MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 plasmid pCE10A

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017647	GTA	2	6	783	788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017647	GAG	2	6	820	825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017647	CTT	2	6	1101	1106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017647	CGA	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017647	AGA	2	6	1257	1262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017647	CAA	2	6	1292	1297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017647	CTT	2	6	1344	1349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017647	CCT	2	6	2255	2260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017647	AAT	2	6	2264	2269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017647	GGA	2	6	2282	2287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017647	CAC	2	6	2327	2332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017647	TCA	2	6	2348	2353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017647	ACT	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017647	CTC	2	6	2724	2729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017647	TGT	2	6	2793	2798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017647	TCG	2	6	2912	2917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017647	CGG	2	6	3032	3037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017647	GGT	2	6	3187	3192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017647	GGT	2	6	3260	3265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017647	ATC	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017647	TGA	2	6	4396	4401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017647	TCA	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017647	TCA	2	6	4514	4519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017647	AAT	2	6	4624	4629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017647	TGC	2	6	5401	5406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017647	TTA	2	6	5424	5429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017647	AAT	2	6	6364	6369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017647	TCA	2	6	6481	6486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017647	TGA	2	6	6492	6497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017647	GTC	2	6	6516	6521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017647	ATA	2	6	6572	6577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017647	GTT	2	6	8563	8568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017647	AGG	2	6	9138	9143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017647	CCG	2	6	9200	9205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017647	ACG	2	6	14179	14184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017647	TCT	2	6	14714	14719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017647	AAC	2	6	14790	14795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017647	CCA	2	6	15564	15569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017647	ATG	2	6	16603	16608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017647	GCT	2	6	18887	18892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017647	AAT	2	6	18945	18950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017647	ACT	2	6	19043	19048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017647	AAT	2	6	19050	19055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017647	ATT	2	6	19136	19141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017647	GCG	2	6	19210	19215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017647	TAA	2	6	22840	22845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017647	CAA	2	6	24741	24746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017647	GAA	2	6	24933	24938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017647	ATT	2	6	26009	26014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017647	ACC	2	6	26085	26090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017647	TAA	2	6	26182	26187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017647	CAA	2	6	26210	26215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017647	CTG	2	6	26342	26347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017647	AAT	2	6	26441	26446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017647	AGC	2	6	26451	26456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017647	TAA	2	6	26491	26496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017647	ATT	2	6	26509	26514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017647	AAG	2	6	26520	26525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017647	TAT	2	6	26599	26604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017647	ATA	2	6	26614	26619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017647	GAA	2	6	26676	26681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017647	AAC	2	6	26926	26931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017647	TAA	2	6	27007	27012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017647	CAT	2	6	27556	27561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017647	CGT	2	6	28712	28717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017647	TCA	2	6	31403	31408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017647	TTA	2	6	33429	33434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017647	TGA	2	6	34180	34185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017647	AGG	2	6	34247	34252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017647	CAG	2	6	34341	34346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017647	GGT	2	6	34402	34407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017647	GTT	2	6	34430	34435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017647	TAT	2	6	34439	34444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017647	AAC	2	6	34469	34474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017647	CTA	2	6	34548	34553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017647	ATA	2	6	34622	34627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017647	CAT	2	6	34745	34750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017647	ATA	2	6	34996	35001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017647	TTA	2	6	35058	35063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017647	TAT	2	6	35112	35117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017647	TCT	2	6	35159	35164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017647	ATT	2	6	35437	35442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017647	GGT	2	6	35524	35529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017647	TCA	2	6	35595	35600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017647	AAT	2	6	35621	35626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017647	TTA	2	6	36968	36973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017647	CTC	2	6	36989	36994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017647	ATT	2	6	37051	37056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017647	TCG	2	6	37087	37092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017647	ATA	2	6	37095	37100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017647	AGA	2	6	37117	37122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017647	TTA	2	6	37223	37228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017647	TGT	2	6	37241	37246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017647	GCC	2	6	37253	37258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017647	AAT	2	6	37468	37473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017647	GCA	2	6	38470	38475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017647	GAC	2	6	39540	39545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017647	TGC	2	6	40435	40440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017647	GGA	2	6	40442	40447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017647	TGA	2	6	40538	40543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017647	CTG	2	6	40550	40555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017647	TCC	2	6	41418	41423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017647	CAG	2	6	41453	41458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017647	GCC	2	6	41463	41468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017647	CTC	2	6	41549	41554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017647	TTC	2	6	41799	41804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017647	GTT	2	6	41907	41912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017647	TAA	2	6	41930	41935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017647	CCT	2	6	42048	42053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017647	TAT	2	6	42109	42114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017647	CAG	2	6	42283	42288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017647	AAT	3	9	42290	42298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017647	AAG	2	6	42365	42370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017647	ATG	2	6	42375	42380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017647	TAA	2	6	42427	42432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017647	ATA	2	6	42536	42541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017647	CAA	2	6	42542	42547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017647	ATT	2	6	42671	42676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017647	GCG	2	6	42778	42783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017647	AAT	2	6	42846	42851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017647	TTC	2	6	43000	43005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017647	TTG	3	9	43182	43190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017647	AAT	2	6	43232	43237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017647	CAA	2	6	43248	43253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017647	TTC	2	6	43257	43262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017647	TAA	2	6	43268	43273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017647	CGC	2	6	43309	43314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_017647	TGT	2	6	43376	43381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017647	ATG	2	6	43431	43436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017647	CAT	2	6	43634	43639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017647	AAT	2	6	43640	43645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017647	TAA	2	6	45147	45152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017647	ATG	2	6	46107	46112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017647	TAA	2	6	46192	46197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017647	ATA	2	6	46198	46203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017647	ATG	2	6	46228	46233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017647	CGC	2	6	49005	49010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017647	TAA	2	6	50087	50092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017647	ACA	2	6	50093	50098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017647	AGT	2	6	51027	51032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017647	GGA	2	6	51044	51049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017647	CCT	2	6	51643	51648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_017647	AGG	2	6	51658	51663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017647	CTT	2	6	53002	53007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017647	AGA	2	6	53019	53024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.