MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 chromosome

Total Repeats: 546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017646	GAATT	2	10	15812	15821	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017646	AATGT	2	10	18341	18350	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017646	TTCTT	2	10	18402	18411	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017646	CTCAT	2	10	19810	19819	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017646	GTTTT	2	10	23107	23116	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017646	TTTAT	2	10	24163	24172	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017646	TTAAT	2	10	28579	28588	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017646	GATGC	2	10	42911	42920	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017646	TGGCG	2	10	54131	54140	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017646	AATCC	2	10	58994	59003	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017646	TAGTG	2	10	84623	84632	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017646	ATTTT	2	10	87348	87357	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017646	GGGAG	2	10	87512	87521	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017646	CGCCA	2	10	87576	87585	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_017646	GGCAT	2	10	150401	150410	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017646	GTAAG	2	10	151165	151174	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017646	TCCTC	2	10	152885	152894	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_017646	TGTGG	2	10	160519	160528	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017646	AAATT	2	10	167114	167123	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017646	TTATC	2	10	177375	177384	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017646	TACGT	2	10	192257	192266	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017646	TGGCC	2	10	193947	193956	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017646	GTCTG	2	10	201660	201669	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017646	CGGTT	2	10	233439	233448	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017646	CCTTT	2	10	255309	255318	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017646	AATGG	2	10	260185	260194	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017646	ACATT	2	10	271605	271614	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017646	TGTGT	2	10	280469	280478	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017646	TTGAT	2	10	282468	282477	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017646	GCGTG	2	10	289521	289530	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017646	AGATC	2	10	290962	290971	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017646	CAAAA	2	10	298372	298381	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017646	AAAAT	2	10	303454	303463	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017646	CGCTT	2	10	327980	327989	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017646	TGAAC	2	10	332495	332504	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017646	GGCTG	2	10	339936	339945	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017646	TTGCG	2	10	348678	348687	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017646	AACAA	2	10	350808	350817	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017646	CTTCT	2	10	378354	378363	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_017646	GTTTC	2	10	413148	413157	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017646	CTTTT	2	10	418371	418380	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017646	GGAGT	2	10	420943	420952	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017646	TAGTG	2	10	429336	429345	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017646	GAAGA	2	10	446355	446364	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017646	TGAGT	2	10	460127	460136	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017646	CAGGT	2	10	461414	461423	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017646	TTTTC	2	10	481991	482000	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017646	TCAGG	2	10	489704	489713	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017646	TATTT	2	10	540916	540925	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017646	GATGC	2	10	554620	554629	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017646	GATGC	2	10	554720	554729	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017646	GTTTC	2	10	561109	561118	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017646	TTGGG	2	10	570310	570319	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017646	AAATA	2	10	570385	570394	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017646	CTGGT	2	10	570589	570598	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017646	GTGGA	2	10	599916	599925	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017646	AATAG	2	10	601598	601607	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017646	GTCAG	2	10	629909	629918	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017646	ATTTA	2	10	638630	638639	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017646	GTTAA	2	10	650125	650134	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017646	ATAGC	2	10	658009	658018	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017646	TGCTA	2	10	675337	675346	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017646	ATTTG	2	10	676778	676787	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017646	TCAAT	2	10	679083	679092	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017646	GGAAC	2	10	680272	680281	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017646	CGTAA	2	10	681480	681489	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017646	GCATA	2	10	693675	693684	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017646	AGCAA	2	10	693782	693791	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017646	GTGTT	2	10	698730	698739	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017646	ACAGG	2	10	707153	707162	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017646	CAGGG	2	10	712843	712852	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017646	TCGCG	2	10	718122	718131	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017646	GGCGG	2	10	726670	726679	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017646	ATTTA	2	10	730726	730735	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017646	AATTA	2	10	769579	769588	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017646	ATAAC	2	10	791050	791059	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017646	CTAAT	2	10	791140	791149	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017646	GTCGT	2	10	800607	800616	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017646	AAAAT	2	10	824637	824646	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017646	TCCAT	2	10	826539	826548	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_017646	AAAAC	2	10	826585	826594	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017646	CAACG	2	10	836352	836361	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_017646	GATAA	2	10	839346	839355	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017646	ACATA	2	10	871765	871774	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017646	GATGC	2	10	876942	876951	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017646	CAAAA	2	10	883541	883550	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017646	TATAT	2	10	888275	888284	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017646	CAGGG	2	10	914332	914341	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017646	AGTAA	2	10	926192	926201	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017646	GCATT	2	10	955067	955076	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017646	TCGCT	2	10	965951	965960	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_017646	GCAAC	2	10	997972	997981	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017646	TTCAC	2	10	1013380	1013389	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017646	TTGTT	2	10	1039130	1039139	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017646	AGCGA	2	10	1047488	1047497	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017646	TAGGG	2	10	1047524	1047533	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017646	ATGAC	2	10	1049228	1049237	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017646	TTTTC	2	10	1057120	1057129	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017646	TTATT	2	10	1057930	1057939	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017646	TTATG	2	10	1062568	1062577	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017646	CTTAT	2	10	1073072	1073081	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017646	TAAAA	2	10	1083669	1083678	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017646	AAAAC	2	10	1090173	1090182	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017646	CAGTG	2	10	1095141	1095150	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017646	TTGCA	2	10	1096007	1096016	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017646	AAATC	2	10	1100584	1100593	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017646	AGGGG	2	10	1109563	1109572	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017646	ACAGC	2	10	1143185	1143194	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_017646	GATCG	2	10	1180350	1180359	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017646	GTCAT	2	10	1191768	1191777	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017646	TGCAG	2	10	1200471	1200480	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017646	TCTGC	2	10	1205728	1205737	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_017646	GTCGC	2	10	1216309	1216318	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_017646	CAAAA	2	10	1263008	1263017	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017646	CATCA	2	10	1267157	1267166	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017646	TGCAG	2	10	1274714	1274723	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017646	GGGGA	2	10	1276989	1276998	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017646	CGATG	2	10	1292128	1292137	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017646	GATTC	2	10	1293252	1293261	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017646	GTTAC	2	10	1321952	1321961	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017646	GTGGA	2	10	1332333	1332342	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017646	CATGA	2	10	1342433	1342442	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017646	CAAAT	2	10	1346587	1346596	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017646	ATTCC	2	10	1346598	1346607	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017646	ATTTT	2	10	1356082	1356091	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017646	GTTTT	2	10	1359896	1359905	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017646	TATAA	2	10	1360301	1360310	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017646	TTCTA	2	10	1363355	1363364	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017646	CCTTA	2	10	1369410	1369419	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_017646	GCATC	2	10	1378139	1378148	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_017646	ATAAA	2	10	1389492	1389501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017646	GAAAA	2	10	1394878	1394887	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017646	CTTCA	2	10	1410100	1410109	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_017646	CTTCA	2	10	1410636	1410645	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_017646	TTATC	2	10	1417954	1417963	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017646	ATATT	2	10	1419506	1419515	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017646	ACCGT	2	10	1427908	1427917	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017646	GTTTC	2	10	1455469	1455478	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017646	GTTCC	2	10	1455527	1455536	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_017646	CCAGA	2	10	1455847	1455856	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_017646	ATCGG	2	10	1456777	1456786	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017646	AGGGC	2	10	1456867	1456876	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017646	CAGTA	2	10	1467261	1467270	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017646	GTTCT	2	10	1475038	1475047	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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284	NC_017646	CATGC	2	10	2830455	2830464	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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465	NC_017646	ATATA	2	10	4456513	4456522	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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478	NC_017646	CCTGA	2	10	4673296	4673305	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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487	NC_017646	TGCTA	2	10	4732706	4732715	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
488	NC_017646	CTTTG	2	10	4735161	4735170	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_017646	TTGAA	2	10	4912859	4912868	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

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