MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_2

Total Repeats: 239

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017657	AAC	2	6	32	37	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017657	GGA	2	6	38	43	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017657	GGC	2	6	464	469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017657	GCC	2	6	473	478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017657	GCG	2	6	977	982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017657	CAC	2	6	1007	1012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017657	TTG	2	6	1021	1026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017657	CAG	2	6	1053	1058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017657	GGT	2	6	1071	1076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017657	GCA	2	6	1093	1098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017657	GCC	2	6	1129	1134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017657	TTC	3	9	1287	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017657	GCC	2	6	1460	1465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017657	CGT	2	6	1505	1510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017657	GCG	2	6	1512	1517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017657	GTT	2	6	1529	1534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017657	TGA	2	6	2134	2139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017657	TTG	2	6	2153	2158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017657	TAT	2	6	3109	3114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017657	TTC	2	6	3117	3122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017657	GTC	2	6	3134	3139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017657	TCA	2	6	3155	3160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017657	AGG	2	6	3212	3217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017657	AAT	2	6	5344	5349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017657	TGG	2	6	5381	5386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017657	CAC	2	6	5391	5396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017657	CAC	2	6	5403	5408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017657	ACA	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017657	GTA	2	6	5551	5556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017657	ATT	2	6	5578	5583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017657	TGC	2	6	5596	5601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017657	GCG	2	6	5604	5609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017657	GCT	2	6	5643	5648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017657	GAG	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017657	ATG	2	6	6660	6665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017657	TGA	2	6	6715	6720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017657	AGA	2	6	6737	6742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017657	TGA	2	6	6748	6753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017657	TTC	2	6	6754	6759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017657	ATC	2	6	6763	6768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017657	ATG	2	6	6777	6782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017657	ACT	2	6	6882	6887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017657	TAA	2	6	6898	6903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017657	ATC	2	6	6914	6919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017657	ATT	2	6	6945	6950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017657	TAA	2	6	6986	6991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017657	TAA	2	6	6997	7002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017657	ATT	2	6	7035	7040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017657	AGA	2	6	7062	7067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017657	AAG	2	6	7559	7564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017657	CGG	2	6	9288	9293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017657	GAT	2	6	11312	11317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017657	GAG	2	6	11920	11925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017657	ATT	2	6	11988	11993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017657	ATA	2	6	12001	12006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017657	TAT	2	6	12507	12512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017657	TTA	2	6	12924	12929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017657	AGC	2	6	12934	12939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017657	GAC	2	6	14170	14175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017657	GAG	2	6	14257	14262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017657	TAA	2	6	14307	14312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017657	TTA	2	6	14326	14331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017657	TTA	2	6	14333	14338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017657	TTA	2	6	14340	14345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017657	TTA	2	6	14347	14352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017657	TTA	2	6	14354	14359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017657	TTA	2	6	14361	14366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017657	TTA	2	6	14368	14373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017657	TTA	2	6	14375	14380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017657	TTA	2	6	14382	14387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017657	TTA	2	6	14389	14394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017657	AAG	2	6	14557	14562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017657	AGA	2	6	14610	14615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017657	TAT	2	6	14736	14741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017657	CCA	2	6	17462	17467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017657	TGC	2	6	20447	20452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017657	TTC	2	6	23100	23105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017657	GGA	2	6	26093	26098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017657	GGA	2	6	26135	26140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017657	GGC	2	6	26148	26153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017657	AGG	2	6	27798	27803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017657	TAA	2	6	28662	28667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017657	GGC	2	6	29300	29305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017657	AGA	2	6	29741	29746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017657	GCT	2	6	29748	29753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017657	TGG	2	6	29809	29814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017657	TTG	2	6	29871	29876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017657	CAG	2	6	29877	29882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017657	GAT	2	6	29891	29896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017657	CTG	2	6	29995	30000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017657	GCA	2	6	30059	30064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017657	ACA	2	6	30122	30127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017657	GTA	2	6	30199	30204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017657	GAG	2	6	30236	30241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017657	CGT	2	6	30554	30559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017657	CCT	2	6	30632	30637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017657	AAT	2	6	30641	30646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017657	CAC	2	6	30704	30709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017657	GCC	2	6	30866	30871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017657	ACT	2	6	30923	30928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017657	GCG	2	6	31005	31010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017657	ACA	2	6	31036	31041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017657	ACC	2	6	31052	31057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017657	CTC	2	6	31100	31105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017657	TGT	2	6	31169	31174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017657	CAT	2	6	31185	31190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017657	TCG	2	6	31288	31293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017657	AAT	2	6	32100	32105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017657	GAA	2	6	32189	32194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017657	CCG	2	6	32195	32200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017657	ATG	2	6	33513	33518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017657	ATT	2	6	33521	33526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017657	TGA	2	6	33717	33722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017657	TGG	2	6	33728	33733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017657	ATG	2	6	33773	33778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017657	TAA	2	6	34415	34420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017657	TAA	2	6	34471	34476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017657	TGT	2	6	34589	34594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017657	AGA	3	9	34633	34641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017657	TGT	2	6	36130	36135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017657	TGC	2	6	36186	36191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017657	CAG	2	6	36200	36205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017657	ATC	2	6	36251	36256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017657	TAA	2	6	36282	36287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017657	ACA	2	6	38650	38655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017657	ATA	3	9	38669	38677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017657	CAT	2	6	38707	38712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017657	CTC	2	6	38806	38811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017657	GGC	2	6	38827	38832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017657	TGG	2	6	38956	38961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017657	ATT	2	6	38973	38978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017657	TGG	2	6	39030	39035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017657	CTG	2	6	39051	39056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017657	CCA	2	6	39057	39062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017657	GAT	2	6	39066	39071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017657	ACC	2	6	39198	39203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017657	CTT	2	6	39208	39213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017657	TGC	2	6	39235	39240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017657	ACG	2	6	39363	39368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017657	CAG	3	9	39413	39421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017657	TCC	2	6	39507	39512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_017657	GAC	2	6	39514	39519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.