MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli P12b chromosome

Total Repeats: 241

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017663	GAAAAT	2	12	10613	10624	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017663	GCGCAA	2	12	21538	21549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017663	AAGGGA	2	12	82858	82869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017663	CAGTTT	2	12	134091	134102	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017663	TAAAGG	2	12	138557	138568	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017663	TCTCCC	2	12	158499	158510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017663	TCACCC	2	12	158550	158561	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017663	TTCTGG	2	12	170293	170304	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017663	TGGCGC	2	12	181138	181149	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017663	GTAGTG	2	12	194336	194347	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017663	GATAGG	2	12	234742	234753	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017663	AGGGAG	2	12	263064	263075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017663	CGCTGG	2	12	264558	264569	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017663	GGAAAA	2	12	282093	282104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017663	CGCTTG	2	12	298888	298899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017663	TTTTCT	2	12	343919	343930	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017663	CTATTT	2	12	344955	344966	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017663	CGCTGG	2	12	354072	354083	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017663	GTTGCG	2	12	354958	354969	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017663	TGCGGA	2	12	359752	359763	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017663	TAAATT	2	12	367854	367865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017663	TTTATT	2	12	367963	367974	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017663	GCGTTA	2	12	370327	370338	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017663	GTTTGT	2	12	410150	410161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017663	TACGGT	2	12	413432	413443	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017663	AACAAT	2	12	427498	427509	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017663	TATTGA	2	12	430344	430355	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017663	TTTTCA	2	12	492610	492621	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017663	CAGGCG	2	12	511454	511465	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017663	CCCACG	2	12	590015	590026	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017663	CAGCAA	2	12	590284	590295	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017663	ACCGTC	2	12	590659	590670	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017663	TGCAAA	2	12	610777	610788	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017663	CTGGAT	2	12	616651	616662	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017663	GAAAAA	2	12	617029	617040	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017663	GCTGGC	2	12	656613	656624	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017663	TGAGCA	2	12	677113	677124	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017663	ATTTTT	2	12	705972	705983	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017663	CTGGAA	2	12	740075	740086	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017663	CTTCGC	2	12	768622	768633	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017663	GCAGAA	2	12	773382	773393	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017663	GCGGCA	2	12	773694	773705	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017663	TTTTCT	2	12	791381	791392	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017663	TCTGCT	2	12	808742	808753	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017663	TAGTGA	2	12	810738	810749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017663	CAGGAG	2	12	813385	813396	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017663	AATAAA	2	12	815317	815328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017663	CTGTCA	2	12	818475	818486	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017663	TGTAAC	2	12	825533	825544	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017663	AATATT	2	12	840858	840869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017663	TCCTCG	2	12	851425	851436	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017663	AAACGC	2	12	851658	851669	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017663	ACCGGA	2	12	866448	866459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017663	AACCAC	2	12	905209	905220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017663	TAACCG	2	12	942980	942991	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017663	AAATAA	2	12	974707	974718	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017663	CTGGAA	2	12	984271	984282	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017663	TGGCGG	2	12	999898	999909	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017663	CCGTAT	2	12	1000181	1000192	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017663	AACGTG	2	12	1000248	1000259	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017663	AAAGAT	2	12	1007240	1007251	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017663	TGTCCA	2	12	1027873	1027884	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017663	TAAGGA	2	12	1050140	1050151	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017663	ATAATG	2	12	1051554	1051565	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017663	GTTCTG	2	12	1117948	1117959	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017663	GTTTTA	2	12	1157080	1157091	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017663	TTCGCT	2	12	1177327	1177338	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017663	CATCGA	2	12	1177365	1177376	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017663	TCAAAC	2	12	1194323	1194334	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017663	AAGCAA	4	24	1210792	1210815	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017663	CAGAGC	4	24	1218399	1218422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017663	ATACAC	2	12	1229067	1229078	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017663	ATAAGA	2	12	1241926	1241937	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017663	TCACGA	2	12	1270535	1270546	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017663	TGCTAA	2	12	1271987	1271998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017663	TCAGAA	2	12	1283228	1283239	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017663	TGAATT	2	12	1284815	1284826	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017663	GCATTG	2	12	1289244	1289255	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017663	GACAGT	2	12	1334361	1334372	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017663	AAACGA	2	12	1361406	1361417	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017663	ACGTTG	2	12	1364345	1364356	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017663	TATAAA	2	12	1378842	1378853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017663	AAAGAA	2	12	1382739	1382750	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017663	GTAATA	2	12	1402954	1402965	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017663	CAAACT	2	12	1408409	1408420	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017663	CTTTTT	2	12	1513057	1513068	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017663	AAAACA	2	12	1522239	1522250	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017663	TTATTT	2	12	1522871	1522882	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017663	TGGGAA	2	12	1526968	1526979	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017663	ATAGAA	2	12	1530731	1530742	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017663	TGCTAA	2	12	1534453	1534464	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017663	TAAGTA	2	12	1536808	1536819	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017663	CGCCAG	2	12	1544828	1544839	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017663	ATGGTA	2	12	1618703	1618714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017663	AGCAGA	2	12	1643257	1643268	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017663	GACAGA	2	12	1646107	1646118	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017663	ATATTT	2	12	1653213	1653224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017663	GATGCT	2	12	1713874	1713885	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017663	GAAAAG	2	12	1714977	1714988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017663	GTCAGG	2	12	1734176	1734187	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017663	GATCAT	2	12	1747183	1747194	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017663	CATAAC	2	12	1758875	1758886	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017663	TAACGG	2	12	1767706	1767717	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017663	TATGAA	2	12	1770980	1770991	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017663	GTTTTT	2	12	1782571	1782582	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017663	GGCAGA	2	12	1785888	1785899	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017663	TATTAA	2	12	1815666	1815677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017663	AATCTC	2	12	1850156	1850167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017663	CGGCAT	2	12	1851065	1851076	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017663	CGCGCA	2	12	1857967	1857978	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017663	CCCAGC	2	12	1858407	1858418	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017663	CACCAT	2	12	1871900	1871911	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017663	ATTGAT	2	12	1873998	1874009	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017663	GTGCCG	2	12	1875769	1875780	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017663	GGTGCC	2	12	1876060	1876071	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017663	AGTTAT	2	12	1960864	1960875	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017663	CTGTTT	2	12	1971988	1971999	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017663	GATCAG	2	12	2007134	2007145	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017663	TGCCTT	2	12	2034286	2034297	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017663	ACCCCC	2	12	2052186	2052197	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
121	NC_017663	CTTTTG	2	12	2060406	2060417	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017663	CGCAGC	2	12	2080347	2080358	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017663	TGACGC	2	12	2081242	2081253	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017663	GGGTAT	2	12	2082014	2082025	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017663	AGCCTG	2	12	2118917	2118928	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017663	TCGAGT	2	12	2119049	2119060	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017663	AAGCGT	2	12	2119069	2119080	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017663	ACAATC	2	12	2172301	2172312	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017663	AAATAA	2	12	2219275	2219286	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017663	TGCCCC	2	12	2224755	2224766	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017663	TTTTGT	2	12	2314367	2314378	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_017663	CTGGTA	2	12	2509112	2509123	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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155	NC_017663	TGGACA	2	12	2902791	2902802	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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241	NC_017663	AGTAAA	2	12	4924412	4924423	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.