MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p948

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017724	ATCC	2	8	28	35	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017724	TGCA	2	8	167	174	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017724	TAAA	2	8	1016	1023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017724	AATT	2	8	1027	1034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017724	ATAG	2	8	5376	5383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017724	TAAA	2	8	5903	5910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017724	ACGT	2	8	6011	6018	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017724	ATGG	2	8	8065	8072	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017724	GTCT	2	8	8219	8226	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017724	GAAA	2	8	8229	8236	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017724	AATA	2	8	8420	8427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017724	CCTA	2	8	8531	8538	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017724	AATT	2	8	19412	19419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017724	GCGA	2	8	19617	19624	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017724	CTGG	2	8	20169	20176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017724	ATCA	2	8	22535	22542	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017724	CCAG	2	8	23452	23459	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017724	CGGG	2	8	23526	23533	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017724	TCTG	2	8	23668	23675	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017724	GCCA	2	8	25118	25125	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017724	CGGG	2	8	25630	25637	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017724	CCCG	2	8	25711	25718	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_017724	CCAG	2	8	27917	27924	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017724	ATTG	2	8	33146	33153	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017724	TCTG	2	8	33271	33278	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017724	CTGA	2	8	33470	33477	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017724	TCAG	2	8	34371	34378	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017724	GCCA	2	8	35673	35680	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017724	TAAA	2	8	36107	36114	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017724	TCTG	2	8	37575	37582	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017724	ATTC	2	8	37640	37647	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017724	AGTG	2	8	37692	37699	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017724	TTTG	2	8	37749	37756	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017724	TGTT	2	8	42894	42901	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017724	ACTT	2	8	44498	44505	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017724	CATT	2	8	44515	44522	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017724	TGAT	2	8	45091	45098	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017724	TCAG	2	8	45261	45268	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017724	TAAT	2	8	47770	47777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017724	ATTT	2	8	48277	48284	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017724	AAAT	2	8	48493	48500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017724	ACAG	2	8	53154	53161	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017724	CATT	2	8	53352	53359	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017724	GCAG	2	8	53372	53379	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017724	CAAC	2	8	53654	53661	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017724	ATGA	2	8	56259	56266	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017724	CTGC	2	8	56551	56558	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017724	ACGC	2	8	57039	57046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017724	GCCC	2	8	57433	57440	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_017724	AAAC	2	8	58616	58623	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017724	TAAC	2	8	60305	60312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017724	CAGC	2	8	62536	62543	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017724	GCTA	2	8	65013	65020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017724	GATT	2	8	67533	67540	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017724	TGGA	2	8	68761	68768	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017724	TTTG	2	8	68911	68918	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017724	TATC	2	8	69310	69317	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017724	CTTT	2	8	70352	70359	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017724	TAAA	2	8	70447	70454	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017724	GTTT	2	8	74772	74779	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017724	GTTA	2	8	79619	79626	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017724	CTTC	2	8	79730	79737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017724	AATC	2	8	82687	82694	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017724	TGAA	2	8	83130	83137	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017724	CATT	2	8	83259	83266	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017724	ACTA	2	8	83441	83448	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017724	TGGA	2	8	85170	85177	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017724	CGGA	2	8	85712	85719	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017724	GTGC	2	8	87035	87042	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017724	CTGG	2	8	88702	88709	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017724	TCTT	2	8	89223	89230	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017724	AACA	2	8	90208	90215	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017724	TGAT	2	8	90397	90404	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017724	GCAC	2	8	90577	90584	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017724	CGCC	2	8	93936	93943	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_017724	CCGG	2	8	94281	94288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017724	CCTG	2	8	94303	94310	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.