MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli KO11FL chromosome

Total Repeats: 518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017660	TTAAT	2	10	23589	23598	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017660	ATTTA	2	10	32421	32430	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017660	TAGTG	2	10	77289	77298	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017660	ATTTT	2	10	79005	79014	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017660	GGCAT	2	10	143304	143313	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017660	GTAAG	2	10	144068	144077	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017660	TCCTC	2	10	145788	145797	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_017660	ACCGC	2	10	150986	150995	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_017660	GCGGT	2	10	151005	151014	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017660	AAATT	2	10	158412	158421	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017660	TTATC	2	10	168774	168783	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017660	TACGT	2	10	183650	183659	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017660	TGGCC	2	10	185375	185384	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017660	AAATA	2	10	193265	193274	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017660	GTCTG	2	10	193350	193359	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017660	TGCGC	2	10	216534	216543	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017660	CGGTT	2	10	223994	224003	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017660	AAAAT	2	10	260407	260416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017660	CTAAT	2	10	260623	260632	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017660	TTTGT	2	10	260650	260659	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017660	ACTGT	2	10	261678	261687	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017660	GATGC	2	10	275215	275224	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017660	AATTA	2	10	285637	285646	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017660	GAAGA	2	10	335244	335253	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017660	AAGCG	2	10	338545	338554	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017660	TGGTC	2	10	351657	351666	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017660	GATAA	2	10	356940	356949	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017660	CATTA	2	10	366903	366912	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017660	GCTTT	2	10	373780	373789	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017660	TATGA	2	10	374675	374684	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017660	TTTGC	2	10	376123	376132	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017660	TTATT	2	10	384653	384662	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017660	TTCAA	2	10	398743	398752	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017660	TTTCG	2	10	413566	413575	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017660	TGATT	2	10	413705	413714	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017660	GTTAT	2	10	451355	451364	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017660	ATCAA	2	10	451451	451460	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017660	CAACA	2	10	452899	452908	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017660	TGTGT	2	10	459055	459064	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017660	AAATA	2	10	462339	462348	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017660	CTTTT	2	10	465072	465081	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017660	TAAAA	2	10	477302	477311	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017660	TCGGT	2	10	504256	504265	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017660	TAAGG	2	10	505344	505353	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017660	AACCG	2	10	507128	507137	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017660	ATCGC	2	10	518838	518847	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_017660	TCACT	2	10	534143	534152	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_017660	TCGGT	2	10	544716	544725	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017660	TAAGG	2	10	545890	545899	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017660	CGCTT	2	10	547583	547592	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017660	CAAAG	2	10	553188	553197	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017660	GATGC	2	10	560469	560478	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017660	AAAGC	2	10	560665	560674	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017660	TTACA	2	10	571461	571470	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017660	AAAGC	2	10	608955	608964	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017660	AAGCG	2	10	611978	611987	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017660	AAAAT	2	10	613039	613048	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017660	TCAGG	2	10	613131	613140	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017660	ACATT	2	10	645699	645708	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017660	TGCGC	2	10	672909	672918	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017660	AAGCA	2	10	680949	680958	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017660	CAGCT	2	10	685189	685198	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017660	CTTAA	2	10	691693	691702	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017660	TTAAG	2	10	692336	692345	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017660	AAGTG	2	10	699183	699192	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017660	CTATT	2	10	702695	702704	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017660	AATAC	2	10	702964	702973	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017660	CAGGT	2	10	733693	733702	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017660	GCTTC	2	10	754451	754460	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_017660	GATTC	2	10	754568	754577	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017660	ATGTT	2	10	759438	759447	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017660	CTTAA	2	10	759674	759683	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017660	TTAAT	2	10	774270	774279	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017660	ATATA	2	10	784244	784253	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017660	AAAAT	2	10	784357	784366	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017660	AAGCG	2	10	811343	811352	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017660	TGTTT	2	10	817699	817708	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017660	AGTTG	2	10	819763	819772	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017660	CGAAC	2	10	827624	827633	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017660	GCATC	2	10	832418	832427	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_017660	CATAT	2	10	884173	884182	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017660	TTCTC	2	10	888323	888332	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_017660	AAGCG	2	10	906312	906321	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017660	TTAAG	2	10	915292	915301	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017660	CTGAA	2	10	921974	921983	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017660	CTTAA	2	10	937009	937018	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017660	CATTG	2	10	937739	937748	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017660	AACGG	2	10	968295	968304	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017660	TATCA	2	10	984993	985002	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017660	TTGTG	2	10	1000350	1000359	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017660	CTAAA	2	10	1007342	1007351	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017660	TGACG	2	10	1011683	1011692	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017660	TTTTG	2	10	1011776	1011785	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017660	ATTTT	2	10	1053315	1053324	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017660	GATTC	2	10	1064897	1064906	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017660	AGCGA	2	10	1081430	1081439	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017660	TCGAC	2	10	1081590	1081599	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_017660	GAAAA	2	10	1098320	1098329	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017660	GATGC	2	10	1116508	1116517	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017660	TAAAA	2	10	1134114	1134123	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017660	ACAGG	2	10	1136350	1136359	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017660	TTAAG	2	10	1137444	1137453	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017660	GAAAT	2	10	1141447	1141456	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017660	CATGC	2	10	1141832	1141841	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017660	CCTTA	2	10	1152635	1152644	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_017660	CGCGG	2	10	1154854	1154863	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
107	NC_017660	GCATA	2	10	1157699	1157708	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017660	TCTTT	2	10	1167531	1167540	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017660	CGTAT	2	10	1173613	1173622	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017660	CAATG	2	10	1177455	1177464	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017660	TTAAG	2	10	1182208	1182217	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017660	CAACA	2	10	1189715	1189724	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_017660	TGCGC	2	10	1194651	1194660	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_017660	CATGT	2	10	1194911	1194920	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017660	AAGCG	2	10	1196355	1196364	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017660	CTTAA	2	10	1227281	1227290	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017660	TCACT	2	10	1237961	1237970	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_017660	GATGC	2	10	1243070	1243079	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017660	ATTTG	2	10	1265431	1265440	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017660	GATGC	2	10	1286752	1286761	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017660	GCCGG	2	10	1289261	1289270	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017660	TTTCT	2	10	1297571	1297580	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017660	AAAAT	2	10	1299019	1299028	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017660	TAATG	2	10	1310323	1310332	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017660	AAACT	2	10	1317436	1317445	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017660	TTGAA	2	10	1321443	1321452	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017660	ATCAA	2	10	1353215	1353224	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017660	AAAGC	2	10	1373053	1373062	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017660	TTTTC	2	10	1375347	1375356	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017660	CAAAA	2	10	1398692	1398701	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017660	AGGTG	2	10	1401628	1401637	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017660	GCGTT	2	10	1476860	1476869	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017660	TTTCA	2	10	1487409	1487418	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017660	AGAAA	2	10	1487451	1487460	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017660	TCTGA	2	10	1492815	1492824	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017660	GGAGG	2	10	1501090	1501099	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017660	TTCAT	2	10	1504507	1504516	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017660	AGGAT	2	10	1506601	1506610	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017660	GATGC	2	10	1516313	1516322	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017660	GATGC	2	10	1516391	1516400	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017660	GTGCG	2	10	1520476	1520485	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017660	TTAAG	2	10	1520644	1520653	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017660	GATGC	2	10	1561791	1561800	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017660	TAAAG	2	10	1584027	1584036	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017660	TAAAG	2	10	1584403	1584412	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017660	ATATT	2	10	1592603	1592612	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017660	GGGCG	2	10	1593234	1593243	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017660	ATTTT	2	10	1608184	1608193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017660	TGCTT	2	10	1627931	1627940	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_017660	TTCAT	2	10	1639140	1639149	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_017660	GATCG	2	10	1640867	1640876	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_017660	ATTTA	2	10	1652507	1652516	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017660	CAAGG	2	10	1654739	1654748	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
154	NC_017660	CTCGT	2	10	1680521	1680530	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
155	NC_017660	GTGTT	2	10	1686440	1686449	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017660	GATGC	2	10	1708869	1708878	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
157	NC_017660	GCATC	2	10	1708970	1708979	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
158	NC_017660	TATTT	2	10	1712357	1712366	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017660	AAAAT	2	10	1712388	1712397	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017660	GGGGC	2	10	1720957	1720966	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
161	NC_017660	CAGGG	2	10	1723423	1723432	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
162	NC_017660	TGTGA	2	10	1734153	1734162	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017660	GAGAA	2	10	1763935	1763944	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017660	ATCCT	2	10	1787454	1787463	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
165	NC_017660	GCAAT	2	10	1796111	1796120	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
166	NC_017660	CTTAA	2	10	1800892	1800901	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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168	NC_017660	CTTAA	2	10	1818986	1818995	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
169	NC_017660	AGGGA	2	10	1831703	1831712	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017660	GATAT	2	10	1861739	1861748	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017660	CTTAC	2	10	1861905	1861914	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
172	NC_017660	AGAAT	2	10	1861991	1862000	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017660	TAATC	2	10	1862051	1862060	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
174	NC_017660	TATGA	2	10	1862126	1862135	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
175	NC_017660	CTTTT	2	10	1867116	1867125	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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177	NC_017660	CATCA	2	10	1902733	1902742	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
178	NC_017660	AAATG	2	10	1912368	1912377	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
179	NC_017660	GGGGA	2	10	1912430	1912439	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
180	NC_017660	TAAAC	2	10	1914788	1914797	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
181	NC_017660	AATCA	2	10	1922478	1922487	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
182	NC_017660	GGAAT	2	10	1923959	1923968	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017660	AACAC	2	10	1947723	1947732	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
184	NC_017660	ACCTT	2	10	1948386	1948395	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
185	NC_017660	AGGCA	2	10	1952021	1952030	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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189	NC_017660	CTAAT	2	10	2020449	2020458	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_017660	CTTAT	2	10	2024306	2024315	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
192	NC_017660	AGTAA	2	10	2028115	2028124	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_017660	AGGTA	2	10	2048542	2048551	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
195	NC_017660	CTAAA	2	10	2051399	2051408	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
196	NC_017660	TAAAC	2	10	2059874	2059883	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
197	NC_017660	CTTTT	2	10	2060982	2060991	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
198	NC_017660	TGATT	2	10	2070156	2070165	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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201	NC_017660	TTTTC	2	10	2089489	2089498	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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257	NC_017660	CGTTG	2	10	2717864	2717873	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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274	NC_017660	CTCTT	2	10	2900462	2900471	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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279	NC_017660	GGGGA	2	10	2939414	2939423	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
280	NC_017660	CGACC	2	10	2949730	2949739	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
281	NC_017660	CAAAA	2	10	2949999	2950008	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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283	NC_017660	ATGTG	2	10	2969034	2969043	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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