MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli W chromosome

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017664	GAAAAT	2	12	11891	11902	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017664	AAGGGA	2	12	86006	86017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017664	GTAGTG	2	12	200897	200908	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017664	GTTTTT	2	12	329337	329348	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017664	AGGGAG	2	12	332117	332128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017664	AGGGAG	2	12	339320	339331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017664	GGGAGA	2	12	339385	339396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017664	GTGCAG	2	12	365392	365403	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017664	TAAGGG	2	12	379738	379749	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017664	TGTGGA	2	12	380885	380896	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017664	TTTTCT	2	12	391271	391282	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017664	CTATTT	2	12	392307	392318	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017664	TTTATT	2	12	423954	423965	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017664	TATTGA	2	12	462277	462288	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017664	AACAAT	2	12	483359	483370	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017664	TATTGA	2	12	486205	486216	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017664	TTTTCA	2	12	550726	550737	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017664	CAGGCG	2	12	569568	569579	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017664	TGCAAA	2	12	683532	683543	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017664	ATTTTT	2	12	779620	779631	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017664	TTTACC	2	12	790531	790542	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017664	TTTTCT	2	12	862929	862940	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017664	AATATT	2	12	888738	888749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017664	CAGAAG	2	12	966795	966806	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017664	TAACCG	2	12	1028544	1028555	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017664	AAATAA	2	12	1060347	1060358	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017664	AAAGAT	2	12	1092877	1092888	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017664	TGTCCA	2	12	1113676	1113687	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017664	TAAGGA	2	12	1135943	1135954	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017664	ATAATG	2	12	1137357	1137368	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017664	CAAAAA	2	12	1225976	1225987	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017664	TTTTGT	2	12	1309165	1309176	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017664	ACGCTT	2	12	1329801	1329812	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017664	ACTCGA	2	12	1329821	1329832	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017664	CAGGCT	2	12	1329953	1329964	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017664	CTTATT	2	12	1381661	1381672	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017664	CAAAAG	2	12	1387557	1387568	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017664	GGGGGT	2	12	1395777	1395788	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017664	CTGATC	2	12	1398035	1398046	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017664	AAAGTT	2	12	1402289	1402300	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017664	CTATAA	2	12	1442268	1442279	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017664	AAGTGA	2	12	1514864	1514875	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017664	TTTTAT	2	12	1637012	1637023	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017664	AAAAAC	2	12	1661254	1661265	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017664	ATTAAT	2	12	1661943	1661954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017664	ACCGTT	2	12	1676127	1676138	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017664	TGGTTA	2	12	1684957	1684968	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017664	CAAAAA	2	12	1744638	1744649	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017664	TAAATA	2	12	1746438	1746449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017664	TTTTTC	2	12	1748160	1748171	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017664	AAAAAC	2	12	1781594	1781605	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017664	ATACTT	2	12	1884071	1884082	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017664	AAAATA	2	12	1897728	1897739	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017664	TGTTTT	2	12	1898361	1898372	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017664	AAGACT	2	12	1898621	1898632	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017664	GAACAG	2	12	1946398	1946409	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017664	TATTAC	2	12	2014649	2014660	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017664	TTTCTT	2	12	2034638	2034649	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017664	ATAACC	2	12	2038582	2038593	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017664	ACTGTC	2	12	2082238	2082249	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017664	TTAATG	2	12	2124734	2124745	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017664	AATTCA	2	12	2131859	2131870	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017664	TCTTAT	2	12	2145675	2145686	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017664	ATATTT	2	12	2181919	2181930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017664	CCTGAC	2	12	2194220	2194231	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017664	ACGCTG	2	12	2194739	2194750	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017664	ACAGAC	2	12	2198755	2198766	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017664	ATTTTT	2	12	2205965	2205976	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017664	TCCCCC	2	12	2288295	2288306	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
70	NC_017664	CCTTAC	2	12	2369637	2369648	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017664	CCTTAC	2	12	2370245	2370256	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017664	ACGCAG	2	12	2400141	2400152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017664	TCTTCC	2	12	2429803	2429814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017664	CCACTA	2	12	2506332	2506343	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017664	TTACCC	2	12	2537259	2537270	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017664	TAAATG	2	12	2555125	2555136	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017664	TGTCAC	2	12	2568759	2568770	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017664	AGAAAA	2	12	2579039	2579050	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017664	GTTAAC	2	12	2657225	2657236	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017664	GTTAAC	2	12	2657289	2657300	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017664	AAATAT	2	12	2659982	2659993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017664	CTGATG	2	12	2676038	2676049	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017664	GTTATG	2	12	2693879	2693890	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017664	CAAGTG	2	12	2706998	2707009	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017664	TCCTTC	2	12	2807586	2807597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017664	TGGACA	2	12	2857215	2857226	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017664	CAGTTT	2	12	2871820	2871831	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017664	CGGTTT	2	12	3053700	3053711	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017664	GGTTTT	2	12	3067844	3067855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017664	ACAAGA	2	12	3072175	3072186	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017664	ATATTT	2	12	3122836	3122847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017664	AATCAT	2	12	3174043	3174054	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017664	AATTTT	2	12	3181755	3181766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017664	ATCGCG	2	12	3234602	3234613	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017664	GTAAGG	2	12	3250176	3250187	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017664	GTAAGG	2	12	3250568	3250579	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017664	ACTGAG	2	12	3278691	3278702	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017664	TTTTCG	2	12	3333784	3333795	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017664	ATTTAA	2	12	3346984	3346995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017664	TTATAT	2	12	3396041	3396052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017664	CACCCC	2	12	3412535	3412546	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
102	NC_017664	AGTTGT	2	12	3420324	3420335	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017664	CTTTTT	2	12	3425000	3425011	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017664	AATGAT	2	12	3425835	3425846	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017664	TCTCCC	2	12	3448446	3448457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017664	GTAACC	2	12	3480350	3480361	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017664	AGACAA	2	12	3481970	3481981	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017664	TGCATT	2	12	3491221	3491232	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017664	TTTTAT	2	12	3493118	3493129	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017664	ATATAA	2	12	3503884	3503895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017664	CTTTCT	2	12	3527894	3527905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017664	AGCGTT	2	12	3627812	3627823	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017664	CCCTAT	2	12	3738503	3738514	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017664	AATTTA	2	12	3741296	3741307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017664	GAAATA	2	12	3845921	3845932	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017664	AGATGC	2	12	3846810	3846821	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017664	TGAAAA	2	12	3861682	3861693	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017664	AGGGAG	2	12	3868425	3868436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017664	TTTGCC	2	12	3899355	3899366	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017664	ACTTCA	2	12	3909595	3909606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017664	TTTATC	2	12	3976112	3976123	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017664	AATCAA	2	12	4045512	4045523	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017664	CGGTCA	2	12	4051845	4051856	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017664	CTTTTT	2	12	4162251	4162262	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017664	AGGGAG	2	12	4180396	4180407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017664	GCGTAA	2	12	4281045	4281056	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017664	GGGAGT	2	12	4308084	4308095	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017664	GGGTGA	2	12	4316627	4316638	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017664	ATAAAA	2	12	4323524	4323535	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017664	CATTCA	2	12	4338352	4338363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017664	AACTAA	2	12	4354057	4354068	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017664	TCATTT	2	12	4482827	4482838	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_017664	CTTTTA	2	12	4497906	4497917	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.