MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C plasmid pO83_CORR

Total Repeats: 363

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017659	AGC	2	6	13	18	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017659	CAA	2	6	57	62	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017659	TGG	2	6	149	154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017659	GGA	2	6	173	178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017659	CGA	2	6	218	223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017659	CCA	2	6	360	365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017659	GAT	2	6	403	408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017659	CGA	2	6	572	577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017659	ATC	2	6	684	689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017659	GCC	2	6	741	746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017659	GTT	2	6	869	874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017659	ACG	2	6	942	947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017659	TGG	2	6	990	995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017659	GCC	2	6	1019	1024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017659	TGA	2	6	1083	1088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017659	TCG	2	6	1364	1369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017659	ATG	2	6	1485	1490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017659	ATT	2	6	1556	1561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017659	CAG	2	6	1579	1584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017659	GCT	2	6	1625	1630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017659	AGC	2	6	1755	1760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017659	TTA	2	6	1811	1816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017659	ATT	2	6	1856	1861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017659	TGT	2	6	1882	1887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017659	GAT	2	6	1970	1975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017659	GTT	2	6	2015	2020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017659	GCA	2	6	2209	2214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017659	CTG	3	9	2248	2256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017659	GCG	2	6	7265	7270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017659	ATT	2	6	7292	7297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017659	AAT	2	6	8633	8638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017659	TAA	2	6	11834	11839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017659	ATT	2	6	11901	11906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017659	ATC	2	6	12040	12045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017659	GCT	2	6	12114	12119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017659	TGT	2	6	14546	14551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017659	GGA	2	6	14554	14559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017659	CAA	2	6	14602	14607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017659	ATT	2	6	14700	14705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017659	ATT	2	6	14791	14796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017659	AAC	2	6	14808	14813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017659	TTC	2	6	14881	14886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017659	CCA	2	6	14947	14952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017659	AGA	2	6	14953	14958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017659	ATA	2	6	15007	15012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017659	ATT	2	6	16303	16308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017659	ATA	2	6	16335	16340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017659	GCT	2	6	16460	16465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017659	GTT	2	6	16532	16537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017659	GAT	2	6	16583	16588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017659	TGA	2	6	16597	16602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017659	AAT	2	6	16623	16628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017659	TGA	2	6	16752	16757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017659	ATA	2	6	16767	16772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017659	CTG	2	6	16788	16793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017659	CAA	2	6	16872	16877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017659	TTG	2	6	16958	16963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017659	ATG	2	6	17001	17006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017659	TTA	2	6	17030	17035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017659	AGT	2	6	17040	17045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017659	ATT	2	6	17065	17070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017659	AAT	2	6	17101	17106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017659	ATA	2	6	17127	17132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017659	TAT	2	6	17385	17390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017659	TTA	2	6	17392	17397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017659	ATA	2	6	18735	18740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017659	TCT	2	6	18766	18771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017659	TTG	2	6	20303	20308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017659	ATC	2	6	20732	20737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017659	ATA	2	6	20802	20807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017659	AAT	2	6	20909	20914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017659	GCG	2	6	20939	20944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017659	ACA	2	6	20967	20972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017659	AGC	2	6	20985	20990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017659	TGT	2	6	21007	21012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017659	AGG	2	6	21019	21024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017659	AAG	2	6	21085	21090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017659	TTG	2	6	21100	21105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017659	TAA	3	9	21171	21179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017659	AAC	2	6	25772	25777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017659	CGG	2	6	26853	26858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017659	ATA	2	6	29089	29094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017659	TCA	2	6	29255	29260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017659	TGA	2	6	29262	29267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017659	ATT	2	6	29321	29326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017659	CAT	2	6	30234	30239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017659	TGG	2	6	30244	30249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017659	CCA	2	6	30271	30276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017659	ATA	2	6	32076	32081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017659	TGT	2	6	32138	32143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017659	TAT	3	9	32187	32195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017659	CAG	2	6	32853	32858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017659	AAT	2	6	32870	32875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017659	GCT	2	6	32924	32929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017659	TTC	2	6	32986	32991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017659	AGG	2	6	33028	33033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017659	TAT	2	6	34286	34291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017659	AAT	2	6	34297	34302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017659	TAT	2	6	34334	34339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017659	ATC	2	6	34346	34351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017659	TGG	2	6	39213	39218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017659	GAC	2	6	42264	42269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017659	TAT	2	6	42273	42278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017659	TGA	2	6	42304	42309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017659	ATT	2	6	42634	42639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017659	CGA	2	6	42773	42778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017659	TTA	2	6	42819	42824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017659	TGC	2	6	43772	43777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017659	ATG	2	6	43797	43802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017659	ATT	2	6	44543	44548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017659	CGG	2	6	45134	45139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017659	CTG	2	6	45159	45164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017659	GAT	2	6	45960	45965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017659	CAC	2	6	45974	45979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017659	ATT	2	6	47026	47031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017659	ATT	2	6	47154	47159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017659	CTG	2	6	48404	48409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017659	CCG	2	6	48450	48455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017659	TCA	2	6	48475	48480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017659	CTG	2	6	48542	48547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017659	CAT	2	6	48577	48582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017659	GCC	3	9	48624	48632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017659	GAA	2	6	48671	48676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017659	CGC	2	6	48724	48729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_017659	ATG	2	6	48782	48787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017659	CAG	3	9	48800	48808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017659	GAC	3	9	48902	48910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017659	TTC	2	6	48920	48925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017659	GGT	2	6	48975	48980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017659	GGC	2	6	48984	48989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017659	CGG	2	6	48994	48999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017659	CCG	2	6	49011	49016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017659	ATT	4	12	50188	50199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017659	TCA	2	6	51062	51067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017659	AGC	2	6	53865	53870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017659	AGC	2	6	53909	53914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017659	GCA	2	6	53926	53931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017659	GAA	2	6	53966	53971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017659	GCA	2	6	54454	54459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017659	CGC	2	6	55356	55361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_017659	TAT	2	6	55444	55449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_017659	CTG	2	6	127235	127240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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303	NC_017659	TAA	2	6	136127	136132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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308	NC_017659	AAT	2	6	136303	136308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_017659	AAT	2	6	136797	136802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.