MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 chromosome

Total Repeats: 15174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017656	ATT	2	6	505642	505647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017656	GTG	2	6	505712	505717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017656	ACA	2	6	505844	505849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_017656	AATAA	2	10	505948	505957	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017656	TGG	2	6	505973	505978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017656	AG	3	6	505998	506003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017656	CCG	2	6	506012	506017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_017656	TGC	2	6	506021	506026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_017656	AATT	2	8	506111	506118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017656	CCG	2	6	506165	506170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_017656	A	6	6	506179	506184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017656	TTG	2	6	506252	506257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017656	CGT	2	6	506258	506263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_017656	ATTACG	2	12	506309	506320	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1515	NC_017656	CTGG	2	8	506322	506329	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_017656	ATAA	2	8	506356	506363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017656	CAA	2	6	506413	506418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_017656	ATA	2	6	506558	506563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017656	AAAATA	2	12	506567	506578	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017656	AGA	2	6	506634	506639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017656	ATG	2	6	506711	506716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017656	ATT	2	6	506751	506756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017656	ATG	2	6	506803	506808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017656	AAG	2	6	506819	506824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017656	TGAT	2	8	506858	506865	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017656	GTT	2	6	506872	506877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017656	AAT	2	6	506893	506898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017656	ATT	2	6	506955	506960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017656	ATA	2	6	506963	506968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017656	CAA	2	6	506991	506996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_017656	GCTG	2	8	507033	507040	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1532	NC_017656	CGA	2	6	507131	507136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_017656	GAT	2	6	507151	507156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017656	TGG	2	6	507160	507165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017656	CGG	2	6	508947	508952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_017656	TATTGA	2	12	508988	508999	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017656	A	7	7	508999	509005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017656	CAT	2	6	509947	509952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_017656	CGC	2	6	510029	510034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_017656	ACC	2	6	511255	511260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_017656	CTG	2	6	511369	511374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_017656	T	6	6	515782	515787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017656	CGA	2	6	515823	515828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_017656	TATT	2	8	515889	515896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017656	ACA	2	6	515897	515902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_017656	AGCC	2	8	517983	517990	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_017656	T	6	6	518052	518057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017656	TGGT	2	8	518105	518112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017656	TA	3	6	518126	518131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017656	CCT	2	6	518149	518154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_017656	ACTG	2	8	518203	518210	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1552	NC_017656	TTC	2	6	518237	518242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_017656	ATC	2	6	518296	518301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_017656	ACA	2	6	518331	518336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_017656	T	6	6	519726	519731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017656	AGG	2	6	521154	521159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_017656	TCC	3	9	521199	521207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_017656	GAT	2	6	521223	521228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017656	TCA	2	6	521269	521274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_017656	CGT	2	6	523123	523128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_017656	A	6	6	523158	523163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017656	GCT	2	6	523164	523169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_017656	CGAT	2	8	523204	523211	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1564	NC_017656	ATG	2	6	523239	523244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017656	ACA	2	6	523251	523256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_017656	A	7	7	530917	530923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017656	T	8	8	530946	530953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017656	TAT	2	6	533140	533145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017656	GTTTC	2	10	533170	533179	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1570	NC_017656	AC	3	6	533219	533224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_017656	CGGG	2	8	533228	533235	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_017656	TTG	2	6	533256	533261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017656	ATG	2	6	533306	533311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017656	GTC	2	6	533897	533902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_017656	TCG	2	6	533909	533914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_017656	AGC	2	6	533941	533946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_017656	TGT	2	6	533985	533990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_017656	ACC	2	6	534024	534029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_017656	AGC	2	6	535621	535626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_017656	C	6	6	535652	535657	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1581	NC_017656	GAAG	2	8	535679	535686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017656	CTTTT	2	10	536646	536655	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1583	NC_017656	T	6	6	536652	536657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017656	CTG	2	6	536660	536665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_017656	ACC	2	6	538181	538186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_017656	GCG	2	6	538267	538272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_017656	AAT	2	6	541120	541125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017656	GGAGT	2	10	541141	541150	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017656	AATG	2	8	544185	544192	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017656	GCA	2	6	544276	544281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_017656	GCT	2	6	544332	544337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_017656	GCC	2	6	544384	544389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_017656	TCC	2	6	547360	547365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_017656	TAT	2	6	547486	547491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_017656	TAG	2	6	548097	548102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_017656	GCA	2	6	548119	548124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_017656	ACC	2	6	549509	549514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1598	NC_017656	T	6	6	549572	549577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017656	A	6	6	549616	549621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_017656	AG	3	6	549644	549649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_017656	CCG	2	6	550549	550554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_017656	TTC	2	6	553488	553493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_017656	TGG	2	6	554477	554482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017656	GT	3	6	554491	554496	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017656	AAG	2	6	554602	554607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017656	AGA	2	6	554644	554649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_017656	ATT	2	6	554692	554697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017656	AAT	2	6	554703	554708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017656	TGG	2	6	554728	554733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017656	AAT	2	6	554795	554800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017656	TAA	2	6	554835	554840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017656	TTTA	2	8	554853	554860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017656	TAA	2	6	554865	554870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017656	TAC	2	6	554885	554890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_017656	ATA	2	6	554897	554902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017656	CAT	2	6	557056	557061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_017656	TCA	2	6	557104	557109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_017656	AAT	2	6	557119	557124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017656	TGT	2	6	557227	557232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017656	GATG	2	8	557275	557282	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017656	GGA	2	6	557299	557304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017656	GAT	2	6	557855	557860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017656	TGAT	2	8	557878	557885	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017656	CAA	2	6	557913	557918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_017656	T	6	6	557957	557962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017656	GCA	2	6	559278	559283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_017656	GGT	2	6	559321	559326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017656	T	8	8	559331	559338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017656	AAC	2	6	559390	559395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_017656	CAG	2	6	559483	559488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_017656	T	6	6	559490	559495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017656	CGT	3	9	560223	560231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_017656	AGA	2	6	560250	560255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1635	NC_017656	AG	4	8	561717	561724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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