MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 chromosome

Total Repeats: 173

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017646	GAAAAT	2	12	10498	10509	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017646	TTTCAC	2	12	23408	23419	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017646	TTGGGA	2	12	54837	54848	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017646	CGCTGG	2	12	54979	54990	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017646	AAGGGA	2	12	93127	93138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017646	ATTGTT	2	12	156336	156347	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017646	GTAGTG	2	12	209207	209218	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017646	GATGCT	2	12	286073	286084	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017646	TTGGTG	2	12	290049	290060	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017646	CTGACA	2	12	291269	291280	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017646	GGTGAA	2	12	292465	292476	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017646	TTTTCT	2	12	298348	298359	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017646	CTATTT	2	12	299385	299396	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017646	TGTCTG	2	12	309869	309880	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017646	TGAGGT	2	12	310062	310073	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017646	TTTATT	2	12	327001	327012	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017646	TTTTTA	2	12	380706	380717	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017646	TATTGA	2	12	389108	389119	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017646	TTTTCA	2	12	457404	457415	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017646	CAGGCG	2	12	476245	476256	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017646	CAGGAA	2	12	530125	530136	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017646	GATTTT	2	12	571809	571820	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017646	AATATG	2	12	604957	604968	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017646	TGCAAA	2	12	633189	633200	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017646	CAAATT	2	12	706100	706111	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017646	ATTTTT	2	12	718185	718196	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017646	AATCAG	2	12	782508	782519	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017646	TTTTCT	2	12	814563	814574	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017646	TTCCAT	2	12	820375	820386	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017646	GTTGGT	2	12	838268	838279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017646	CAGAAA	2	12	868428	868439	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017646	TAACCG	2	12	962867	962878	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017646	AAATAA	2	12	994954	994965	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017646	CTGGAA	2	12	1005956	1005967	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017646	AAAGAT	2	12	1028734	1028745	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017646	TAAGGA	2	12	1071501	1071512	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017646	ATAATG	2	12	1072916	1072927	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017646	ATTTAT	2	12	1096489	1096500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017646	TGAAAT	2	12	1106028	1106039	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017646	CAAAAA	2	12	1192301	1192312	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017646	GCTTGA	2	12	1281815	1281826	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017646	AAAATG	2	12	1339652	1339663	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017646	TTTTGT	2	12	1352225	1352236	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017646	GAATAA	2	12	1355851	1355862	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017646	GAATAA	2	12	1355909	1355920	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017646	ATCGTA	2	12	1360114	1360125	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017646	ACGCTT	2	12	1374812	1374823	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017646	CAGGCT	2	12	1378115	1378126	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017646	CTTATT	2	12	1431675	1431686	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017646	CAAAAG	2	12	1439008	1439019	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017646	CGGGGG	2	12	1447227	1447238	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017646	CTGATC	2	12	1449486	1449497	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017646	TGCGCG	2	12	1456968	1456979	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017646	ATCATT	2	12	1476531	1476542	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017646	AAAGTT	2	12	1502052	1502063	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017646	CTATAA	2	12	1552785	1552796	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017646	GAAGGC	2	12	1559213	1559224	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017646	AATTTG	2	12	1671711	1671722	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017646	AAAAAC	2	12	1702436	1702447	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017646	CCAGCG	2	12	1711318	1711329	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017646	ACCGTT	2	12	1717311	1717322	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017646	TGGTTA	2	12	1726143	1726154	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017646	TGCCTG	2	12	1741896	1741907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017646	GATATA	2	12	1741990	1742001	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017646	CAAAAA	2	12	1810006	1810017	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017646	TTAAAT	2	12	1811805	1811816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017646	ATACTT	2	12	1957573	1957584	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017646	AAAATA	2	12	1971232	1971243	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017646	TGTTTT	2	12	1971865	1971876	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017646	AAGACT	2	12	1972125	1972136	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017646	TATTAC	2	12	2090624	2090635	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017646	TTTCTT	2	12	2108857	2108868	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017646	AATTTC	2	12	2112765	2112776	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017646	ATCAAC	2	12	2149730	2149741	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017646	ACTGTC	2	12	2156451	2156462	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017646	AATTCA	2	12	2203749	2203760	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017646	TCTTAT	2	12	2217557	2217568	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017646	CTGATA	2	12	2308506	2308517	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017646	GAAAAC	2	12	2326484	2326495	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017646	CTCCGC	2	12	2368980	2368991	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017646	TTTTGT	2	12	2387253	2387264	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017646	CAGTGC	2	12	2501550	2501561	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017646	CCTGTT	2	12	2519893	2519904	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017646	CCAGCG	2	12	2550470	2550481	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017646	GCTGAT	2	12	2550756	2550767	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017646	CGCGAT	2	12	2551663	2551674	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017646	GCGCCA	2	12	2562745	2562756	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017646	TCTTCC	2	12	2569217	2569228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017646	GCAGAA	2	12	2672516	2672527	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017646	TAAATG	2	12	2716073	2716084	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017646	TGTCAC	2	12	2729707	2729718	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017646	AGCGGA	2	12	2735828	2735839	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017646	AGAAAA	2	12	2742971	2742982	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017646	CTGAGC	2	12	2783951	2783962	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017646	GTTTTT	2	12	2786676	2786687	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017646	AATATT	2	12	2789783	2789794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017646	CTGATG	2	12	2808690	2808701	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017646	CAAGTG	2	12	2848033	2848044	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017646	AACCGG	2	12	2921573	2921584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017646	AATGAT	2	12	2937161	2937172	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017646	ATAACC	2	12	2940810	2940821	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017646	AAAAAC	2	12	2980317	2980328	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017646	TCCTTC	2	12	3000390	3000401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017646	TGAGCG	2	12	3039868	3039879	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017646	TGGACA	2	12	3049876	3049887	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017646	CAGTTT	2	12	3064482	3064493	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017646	TTTTAC	2	12	3134941	3134952	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017646	ATTTTT	2	12	3135627	3135638	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017646	TTTGTT	2	12	3299584	3299595	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017646	ATTAGA	2	12	3347810	3347821	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017646	ATGGAA	2	12	3353749	3353760	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017646	AAACTT	2	12	3354293	3354304	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017646	ATTCTC	2	12	3365579	3365590	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017646	ATCGCG	2	12	3409979	3409990	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017646	GTAAGG	2	12	3424653	3424664	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017646	ACTGAG	2	12	3453584	3453595	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017646	TTTTGT	2	12	3491630	3491641	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017646	TTAACA	2	12	3493623	3493634	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017646	ACTGTC	2	12	3493824	3493835	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017646	ATAAAA	2	12	3494712	3494723	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017646	TATTGT	2	12	3503758	3503769	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017646	TTTTCG	2	12	3576505	3576516	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017646	AGTTGT	2	12	3666135	3666146	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017646	AATGAT	2	12	3673085	3673096	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017646	GTAACC	2	12	3727287	3727298	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017646	AGACAA	2	12	3728907	3728918	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017646	TGCATT	2	12	3737640	3737651	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017646	TTTTAT	2	12	3739537	3739548	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017646	AAGCGA	2	12	3744936	3744947	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017646	CTTTCT	2	12	3768805	3768816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017646	GTGCAG	2	12	3876340	3876351	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017646	TGCGTC	2	12	3878902	3878913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017646	AGCGTT	2	12	3879324	3879335	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017646	CCTTTC	2	12	3899335	3899346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017646	CGTCAC	2	12	3925208	3925219	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017646	GCTGAT	2	12	3945324	3945335	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_017646	AATTTA	2	12	3987481	3987492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017646	AGATGC	2	12	4103266	4103277	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_017646	TGAAAA	2	12	4127156	4127167	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017646	TTTATC	2	12	4232941	4232952	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_017646	TATCAA	2	12	4233515	4233526	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_017646	ATTTAT	2	12	4308592	4308603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017646	GATAGC	2	12	4308649	4308660	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_017646	GCAGAA	2	12	4317031	4317042	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_017646	CGTCAC	2	12	4355057	4355068	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017646	TTTCTC	2	12	4355091	4355102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017646	TCTGGC	2	12	4371460	4371471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017646	TGCGAT	2	12	4443472	4443483	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_017646	AAGAAA	2	12	4451416	4451427	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017646	CTTTTT	2	12	4487735	4487746	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_017646	AGTCTC	2	12	4570472	4570483	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_017646	AATGTG	2	12	4571342	4571353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017646	TATGAC	2	12	4571432	4571443	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_017646	GCGTAA	2	12	4623082	4623093	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_017646	TCATTT	2	12	4800232	4800243	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_017646	GTGAAG	2	12	4831631	4831642	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017646	ATTAAT	2	12	4835226	4835237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017646	GTCTTT	2	12	4879896	4879907	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_017646	AATATC	2	12	4904296	4904307	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_017646	TCTCCC	2	12	4917753	4917764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_017646	GGGAGA	2	12	4923078	4923089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017646	CTGATA	2	12	4939975	4939986	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_017646	TTTTTA	2	12	5011614	5011625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017646	TTTAAT	2	12	5043563	5043574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017646	CATACG	2	12	5076400	5076411	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_017646	ATGGAA	2	12	5129235	5129246	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017646	TGCCAG	2	12	5167577	5167588	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_017646	AACAGG	2	12	5177254	5177265	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
169	NC_017646	CGGTTG	2	12	5194427	5194438	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
170	NC_017646	ATGCCA	2	12	5195195	5195206	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_017646	GTGATT	2	12	5204234	5204245	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017646	ATTGAG	2	12	5237426	5237437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017646	GACAGA	2	12	5270062	5270073	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.