MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p666

Total Repeats: 269

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017722	TGC	2	6	6	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017722	CAG	2	6	75	80	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017722	TAC	2	6	283	288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017722	CGA	2	6	513	518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017722	ATG	2	6	616	621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017722	ACA	2	6	632	637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017722	GCG	3	9	680	688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017722	TGG	2	6	749	754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017722	CGC	2	6	797	802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017722	AGT	2	6	879	884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017722	GGC	2	6	937	942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017722	GTT	2	6	1085	1090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017722	ATT	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017722	GAG	2	6	1170	1175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017722	TTG	2	6	2134	2139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017722	GAA	2	6	2189	2194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017722	CCT	2	6	2606	2611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017722	TAC	2	6	2644	2649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017722	GCA	2	6	4239	4244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017722	TAT	2	6	4646	4651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017722	ATA	2	6	4656	4661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017722	AAT	2	6	4664	4669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017722	TAA	2	6	4720	4725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017722	ACC	2	6	4739	4744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017722	AGA	2	6	4780	4785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017722	TGC	2	6	4791	4796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017722	TAT	2	6	4850	4855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017722	ATA	2	6	4906	4911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017722	ATC	2	6	4915	4920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017722	ACG	2	6	5786	5791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017722	AAT	2	6	5843	5848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017722	TAC	2	6	5876	5881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017722	CTC	2	6	6183	6188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017722	TAT	2	6	6202	6207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017722	AAT	2	6	6215	6220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017722	CCT	2	6	6281	6286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017722	ATC	2	6	6888	6893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017722	GAT	2	6	15284	15289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017722	GGT	2	6	15334	15339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017722	TGA	2	6	15529	15534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017722	TGA	2	6	15591	15596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017722	GAT	2	6	15650	15655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017722	ACA	2	6	15718	15723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017722	ATG	2	6	18460	18465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017722	ATT	2	6	18469	18474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017722	GGA	2	6	18486	18491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017722	GTG	2	6	18669	18674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017722	CCA	2	6	18676	18681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017722	AGT	2	6	18686	18691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017722	TGC	2	6	21047	21052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017722	GAC	2	6	21135	21140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017722	TAA	2	6	21173	21178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017722	CAG	2	6	21206	21211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017722	TCC	2	6	21615	21620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017722	CCG	2	6	21703	21708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017722	TCT	2	6	27253	27258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017722	AAT	2	6	27280	27285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017722	TTA	2	6	27318	27323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017722	CCT	2	6	28027	28032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017722	GTC	2	6	28069	28074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017722	ATA	2	6	28647	28652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017722	AGC	2	6	28672	28677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017722	CGC	2	6	28711	28716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017722	AGC	2	6	28718	28723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017722	ATG	2	6	28738	28743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017722	ACC	2	6	28766	28771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017722	GTT	2	6	28793	28798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017722	TGG	2	6	28923	28928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017722	ACC	2	6	28934	28939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017722	ATT	2	6	28972	28977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017722	CCT	2	6	29660	29665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017722	TGA	2	6	29717	29722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017722	GAC	2	6	29738	29743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017722	GAT	2	6	29759	29764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017722	TAA	2	6	30664	30669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017722	ATC	2	6	30687	30692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017722	ACA	2	6	30719	30724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017722	TCC	2	6	31044	31049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017722	CAT	2	6	31072	31077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017722	CGC	2	6	31169	31174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017722	ACA	2	6	31352	31357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017722	CGC	2	6	31371	31376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017722	ACG	2	6	31378	31383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017722	CGG	2	6	31423	31428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017722	GGC	2	6	31472	31477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017722	AAC	2	6	31614	31619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017722	AAT	2	6	31629	31634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017722	GCA	2	6	31639	31644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017722	AGG	2	6	31662	31667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017722	AAT	2	6	31676	31681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017722	GTT	2	6	31803	31808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017722	CAG	2	6	31854	31859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017722	AGT	2	6	31880	31885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017722	ACC	2	6	32229	32234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017722	CAT	2	6	32272	32277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017722	TGC	2	6	33782	33787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017722	CGG	2	6	33799	33804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017722	GTT	2	6	33814	33819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017722	GGC	2	6	33825	33830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017722	GTG	2	6	33881	33886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017722	TCT	2	6	33962	33967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017722	GAA	2	6	34041	34046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017722	CCA	2	6	34065	34070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017722	CCT	2	6	34199	34204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017722	CGT	2	6	34221	34226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017722	GCA	2	6	34250	34255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017722	AAT	2	6	34337	34342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017722	CAG	2	6	34419	34424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017722	TGC	2	6	34444	34449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017722	TGC	2	6	34455	34460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017722	TCC	2	6	34516	34521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017722	CGT	2	6	34559	34564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017722	CAC	2	6	34595	34600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017722	ACC	2	6	34633	34638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017722	CAG	2	6	34716	34721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017722	CGT	2	6	34751	34756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017722	TTC	3	9	34782	34790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017722	CAG	2	6	34938	34943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017722	GCA	2	6	34945	34950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017722	TCG	3	9	34981	34989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017722	GAC	2	6	35090	35095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017722	GGC	2	6	35139	35144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017722	GTG	2	6	35206	35211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017722	TCT	2	6	35218	35223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017722	CGA	2	6	35383	35388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017722	ATG	2	6	35467	35472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017722	TGC	2	6	35496	35501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017722	ACC	2	6	35511	35516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017722	GCG	2	6	35518	35523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017722	CAG	2	6	35697	35702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017722	CAT	2	6	36701	36706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017722	CGC	2	6	36798	36803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017722	ACA	2	6	36981	36986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017722	CGC	2	6	37000	37005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017722	ACG	2	6	37007	37012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017722	CGG	2	6	37052	37057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017722	GGC	2	6	37101	37106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017722	CGG	2	6	37186	37191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017722	CAG	2	6	37208	37213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017722	GAC	2	6	37235	37240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017722	GCC	2	6	37246	37251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.