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017910	GAATAA	2	12	371649	371660	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017910	CCGTAA	2	12	421451	421462	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017910	GGCCCG	2	12	441777	441788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017910	TGTGCA	2	12	456477	456488	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017910	GCCTGG	2	12	494757	494768	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017910	GCTATC	2	12	516877	516888	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017910	ACAACT	2	12	552321	552332	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017910	GCCCCG	2	12	580754	580765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017910	TGAAAC	2	12	596112	596123	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017910	CTATAT	2	12	615282	615293	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017910	CCTGCC	2	12	686670	686681	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017910	TTTTTG	2	12	727315	727326	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017910	TGATAG	2	12	787567	787578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017910	ACCGGC	2	12	796778	796789	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017910	TTTTAA	2	12	797192	797203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017910	TTACTG	2	12	829797	829808	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017910	GTTCAG	2	12	884586	884597	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017910	TGAAAA	2	12	919310	919321	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017910	AAATGT	2	12	924134	924145	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017910	TCTTTT	2	12	948873	948884	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017910	TGATTG	2	12	950865	950876	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017910	TCTTTT	2	12	966300	966311	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017910	AAAAGA	2	12	996412	996423	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017910	CCAGGT	2	12	1048957	1048968	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017910	GTGGCT	2	12	1104750	1104761	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017910	AAATAA	2	12	1146073	1146084	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017910	AAAACA	2	12	1158783	1158794	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017910	CGCTGG	2	12	1158923	1158934	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017910	CTGTTG	2	12	1171740	1171751	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017910	TAACCT	2	12	1179186	1179197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017910	ATGGCA	2	12	1206015	1206026	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017910	GGCTGC	2	12	1213923	1213934	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017910	GCCCCG	2	12	1249254	1249265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017910	TTTATT	2	12	1251672	1251683	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017910	TTTTCT	2	12	1274794	1274805	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017910	ACCAGA	2	12	1277201	1277212	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017910	TTTCTG	2	12	1290749	1290760	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017910	TGCAAT	2	12	1301559	1301570	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017910	AACCTT	2	12	1302808	1302819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017910	GCCATA	2	12	1303639	1303650	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017910	TGGGTT	2	12	1320795	1320806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017910	ATAAAA	2	12	1408508	1408519	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017910	TTTTGT	2	12	1411127	1411138	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017910	AATTAT	2	12	1437912	1437923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017910	GCACCA	2	12	1463358	1463369	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017910	CAGTAG	2	12	1513273	1513284	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017910	CCGGCT	2	12	1585321	1585332	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017910	ATAGCG	2	12	1588189	1588200	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017910	AAAAGC	2	12	1597560	1597571	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017910	CTGACA	2	12	1725356	1725367	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017910	ATTTTT	2	12	1744690	1744701	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017910	ATCATT	2	12	1744819	1744830	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017910	TCTTAA	2	12	1753583	1753594	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017910	AGCTGG	2	12	1754626	1754637	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017910	TTATTT	2	12	1771043	1771054	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017910	TGTTTT	2	12	1771069	1771080	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017910	TATATT	2	12	1781290	1781301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017910	TATATT	2	12	1787186	1787197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017910	TATTTT	2	12	1790764	1790775	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017910	GCTGCA	2	12	1795314	1795325	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017910	GCTTTC	2	12	1841522	1841533	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017910	TTACAT	2	12	1882018	1882029	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017910	CGCCCC	2	12	1887501	1887512	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
74	NC_017910	GGGGCG	2	12	1887522	1887533	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017910	CGGGCG	2	12	1891421	1891432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017910	ATCCTG	2	12	1904293	1904304	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017910	CCAGCG	2	12	1935041	1935052	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017910	CCTGAA	2	12	1954676	1954687	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017910	GGTGAT	2	12	2009165	2009176	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017910	TGATAA	2	12	2051303	2051314	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017910	CAGTTT	2	12	2063937	2063948	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017910	TACGAT	2	12	2074644	2074655	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017910	TACGGG	2	12	2081681	2081692	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017910	CTTTTG	2	12	2106361	2106372	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017910	CAGTAA	2	12	2156011	2156022	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017910	TACTAA	2	12	2176458	2176469	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017910	TTTAAT	2	12	2232791	2232802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017910	TGTTCC	2	12	2377690	2377701	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017910	GAATAT	2	12	2492769	2492780	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017910	GTATTT	2	12	2646259	2646270	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017910	ATATTT	2	12	2646387	2646398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017910	TAAATA	2	12	2653444	2653455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017910	AATAGC	2	12	2676519	2676530	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017910	ATAACG	2	12	2725228	2725239	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017910	TGGGAA	2	12	2736744	2736755	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017910	TTTTGT	2	12	2787263	2787274	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017910	CCGGCC	2	12	2847825	2847836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017910	AAAAAC	2	12	2884082	2884093	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017910	GTAATT	2	12	2951119	2951130	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017910	ACTGTT	2	12	2952211	2952222	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017910	TCTGTA	2	12	2956787	2956798	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017910	GGCGGG	2	12	3007084	3007095	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017910	AACGAT	2	12	3050272	3050283	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017910	TTAAAT	2	12	3087869	3087880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017910	TAATTT	2	12	3092993	3093004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017910	CCGCAA	2	12	3100825	3100836	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017910	GCCCCG	2	12	3125105	3125116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017910	AACAGC	2	12	3160342	3160353	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017910	CGGGCG	2	12	3161416	3161427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017910	TCTTTT	2	12	3242382	3242393	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017910	AGATAA	2	12	3263206	3263217	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017910	CCCCCT	2	12	3324145	3324156	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
113	NC_017910	CGGGCC	2	12	3375024	3375035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017910	TGAAAA	2	12	3375221	3375232	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017910	TGATAA	2	12	3413626	3413637	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017910	GGGTAT	2	12	3426489	3426500	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017910	TCAGGA	2	12	3433922	3433933	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017910	GGTTAA	2	12	3443793	3443804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017910	AATTGA	2	12	3462693	3462704	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017910	TAATTT	2	12	3487885	3487896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017910	GTAAAG	2	12	3488203	3488214	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017910	GACCGC	2	12	3493954	3493965	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017910	ATCATT	2	12	3495956	3495967	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017910	TCTTTT	2	12	3545594	3545605	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017910	TTATCA	2	12	3554781	3554792	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017910	TCTGAT	2	12	3606599	3606610	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017910	TAAAAA	2	12	3606932	3606943	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_017910	TGCAAT	2	12	3669962	3669973	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017910	CTTATT	2	12	3673716	3673727	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017910	AGAAAA	2	12	3679678	3679689	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.