MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_2

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017657	CG	3	6	1143	1148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017657	AG	4	8	1820	1827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017657	TA	4	8	3234	3241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017657	TG	4	8	4746	4753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017657	CT	3	6	5481	5486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017657	GT	3	6	5612	5617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017657	TA	3	6	6792	6797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017657	TG	3	6	12422	12427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017657	AT	3	6	12493	12498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017657	TC	3	6	13300	13305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017657	AT	3	6	14285	14290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017657	AT	3	6	14604	14609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017657	GT	3	6	14669	14674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017657	CA	3	6	31040	31045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017657	TA	3	6	31500	31505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017657	TA	3	6	31511	31516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017657	AT	3	6	32145	32150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017657	AT	3	6	32664	32669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017657	AT	3	6	34570	34575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017657	TC	3	6	34576	34581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017657	GC	3	6	39480	39485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017657	AT	3	6	40480	40485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017657	GA	3	6	43619	43624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017657	AG	3	6	48389	48394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017657	AT	3	6	50948	50953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017657	CT	3	6	53177	53182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017657	AT	3	6	53674	53679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017657	AT	3	6	53778	53783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017657	TC	3	6	53801	53806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017657	GA	3	6	54090	54095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017657	TA	3	6	54121	54126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017657	AT	3	6	54261	54266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017657	AT	3	6	54747	54752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017657	CG	3	6	55317	55322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017657	TA	3	6	56170	56175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017657	TA	3	6	56218	56223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017657	CT	3	6	56779	56784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017657	CA	3	6	57077	57082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017657	GT	3	6	57499	57504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017657	CA	3	6	57809	57814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017657	TA	4	8	57966	57973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017657	CT	3	6	57992	57997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017657	AT	3	6	59302	59307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017657	AT	3	6	59355	59360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017657	GA	3	6	64448	64453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017657	TG	3	6	65849	65854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.