MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK1

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017665	CTAT	2	8	1981	1988	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017665	ATAA	2	8	3792	3799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017665	TACA	2	8	4059	4066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017665	AACT	2	8	5624	5631	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017665	ATTT	2	8	13517	13524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017665	AGTT	2	8	14702	14709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017665	GCGG	2	8	14790	14797	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017665	TGGT	2	8	14851	14858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017665	TAAT	2	8	15635	15642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017665	AATG	2	8	15662	15669	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017665	CAAA	2	8	16026	16033	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017665	TTAA	2	8	18980	18987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017665	ACAG	2	8	37800	37807	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017665	GTTT	2	8	37814	37821	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017665	AAAT	2	8	37844	37851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017665	CTGG	2	8	37908	37915	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017665	TGCC	2	8	51204	51211	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017665	ACTG	2	8	51654	51661	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017665	GTTA	2	8	52047	52054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017665	TAAG	2	8	52065	52072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017665	TCCG	2	8	52388	52395	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017665	TTTA	2	8	52529	52536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017665	GTTG	2	8	53006	53013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017665	GGCC	2	8	54197	54204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017665	TTTC	2	8	54245	54252	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017665	GGAT	2	8	54304	54311	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017665	TGCC	2	8	55758	55765	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017665	CAAA	2	8	58013	58020	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017665	ACCC	2	8	58296	58303	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_017665	CCCG	2	8	58329	58336	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_017665	ATCA	2	8	58577	58584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017665	CTGA	2	8	59792	59799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017665	GGCT	2	8	61304	61311	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017665	ATAA	2	8	61510	61517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017665	ATTC	2	8	61523	61530	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017665	TACT	2	8	61608	61615	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017665	GCAG	2	8	63682	63689	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017665	TGCT	2	8	63879	63886	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017665	TGAT	2	8	64071	64078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017665	ATGG	2	8	64086	64093	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017665	TCCG	2	8	65352	65359	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017665	TAGA	2	8	65868	65875	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017665	CTTT	2	8	66355	66362	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017665	TTCC	2	8	76719	76726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017665	GCAA	2	8	79056	79063	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017665	TCGT	2	8	79091	79098	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017665	TGTC	2	8	81016	81023	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017665	ATCC	2	8	81256	81263	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017665	CCGG	2	8	81525	81532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017665	ATAC	2	8	83455	83462	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017665	AACA	2	8	86003	86010	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017665	TGTT	2	8	86705	86712	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017665	CGGG	2	8	91428	91435	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017665	ACGG	2	8	94813	94820	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017665	TCAG	2	8	96218	96225	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017665	GCCT	2	8	101898	101905	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.